Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EMM2

Protein Details
Accession J6EMM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-67PELYKPKKISSWKERLREKRARQRRTSANEAKKQQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-57KPKKISSWKERLREKRARQRRT
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MNLLGDIVEKDTSVENNDNDSLMSNNSKTGFPELYKPKKISSWKERLREKRARQRRTSANEAKKQQSTTEAPLSEAKSIHNENIKVLQEMTDEQIMQERQDLYGSLDPKLIAKLLKNINKRAKEENNAPLFAEIEGAPGTWVGGNKQGIYDLPALEDEDVNAALEVRPQSSINSTHVQFQEDQEDHENNDDADDVAPLDFQMAQSIDHMKNEDLFKDVHFIKERKQIEMDLKKLDINDPDFNEKLHEKYFPDLPKEVNKLKWMQPAQEETNRKYVIEDITECRFDFNGNLVPPTRQIDSTVRSGLHHHGDSPELAGYTIVELEHLARSTFSSQRCIAIQTLGRILYKLGQKSYYQLVPEIDAETYKEDGSISNVMDKIYAMFWDLVKDGKIIQSLEIASDEKFTRNLSVRSYSIDALWLWKQGGGDFRIKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.25
4 0.25
5 0.24
6 0.23
7 0.23
8 0.19
9 0.17
10 0.21
11 0.17
12 0.19
13 0.21
14 0.21
15 0.22
16 0.26
17 0.27
18 0.24
19 0.34
20 0.41
21 0.49
22 0.56
23 0.56
24 0.55
25 0.59
26 0.66
27 0.68
28 0.68
29 0.69
30 0.71
31 0.78
32 0.85
33 0.87
34 0.88
35 0.88
36 0.88
37 0.88
38 0.9
39 0.9
40 0.89
41 0.89
42 0.89
43 0.86
44 0.86
45 0.86
46 0.85
47 0.84
48 0.83
49 0.8
50 0.74
51 0.67
52 0.58
53 0.55
54 0.49
55 0.47
56 0.46
57 0.39
58 0.36
59 0.39
60 0.39
61 0.34
62 0.3
63 0.25
64 0.24
65 0.26
66 0.28
67 0.3
68 0.29
69 0.28
70 0.34
71 0.34
72 0.29
73 0.28
74 0.24
75 0.19
76 0.2
77 0.2
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.18
82 0.17
83 0.16
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.14
90 0.18
91 0.19
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.18
97 0.16
98 0.13
99 0.13
100 0.2
101 0.28
102 0.35
103 0.41
104 0.49
105 0.57
106 0.61
107 0.64
108 0.65
109 0.64
110 0.63
111 0.64
112 0.64
113 0.59
114 0.54
115 0.5
116 0.41
117 0.34
118 0.27
119 0.21
120 0.11
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.14
137 0.15
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.14
159 0.16
160 0.19
161 0.19
162 0.24
163 0.24
164 0.25
165 0.23
166 0.22
167 0.25
168 0.21
169 0.23
170 0.2
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.18
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.14
198 0.15
199 0.14
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.19
207 0.19
208 0.23
209 0.31
210 0.32
211 0.29
212 0.3
213 0.3
214 0.34
215 0.4
216 0.38
217 0.31
218 0.31
219 0.29
220 0.29
221 0.28
222 0.21
223 0.19
224 0.2
225 0.2
226 0.23
227 0.22
228 0.22
229 0.23
230 0.2
231 0.19
232 0.17
233 0.17
234 0.15
235 0.17
236 0.23
237 0.24
238 0.26
239 0.26
240 0.27
241 0.31
242 0.35
243 0.36
244 0.33
245 0.33
246 0.34
247 0.37
248 0.43
249 0.38
250 0.36
251 0.36
252 0.39
253 0.41
254 0.44
255 0.44
256 0.38
257 0.44
258 0.42
259 0.37
260 0.32
261 0.3
262 0.25
263 0.23
264 0.23
265 0.19
266 0.22
267 0.23
268 0.22
269 0.2
270 0.18
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.16
275 0.15
276 0.17
277 0.17
278 0.18
279 0.19
280 0.21
281 0.2
282 0.14
283 0.18
284 0.21
285 0.23
286 0.26
287 0.27
288 0.25
289 0.24
290 0.27
291 0.27
292 0.27
293 0.24
294 0.22
295 0.2
296 0.21
297 0.21
298 0.19
299 0.15
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.09
315 0.13
316 0.18
317 0.19
318 0.22
319 0.23
320 0.25
321 0.26
322 0.27
323 0.24
324 0.24
325 0.25
326 0.22
327 0.24
328 0.24
329 0.23
330 0.21
331 0.2
332 0.21
333 0.24
334 0.25
335 0.24
336 0.25
337 0.26
338 0.29
339 0.34
340 0.32
341 0.27
342 0.26
343 0.25
344 0.24
345 0.24
346 0.22
347 0.17
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.13
357 0.15
358 0.14
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.14
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.15
377 0.18
378 0.16
379 0.17
380 0.19
381 0.18
382 0.18
383 0.19
384 0.17
385 0.14
386 0.17
387 0.18
388 0.16
389 0.17
390 0.17
391 0.22
392 0.28
393 0.3
394 0.32
395 0.36
396 0.36
397 0.4
398 0.42
399 0.36
400 0.3
401 0.3
402 0.25
403 0.24
404 0.24
405 0.22
406 0.19
407 0.19
408 0.2
409 0.2
410 0.26
411 0.25