Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5S5D6

Protein Details
Accession J5S5D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-160QKSFKLVKSAKKKRNATRPPVALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-151SAKKKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036168  AP2_Mu_C_sf  
IPR022775  AP_mu_sigma_su  
IPR001392  Clathrin_mu  
IPR018240  Clathrin_mu_CS  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR028565  MHD  
Gene Ontology GO:0030131  C:clathrin adaptor complex  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00928  Adap_comp_sub  
PF01217  Clat_adaptor_s  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00990  CLAT_ADAPTOR_M_1  
PS00991  CLAT_ADAPTOR_M_2  
PS51072  MHD  
CDD cd09250  AP-1_Mu1_Cterm  
cd14835  AP1_Mu_N  
Amino Acid Sequences MASAVYFCDHNGKPLLSRRYRDDIPLSAIDKFPTLLSDLEEQSNLIPPCLNHNGLEYLFIQHNDLYLVAIVTSLRANAAAIFTFLHKLVEVLSDYLKTVEEESIRDNFVIIYELLDEVMDYGIPQICETKMLKQYITQKSFKLVKSAKKKRNATRPPVALTNSVSWRPEGIIHKKNEAFLDIVESINMLMTQKGQVLRSEIIGDVKVNSKLSGMPDLKLGINDKGIFSKYLDDDSNTPPPTSAATSDNITDTDKKPSITSSSTTSKRKVNIELEDLKFHQCVRLSKFENEKIITFIPPDGKFDLMNYRLSTTIKPLIWCDVNVQVHSNSRIEIHCKAKAQIKRKSTATNVEIIIPVPDDADTPTFKYSHGSLKYVPEKSAILWKLRSFPGGKEYSMSAELGLPSISNDIEGHRAIPKSNAEILKGPVQIKFQIPYFTTSGIQVRYLKINEPKLQYKSYPWVRYITQSGDDYTIRLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.5
3 0.5
4 0.55
5 0.58
6 0.61
7 0.62
8 0.63
9 0.59
10 0.53
11 0.51
12 0.51
13 0.46
14 0.4
15 0.39
16 0.33
17 0.28
18 0.24
19 0.18
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.14
24 0.18
25 0.19
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.18
30 0.24
31 0.21
32 0.17
33 0.17
34 0.16
35 0.23
36 0.28
37 0.29
38 0.23
39 0.25
40 0.29
41 0.27
42 0.29
43 0.22
44 0.2
45 0.21
46 0.2
47 0.19
48 0.15
49 0.16
50 0.14
51 0.13
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.1
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.16
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.13
95 0.12
96 0.13
97 0.09
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.03
108 0.05
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.13
115 0.14
116 0.19
117 0.24
118 0.26
119 0.26
120 0.3
121 0.4
122 0.46
123 0.52
124 0.48
125 0.42
126 0.48
127 0.54
128 0.49
129 0.49
130 0.45
131 0.48
132 0.57
133 0.67
134 0.68
135 0.71
136 0.8
137 0.8
138 0.85
139 0.86
140 0.83
141 0.82
142 0.79
143 0.72
144 0.68
145 0.6
146 0.51
147 0.43
148 0.39
149 0.32
150 0.29
151 0.25
152 0.21
153 0.19
154 0.18
155 0.2
156 0.23
157 0.29
158 0.35
159 0.36
160 0.42
161 0.42
162 0.44
163 0.39
164 0.33
165 0.25
166 0.17
167 0.2
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.04
176 0.03
177 0.04
178 0.05
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.19
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.12
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.15
221 0.18
222 0.23
223 0.21
224 0.21
225 0.18
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.14
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.18
244 0.2
245 0.19
246 0.2
247 0.19
248 0.26
249 0.31
250 0.35
251 0.37
252 0.37
253 0.39
254 0.41
255 0.42
256 0.41
257 0.38
258 0.41
259 0.44
260 0.42
261 0.4
262 0.38
263 0.33
264 0.28
265 0.24
266 0.2
267 0.17
268 0.2
269 0.23
270 0.31
271 0.33
272 0.38
273 0.45
274 0.46
275 0.47
276 0.44
277 0.39
278 0.33
279 0.31
280 0.26
281 0.2
282 0.18
283 0.19
284 0.18
285 0.2
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.18
290 0.22
291 0.19
292 0.21
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.21
297 0.2
298 0.18
299 0.22
300 0.21
301 0.21
302 0.21
303 0.24
304 0.23
305 0.23
306 0.21
307 0.22
308 0.22
309 0.22
310 0.23
311 0.21
312 0.22
313 0.24
314 0.22
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.2
319 0.24
320 0.26
321 0.28
322 0.3
323 0.33
324 0.38
325 0.44
326 0.49
327 0.52
328 0.53
329 0.55
330 0.57
331 0.6
332 0.57
333 0.59
334 0.52
335 0.48
336 0.42
337 0.37
338 0.34
339 0.28
340 0.23
341 0.15
342 0.13
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.07
347 0.1
348 0.1
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.16
354 0.17
355 0.23
356 0.25
357 0.27
358 0.28
359 0.36
360 0.44
361 0.44
362 0.42
363 0.35
364 0.33
365 0.31
366 0.38
367 0.32
368 0.29
369 0.31
370 0.32
371 0.36
372 0.36
373 0.39
374 0.32
375 0.31
376 0.35
377 0.34
378 0.32
379 0.28
380 0.28
381 0.27
382 0.27
383 0.24
384 0.16
385 0.15
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.12
397 0.12
398 0.14
399 0.17
400 0.18
401 0.18
402 0.22
403 0.24
404 0.25
405 0.32
406 0.32
407 0.31
408 0.33
409 0.36
410 0.37
411 0.38
412 0.35
413 0.31
414 0.32
415 0.33
416 0.33
417 0.32
418 0.29
419 0.3
420 0.3
421 0.31
422 0.3
423 0.29
424 0.27
425 0.27
426 0.29
427 0.25
428 0.28
429 0.27
430 0.28
431 0.32
432 0.33
433 0.37
434 0.41
435 0.48
436 0.51
437 0.55
438 0.61
439 0.59
440 0.63
441 0.59
442 0.57
443 0.59
444 0.62
445 0.61
446 0.55
447 0.55
448 0.52
449 0.55
450 0.54
451 0.48
452 0.44
453 0.4
454 0.39
455 0.38
456 0.36