Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8TQE5

Protein Details
Accession J8TQE5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-282RLCFYCKKEGHRLNECRARNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MDQIPGGGSYPKLPVECLPNFPIQPALTFRGRNDSHKLKNFISEIMLNMSMIPWPNEASRIVYCRKHLLNPAAQWANDFVQEQGILEITFDTFIQGLYQHFYKPPDINKIFNTINQLSEAKFGIERLNKQFKMIWDRMPPDFMTEKAAIMTYTRLLTKETYNIVRMHKPKTLRGAMEEAYQTTALTERFFPEFELDADGDTIIAATTRLQEEDDNDSDPEDNSLTQKRHVHAVRTRRSYNKPTATYHNRRSNNPSREECVKNRLCFYCKKEGHRLNECRARNASSSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.27
3 0.29
4 0.33
5 0.33
6 0.36
7 0.36
8 0.35
9 0.36
10 0.28
11 0.28
12 0.27
13 0.28
14 0.28
15 0.3
16 0.31
17 0.36
18 0.38
19 0.41
20 0.45
21 0.5
22 0.54
23 0.6
24 0.65
25 0.57
26 0.61
27 0.57
28 0.49
29 0.43
30 0.35
31 0.28
32 0.25
33 0.24
34 0.17
35 0.15
36 0.14
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.09
41 0.11
42 0.11
43 0.13
44 0.14
45 0.16
46 0.18
47 0.22
48 0.27
49 0.29
50 0.31
51 0.36
52 0.37
53 0.38
54 0.42
55 0.45
56 0.46
57 0.44
58 0.5
59 0.45
60 0.42
61 0.38
62 0.34
63 0.27
64 0.22
65 0.2
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.13
89 0.17
90 0.2
91 0.23
92 0.31
93 0.32
94 0.34
95 0.34
96 0.37
97 0.35
98 0.32
99 0.35
100 0.26
101 0.24
102 0.23
103 0.23
104 0.17
105 0.18
106 0.16
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.13
111 0.15
112 0.19
113 0.25
114 0.33
115 0.32
116 0.34
117 0.35
118 0.34
119 0.39
120 0.38
121 0.36
122 0.32
123 0.35
124 0.34
125 0.33
126 0.3
127 0.25
128 0.23
129 0.18
130 0.17
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.19
149 0.21
150 0.23
151 0.29
152 0.31
153 0.32
154 0.33
155 0.34
156 0.36
157 0.41
158 0.42
159 0.36
160 0.35
161 0.35
162 0.32
163 0.32
164 0.28
165 0.2
166 0.17
167 0.16
168 0.13
169 0.09
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.14
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.11
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.11
208 0.1
209 0.12
210 0.17
211 0.18
212 0.24
213 0.28
214 0.29
215 0.37
216 0.4
217 0.45
218 0.47
219 0.56
220 0.6
221 0.63
222 0.68
223 0.67
224 0.72
225 0.72
226 0.74
227 0.73
228 0.69
229 0.65
230 0.7
231 0.73
232 0.74
233 0.76
234 0.76
235 0.71
236 0.72
237 0.77
238 0.77
239 0.75
240 0.74
241 0.69
242 0.65
243 0.68
244 0.7
245 0.66
246 0.66
247 0.65
248 0.6
249 0.62
250 0.62
251 0.59
252 0.6
253 0.62
254 0.62
255 0.61
256 0.65
257 0.69
258 0.71
259 0.76
260 0.78
261 0.79
262 0.78
263 0.81
264 0.76
265 0.72
266 0.67
267 0.63
268 0.57