Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6ECI6

Protein Details
Accession J6ECI6    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-128SSSGKKSSAAHRPKSRKKQTILPNGQHydrophilic
153-179LCSRCGIAYRKKMEKKIRQQQCIENGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-120KKSSAAHRPKSRKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
Amino Acid Sequences MLYNKEQKVNNISGPSGRTKFQFDRFVQMVLFIAANPDYCSPVRSIQGTGVKPDLKRADILGQKIKSLNTALGSKLKEESRLGHSLHDSATPAPSSLSSLPLSSSGKKSSAAHRPKSRKKQTILPNGQPKECATCGDTWTSQWRSGPEGNVELCSRCGIAYRKKMEKKIRQQQCIENGTNNSIFNNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.36
4 0.33
5 0.31
6 0.35
7 0.4
8 0.45
9 0.51
10 0.45
11 0.51
12 0.5
13 0.49
14 0.41
15 0.35
16 0.28
17 0.2
18 0.18
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.12
27 0.13
28 0.14
29 0.17
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.23
34 0.3
35 0.29
36 0.29
37 0.31
38 0.31
39 0.3
40 0.35
41 0.32
42 0.26
43 0.26
44 0.25
45 0.28
46 0.28
47 0.33
48 0.34
49 0.31
50 0.32
51 0.33
52 0.31
53 0.25
54 0.22
55 0.19
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.18
60 0.18
61 0.17
62 0.2
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.2
67 0.2
68 0.24
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.2
73 0.2
74 0.17
75 0.13
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.12
89 0.14
90 0.13
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.24
97 0.32
98 0.39
99 0.45
100 0.53
101 0.63
102 0.71
103 0.81
104 0.84
105 0.82
106 0.78
107 0.79
108 0.79
109 0.8
110 0.78
111 0.76
112 0.76
113 0.7
114 0.67
115 0.59
116 0.49
117 0.43
118 0.35
119 0.28
120 0.2
121 0.19
122 0.2
123 0.23
124 0.22
125 0.19
126 0.26
127 0.26
128 0.26
129 0.26
130 0.26
131 0.28
132 0.3
133 0.31
134 0.27
135 0.28
136 0.27
137 0.27
138 0.27
139 0.22
140 0.2
141 0.18
142 0.15
143 0.11
144 0.16
145 0.21
146 0.29
147 0.38
148 0.46
149 0.55
150 0.63
151 0.72
152 0.78
153 0.82
154 0.84
155 0.85
156 0.87
157 0.86
158 0.84
159 0.84
160 0.82
161 0.79
162 0.71
163 0.66
164 0.58
165 0.54
166 0.5
167 0.42