Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165XB60

Protein Details
Accession A0A165XB60    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-116GQENQRFGRERKKRPPKGPEIFVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-110QRFGRERKKRPPKG
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 7.5, cyto_nucl 6.333, cyto 4, cysk 4, cyto_pero 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR013970  Rfa2  
Gene Ontology GO:0031981  C:nuclear lumen  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08661  Rep_fac-A_3  
Amino Acid Sequences MSRMRRQDIMTHITGARGGLISMQHVEKLTIGSRLAKVKDSMRHKLYTPSSPLGFRYRESLKPVPWTRDRGGHRNTMKERLGRSPPETRRLTGQENQRFGRERKKRPPKGPEIFVQGEGELTEVDSLILGEPKHGEDVCGITGKSYSDEIGHGRGEGNTRVERAANLDSFGGVGGEQKAVGKTKPPDNSGQPPAYIGWPLMSPRNVQGDGAMNASLDRGASDSIGRWIFADAADGWMTSSTSPSQTHRQSHIPMSTILDDSQDARIVGEMMPSYIGKRVRVVGEILSVVANGKESAIIRGADGIEIEILLGEEMYVNERIVEVVGMVQTATSLKLSKYKCMGDDLDLLIVVDKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.28
3 0.21
4 0.14
5 0.12
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.14
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.2
20 0.23
21 0.29
22 0.3
23 0.31
24 0.33
25 0.37
26 0.44
27 0.48
28 0.53
29 0.52
30 0.53
31 0.52
32 0.57
33 0.56
34 0.55
35 0.53
36 0.49
37 0.46
38 0.45
39 0.47
40 0.44
41 0.41
42 0.34
43 0.34
44 0.34
45 0.36
46 0.42
47 0.44
48 0.41
49 0.49
50 0.54
51 0.56
52 0.57
53 0.59
54 0.55
55 0.58
56 0.61
57 0.6
58 0.59
59 0.6
60 0.59
61 0.62
62 0.63
63 0.62
64 0.61
65 0.56
66 0.55
67 0.53
68 0.56
69 0.51
70 0.53
71 0.55
72 0.55
73 0.59
74 0.59
75 0.52
76 0.52
77 0.52
78 0.52
79 0.48
80 0.53
81 0.52
82 0.55
83 0.55
84 0.52
85 0.53
86 0.49
87 0.54
88 0.54
89 0.56
90 0.62
91 0.72
92 0.77
93 0.82
94 0.89
95 0.89
96 0.88
97 0.82
98 0.76
99 0.72
100 0.64
101 0.55
102 0.45
103 0.34
104 0.25
105 0.2
106 0.16
107 0.08
108 0.06
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.06
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.11
169 0.14
170 0.2
171 0.24
172 0.27
173 0.3
174 0.34
175 0.4
176 0.41
177 0.38
178 0.32
179 0.29
180 0.27
181 0.24
182 0.19
183 0.12
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.13
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.14
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.11
230 0.15
231 0.23
232 0.29
233 0.34
234 0.37
235 0.42
236 0.43
237 0.47
238 0.46
239 0.4
240 0.34
241 0.32
242 0.29
243 0.25
244 0.21
245 0.16
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.13
262 0.15
263 0.14
264 0.17
265 0.2
266 0.21
267 0.22
268 0.23
269 0.19
270 0.19
271 0.18
272 0.16
273 0.13
274 0.11
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.13
287 0.14
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.1
321 0.18
322 0.21
323 0.28
324 0.34
325 0.37
326 0.38
327 0.43
328 0.44
329 0.4
330 0.43
331 0.37
332 0.32
333 0.27
334 0.25