Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EDS1

Protein Details
Accession J6EDS1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-188DHTDYFKKRNPKKIARSDNEHydrophilic
330-352VTANTVSKGHKKKKSGIFVRNAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-285RKK
340-342KKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
Amino Acid Sequences MESLRTLCEISLMRNHSNLQSVSNVPYHLLKKILQKVKIPQLLRLEKSNVLLVFDDDELWLEFLKHDFPTNVQEQFVSRRDSICKYYFNFIMENDIELYQSDQDLLKSCIRQSVVKDTRNNKYRVPYRMLYAKYQQEVEKKQEESAERLRFEMQKLQQEREKKQTIVVDHTDYFKKRNPKKIARSDNEFHSQLYMKSLKDHESRLKHFRDGGFNIAKRHAQRVAFGGTAGRQPSAPKKVPVPSNAEPVKIGRQIDDSAAEKRDVTLQPIKKRRSESPSIFLSRKKPALPRAAPKVNTTISRDHSTAITNDHRTYPHNGPHTGIISSTPNVTANTVSKGHKKKKSGIFVRNAGPDGDTPSHVTTAAPTTRPYIHDPRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.33
4 0.38
5 0.35
6 0.3
7 0.28
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.27
12 0.22
13 0.28
14 0.28
15 0.26
16 0.27
17 0.28
18 0.35
19 0.45
20 0.51
21 0.51
22 0.55
23 0.62
24 0.69
25 0.72
26 0.63
27 0.6
28 0.62
29 0.65
30 0.61
31 0.58
32 0.51
33 0.46
34 0.47
35 0.45
36 0.35
37 0.28
38 0.26
39 0.21
40 0.19
41 0.17
42 0.16
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.13
55 0.15
56 0.21
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.28
63 0.3
64 0.29
65 0.25
66 0.27
67 0.31
68 0.34
69 0.38
70 0.36
71 0.38
72 0.36
73 0.4
74 0.39
75 0.36
76 0.33
77 0.27
78 0.29
79 0.24
80 0.22
81 0.19
82 0.17
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.1
92 0.13
93 0.16
94 0.17
95 0.17
96 0.2
97 0.22
98 0.24
99 0.25
100 0.33
101 0.38
102 0.43
103 0.51
104 0.53
105 0.61
106 0.66
107 0.65
108 0.57
109 0.59
110 0.59
111 0.58
112 0.59
113 0.51
114 0.47
115 0.52
116 0.5
117 0.45
118 0.44
119 0.42
120 0.37
121 0.38
122 0.38
123 0.37
124 0.39
125 0.41
126 0.4
127 0.36
128 0.35
129 0.37
130 0.35
131 0.34
132 0.38
133 0.37
134 0.32
135 0.33
136 0.34
137 0.32
138 0.32
139 0.34
140 0.29
141 0.32
142 0.35
143 0.37
144 0.38
145 0.43
146 0.46
147 0.47
148 0.47
149 0.39
150 0.4
151 0.4
152 0.39
153 0.37
154 0.35
155 0.29
156 0.26
157 0.29
158 0.28
159 0.25
160 0.26
161 0.25
162 0.32
163 0.36
164 0.45
165 0.53
166 0.6
167 0.69
168 0.77
169 0.83
170 0.78
171 0.78
172 0.71
173 0.66
174 0.61
175 0.51
176 0.4
177 0.31
178 0.27
179 0.2
180 0.21
181 0.19
182 0.14
183 0.16
184 0.18
185 0.21
186 0.23
187 0.27
188 0.3
189 0.34
190 0.4
191 0.44
192 0.45
193 0.42
194 0.43
195 0.42
196 0.4
197 0.36
198 0.37
199 0.36
200 0.35
201 0.35
202 0.34
203 0.34
204 0.29
205 0.3
206 0.28
207 0.23
208 0.22
209 0.24
210 0.24
211 0.21
212 0.2
213 0.17
214 0.14
215 0.16
216 0.15
217 0.12
218 0.09
219 0.12
220 0.19
221 0.26
222 0.28
223 0.28
224 0.32
225 0.38
226 0.42
227 0.44
228 0.46
229 0.41
230 0.47
231 0.46
232 0.42
233 0.37
234 0.34
235 0.34
236 0.29
237 0.27
238 0.19
239 0.2
240 0.2
241 0.2
242 0.21
243 0.18
244 0.18
245 0.19
246 0.18
247 0.16
248 0.15
249 0.21
250 0.18
251 0.22
252 0.28
253 0.33
254 0.43
255 0.52
256 0.56
257 0.55
258 0.6
259 0.63
260 0.62
261 0.65
262 0.61
263 0.59
264 0.62
265 0.62
266 0.59
267 0.56
268 0.53
269 0.5
270 0.48
271 0.47
272 0.46
273 0.48
274 0.56
275 0.59
276 0.62
277 0.65
278 0.69
279 0.66
280 0.62
281 0.6
282 0.53
283 0.5
284 0.45
285 0.42
286 0.39
287 0.41
288 0.39
289 0.34
290 0.32
291 0.3
292 0.27
293 0.27
294 0.29
295 0.28
296 0.3
297 0.31
298 0.32
299 0.32
300 0.38
301 0.39
302 0.39
303 0.41
304 0.41
305 0.4
306 0.43
307 0.42
308 0.35
309 0.28
310 0.23
311 0.2
312 0.2
313 0.19
314 0.16
315 0.15
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.2
321 0.23
322 0.26
323 0.34
324 0.44
325 0.53
326 0.58
327 0.63
328 0.69
329 0.74
330 0.81
331 0.82
332 0.82
333 0.81
334 0.79
335 0.79
336 0.74
337 0.65
338 0.54
339 0.46
340 0.37
341 0.34
342 0.3
343 0.25
344 0.24
345 0.25
346 0.25
347 0.23
348 0.22
349 0.18
350 0.23
351 0.26
352 0.24
353 0.24
354 0.27
355 0.31
356 0.34
357 0.39