Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5RVV2

Protein Details
Accession J5RVV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-150YSYRRNTQEKHDKRIHKKDLABasic
167-188CIPQFIYKVKNQKKKFKMEFRGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024145  His_deAcase_SAP30/SAP30L  
IPR038291  SAP30_C_sf  
IPR025718  SAP30_Sin3-bd  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF13867  SAP30_Sin3_bdg  
Amino Acid Sequences MDSRGRTSQSGGYAHSNNNNNNNNNNNNNSNSNNNNINSSSNNGNGPVSNGRANGKQRLTAAQQQYIKNLIETHITDNHPDLRPKSHPMDFEEYTDAFLRRYKDHFQLDVPDSLTLQGYLLGSELGAKTYSYRRNTQEKHDKRIHKKDLANVVRRHFDEHSIKETDCIPQFIYKVKNQKKKFKMEFRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.41
3 0.43
4 0.42
5 0.5
6 0.54
7 0.51
8 0.54
9 0.57
10 0.57
11 0.56
12 0.56
13 0.51
14 0.47
15 0.48
16 0.45
17 0.45
18 0.4
19 0.4
20 0.4
21 0.37
22 0.35
23 0.32
24 0.31
25 0.27
26 0.28
27 0.25
28 0.21
29 0.21
30 0.19
31 0.19
32 0.16
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.17
37 0.18
38 0.19
39 0.25
40 0.28
41 0.32
42 0.31
43 0.31
44 0.31
45 0.33
46 0.36
47 0.38
48 0.37
49 0.37
50 0.41
51 0.39
52 0.39
53 0.38
54 0.33
55 0.26
56 0.23
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.19
65 0.23
66 0.23
67 0.24
68 0.22
69 0.22
70 0.24
71 0.28
72 0.32
73 0.3
74 0.3
75 0.32
76 0.37
77 0.33
78 0.32
79 0.3
80 0.25
81 0.23
82 0.22
83 0.17
84 0.11
85 0.13
86 0.14
87 0.13
88 0.17
89 0.2
90 0.26
91 0.29
92 0.3
93 0.28
94 0.32
95 0.32
96 0.3
97 0.27
98 0.2
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.09
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.07
116 0.14
117 0.22
118 0.25
119 0.31
120 0.36
121 0.46
122 0.5
123 0.58
124 0.63
125 0.63
126 0.68
127 0.72
128 0.76
129 0.76
130 0.83
131 0.82
132 0.79
133 0.76
134 0.75
135 0.77
136 0.76
137 0.75
138 0.69
139 0.65
140 0.62
141 0.59
142 0.55
143 0.46
144 0.45
145 0.44
146 0.43
147 0.44
148 0.41
149 0.4
150 0.37
151 0.37
152 0.35
153 0.29
154 0.27
155 0.23
156 0.23
157 0.25
158 0.29
159 0.34
160 0.35
161 0.44
162 0.52
163 0.61
164 0.66
165 0.76
166 0.79
167 0.85
168 0.88