Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165YCJ3

Protein Details
Accession A0A165YCJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-296LPAQGSASPRPRPRPRRKNQDLAMPHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-288PRPRPRPRRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cysk 10, cyto_nucl 9.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSASIKSESPSDAEDGDVSGDLIAGFSAVSLGESDLRPLCPFCDEILPETPSQELRALIETVSSTADPRPGNRNGRKAPLMTYISICQRHRWESKDLPMAVARGWPQEIDFATLPDRVASFSDEISAIMENPWTSSFFVKCAELLISSAKSRAKRLGSTMALTRMMQPGYYGGRGYVIIRNIVRQCHTVDNAQLKEIAPLSADQFQESVLMPEIAKRLIMQDMTVKDEAAAEILRQSIEYGSIMFPDLEDDPVLAEVLRRVPTRGSANRDLPAQGSASPRPRPRPRRKNQDLAMPH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.14
4 0.11
5 0.1
6 0.07
7 0.07
8 0.06
9 0.05
10 0.05
11 0.04
12 0.03
13 0.03
14 0.03
15 0.03
16 0.03
17 0.04
18 0.05
19 0.08
20 0.08
21 0.11
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.2
31 0.2
32 0.23
33 0.28
34 0.29
35 0.27
36 0.26
37 0.26
38 0.2
39 0.21
40 0.18
41 0.14
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.14
54 0.14
55 0.17
56 0.23
57 0.3
58 0.4
59 0.46
60 0.55
61 0.55
62 0.61
63 0.61
64 0.56
65 0.52
66 0.49
67 0.45
68 0.36
69 0.34
70 0.3
71 0.32
72 0.37
73 0.34
74 0.32
75 0.33
76 0.39
77 0.42
78 0.43
79 0.45
80 0.45
81 0.52
82 0.54
83 0.5
84 0.45
85 0.41
86 0.37
87 0.3
88 0.26
89 0.19
90 0.13
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.11
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.2
140 0.21
141 0.21
142 0.24
143 0.29
144 0.27
145 0.28
146 0.28
147 0.25
148 0.23
149 0.22
150 0.2
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.1
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.13
166 0.13
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.21
171 0.19
172 0.21
173 0.22
174 0.24
175 0.21
176 0.24
177 0.29
178 0.28
179 0.27
180 0.25
181 0.22
182 0.21
183 0.2
184 0.15
185 0.09
186 0.09
187 0.11
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.15
209 0.16
210 0.21
211 0.21
212 0.19
213 0.17
214 0.17
215 0.16
216 0.12
217 0.11
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.11
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.19
249 0.25
250 0.34
251 0.39
252 0.43
253 0.47
254 0.51
255 0.52
256 0.53
257 0.48
258 0.4
259 0.34
260 0.28
261 0.23
262 0.24
263 0.28
264 0.33
265 0.4
266 0.47
267 0.56
268 0.65
269 0.73
270 0.8
271 0.84
272 0.88
273 0.91
274 0.93
275 0.94
276 0.89