Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5S578

Protein Details
Accession J5S578    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-123VGLALPKKDDKKKNKSIGKDGTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-115DKKKNK
240-241RK
270-274RRVKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MPNSPKRPSDGTGEPSSSKRKYQHTILETKPTFDSSPGKAHDLLHSFPSPTQTKPTTDVSAARNNATGKTDGLSFPGNASPTADLRIEGNTDSKNILSSPVGLALPKKDDKKKNKSIGKDGTGKASAFSGQSAQQQSDPNKMQDVLFSAGIDVREEEALLNSSINASKSQVQANNVRVPKHLPFLHPEQVSIYMKKIGKEQNFNLAFTKNPDILNMMSSACENYMRDILTNAIIISRHRRKAVKINSGRRSEVSMALRAIALIQKKEEERRVKKRIALGLEKEDYENKIDSEETLHRASNVTAGLRAGSKKQYGWLTSSVNKPTSLGAKSSGKVASDITARGESGLKFREAREEPGIVMRDLLFALENRRNGVQTIISKGYAKIRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.54
4 0.5
5 0.49
6 0.49
7 0.52
8 0.55
9 0.61
10 0.66
11 0.66
12 0.72
13 0.7
14 0.74
15 0.66
16 0.61
17 0.54
18 0.47
19 0.39
20 0.34
21 0.35
22 0.28
23 0.35
24 0.35
25 0.37
26 0.36
27 0.37
28 0.4
29 0.38
30 0.36
31 0.33
32 0.32
33 0.3
34 0.29
35 0.34
36 0.3
37 0.27
38 0.33
39 0.32
40 0.33
41 0.36
42 0.4
43 0.37
44 0.37
45 0.4
46 0.38
47 0.43
48 0.41
49 0.38
50 0.37
51 0.34
52 0.33
53 0.31
54 0.27
55 0.19
56 0.18
57 0.19
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.16
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.16
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.15
77 0.13
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.18
93 0.22
94 0.29
95 0.36
96 0.46
97 0.56
98 0.65
99 0.73
100 0.78
101 0.81
102 0.81
103 0.82
104 0.8
105 0.76
106 0.74
107 0.64
108 0.59
109 0.53
110 0.46
111 0.36
112 0.28
113 0.22
114 0.15
115 0.14
116 0.11
117 0.11
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.19
122 0.24
123 0.25
124 0.31
125 0.32
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.25
130 0.2
131 0.22
132 0.16
133 0.14
134 0.13
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.11
155 0.13
156 0.17
157 0.19
158 0.21
159 0.26
160 0.3
161 0.35
162 0.34
163 0.33
164 0.3
165 0.31
166 0.29
167 0.3
168 0.28
169 0.22
170 0.24
171 0.29
172 0.35
173 0.32
174 0.3
175 0.25
176 0.28
177 0.28
178 0.24
179 0.2
180 0.19
181 0.2
182 0.2
183 0.25
184 0.27
185 0.3
186 0.35
187 0.35
188 0.4
189 0.4
190 0.4
191 0.36
192 0.29
193 0.25
194 0.22
195 0.24
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.13
203 0.1
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.17
223 0.23
224 0.26
225 0.3
226 0.33
227 0.37
228 0.47
229 0.56
230 0.57
231 0.6
232 0.67
233 0.71
234 0.72
235 0.7
236 0.6
237 0.55
238 0.45
239 0.42
240 0.34
241 0.28
242 0.24
243 0.23
244 0.22
245 0.17
246 0.16
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.14
252 0.17
253 0.23
254 0.3
255 0.38
256 0.46
257 0.55
258 0.62
259 0.65
260 0.66
261 0.68
262 0.66
263 0.62
264 0.6
265 0.55
266 0.54
267 0.51
268 0.47
269 0.42
270 0.37
271 0.31
272 0.26
273 0.22
274 0.15
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.16
279 0.18
280 0.19
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.2
285 0.2
286 0.18
287 0.17
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.16
295 0.19
296 0.21
297 0.21
298 0.27
299 0.31
300 0.3
301 0.33
302 0.34
303 0.35
304 0.38
305 0.44
306 0.43
307 0.4
308 0.38
309 0.35
310 0.33
311 0.33
312 0.3
313 0.25
314 0.26
315 0.29
316 0.29
317 0.33
318 0.31
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.22
323 0.2
324 0.2
325 0.19
326 0.19
327 0.18
328 0.18
329 0.2
330 0.18
331 0.21
332 0.23
333 0.23
334 0.24
335 0.25
336 0.33
337 0.33
338 0.38
339 0.38
340 0.36
341 0.34
342 0.39
343 0.4
344 0.3
345 0.29
346 0.23
347 0.19
348 0.17
349 0.17
350 0.11
351 0.11
352 0.18
353 0.22
354 0.23
355 0.25
356 0.27
357 0.28
358 0.27
359 0.29
360 0.29
361 0.27
362 0.33
363 0.33
364 0.33
365 0.34
366 0.35