Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166HCW6

Protein Details
Accession A0A166HCW6    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34IGGSRGKRRKGEPSPVQSKSHydrophilic
189-218SEGEQVGSKKKKKKRPSFHRVMRKKLQKLVBasic
531-563EEEADKKVRKKVKVKPSDKERSKSKESRPKEEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-24RGKRRK
196-213SKKKKKKRPSFHRVMRKK
417-434PPPPREGLRPKPPPAAEK
536-560KKVRKKVKVKPSDKERSKSKESRPK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001487  Bromodomain  
IPR036427  Bromodomain-like_sf  
IPR037382  Rsc/polybromo  
Gene Ontology GO:0016586  C:RSC-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00439  Bromodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50014  BROMODOMAIN_2  
CDD cd04369  Bromodomain  
Amino Acid Sequences MVSKRAPGIDPSNIIGGSRGKRRKGEPSPVQSKSPSPEPEDVEMEDATLDEHEDKSMLARDIGLQLWNFLKEAKSKDDRQLSYEFLRLPSRKLYPDYYTLIQYPISFEEIKIKLNKLTYTSPLQVKQDFETCFKNAKNYNMKGSPIWNDAKALLKLTSREYEALMGTQDSKEDEDQDMMVDGGHDGDASEGEQVGSKKKKKKRPSFHRVMRKKLQKLVQHTDNEGRILSSDFMEPPSKKLYPVYYKMIKRVIWFNFIFKKLDAKEYQSAAECATDVELIFSNAFQFNEDHSPIWEAAMTLKKAFAKSMADLPEEYSVPEYSQTASENNPPAKLKLRINPSSAQLSKHSTTPAVTAPSGRSSNITLRLPAASTSASVAPPTQTLPTPSPAPVKAEPPPVVQTPVKAPVPTPTPAPPPPPPPREGLRPKPPPAAEKPKISVQDTAPAPVLPPPPPPPKVLQLSHSPVPPEPPSKCPLQSLKLRTVPRGRYFQLQRSEGVRIWTVRLGRDENSVRVSSVEFVPDDESDPWSSDEEEADKKVRKKVKVKPSDKERSKSKESRPKEEVIVRINGNAVKSGTRSKDPTIPEWDVALVTGMNTLEVMGDTAGEIWKVYLERLQVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.28
4 0.29
5 0.36
6 0.42
7 0.46
8 0.53
9 0.59
10 0.67
11 0.7
12 0.75
13 0.75
14 0.78
15 0.81
16 0.79
17 0.77
18 0.69
19 0.64
20 0.59
21 0.57
22 0.52
23 0.48
24 0.5
25 0.5
26 0.51
27 0.49
28 0.44
29 0.38
30 0.33
31 0.27
32 0.2
33 0.15
34 0.11
35 0.08
36 0.09
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.11
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.16
48 0.18
49 0.19
50 0.19
51 0.15
52 0.16
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.15
57 0.17
58 0.2
59 0.24
60 0.31
61 0.36
62 0.41
63 0.49
64 0.58
65 0.56
66 0.55
67 0.54
68 0.51
69 0.47
70 0.46
71 0.38
72 0.32
73 0.39
74 0.36
75 0.35
76 0.37
77 0.39
78 0.4
79 0.42
80 0.45
81 0.41
82 0.45
83 0.47
84 0.42
85 0.4
86 0.36
87 0.33
88 0.28
89 0.24
90 0.21
91 0.17
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.22
96 0.23
97 0.27
98 0.29
99 0.29
100 0.29
101 0.32
102 0.34
103 0.3
104 0.32
105 0.32
106 0.34
107 0.38
108 0.39
109 0.4
110 0.42
111 0.41
112 0.39
113 0.38
114 0.38
115 0.35
116 0.33
117 0.33
118 0.31
119 0.34
120 0.33
121 0.37
122 0.35
123 0.42
124 0.49
125 0.48
126 0.54
127 0.52
128 0.53
129 0.47
130 0.47
131 0.43
132 0.38
133 0.37
134 0.3
135 0.28
136 0.27
137 0.31
138 0.27
139 0.24
140 0.21
141 0.2
142 0.21
143 0.24
144 0.24
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.18
150 0.17
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.07
180 0.08
181 0.15
182 0.23
183 0.3
184 0.39
185 0.48
186 0.58
187 0.67
188 0.78
189 0.82
190 0.85
191 0.89
192 0.91
193 0.93
194 0.94
195 0.91
196 0.89
197 0.88
198 0.86
199 0.82
200 0.78
201 0.75
202 0.7
203 0.7
204 0.7
205 0.67
206 0.6
207 0.57
208 0.54
209 0.48
210 0.42
211 0.33
212 0.24
213 0.17
214 0.16
215 0.13
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.16
221 0.15
222 0.17
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.23
227 0.28
228 0.3
229 0.35
230 0.4
231 0.43
232 0.44
233 0.48
234 0.5
235 0.44
236 0.39
237 0.42
238 0.37
239 0.36
240 0.34
241 0.35
242 0.35
243 0.36
244 0.35
245 0.27
246 0.31
247 0.26
248 0.31
249 0.28
250 0.27
251 0.29
252 0.29
253 0.3
254 0.25
255 0.24
256 0.19
257 0.17
258 0.12
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.12
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.1
282 0.07
283 0.09
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.12
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.13
292 0.11
293 0.12
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.15
301 0.14
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.13
313 0.18
314 0.18
315 0.2
316 0.2
317 0.2
318 0.24
319 0.28
320 0.28
321 0.29
322 0.37
323 0.39
324 0.41
325 0.42
326 0.4
327 0.42
328 0.38
329 0.34
330 0.29
331 0.3
332 0.27
333 0.26
334 0.25
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.14
343 0.17
344 0.17
345 0.16
346 0.15
347 0.15
348 0.19
349 0.23
350 0.22
351 0.19
352 0.19
353 0.19
354 0.18
355 0.16
356 0.14
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.12
370 0.14
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.21
375 0.21
376 0.25
377 0.23
378 0.25
379 0.26
380 0.31
381 0.3
382 0.29
383 0.32
384 0.28
385 0.3
386 0.27
387 0.25
388 0.22
389 0.26
390 0.25
391 0.22
392 0.21
393 0.21
394 0.24
395 0.24
396 0.23
397 0.21
398 0.26
399 0.28
400 0.33
401 0.33
402 0.38
403 0.46
404 0.48
405 0.47
406 0.46
407 0.47
408 0.52
409 0.58
410 0.58
411 0.6
412 0.63
413 0.65
414 0.68
415 0.66
416 0.62
417 0.62
418 0.64
419 0.58
420 0.55
421 0.55
422 0.53
423 0.55
424 0.5
425 0.45
426 0.36
427 0.39
428 0.34
429 0.32
430 0.27
431 0.23
432 0.21
433 0.21
434 0.23
435 0.16
436 0.2
437 0.25
438 0.32
439 0.34
440 0.36
441 0.36
442 0.4
443 0.46
444 0.44
445 0.41
446 0.41
447 0.45
448 0.45
449 0.43
450 0.38
451 0.31
452 0.34
453 0.35
454 0.33
455 0.3
456 0.32
457 0.33
458 0.36
459 0.37
460 0.39
461 0.4
462 0.41
463 0.47
464 0.48
465 0.54
466 0.57
467 0.58
468 0.59
469 0.61
470 0.63
471 0.61
472 0.62
473 0.56
474 0.58
475 0.62
476 0.62
477 0.62
478 0.55
479 0.52
480 0.48
481 0.49
482 0.41
483 0.38
484 0.33
485 0.26
486 0.26
487 0.27
488 0.26
489 0.25
490 0.28
491 0.28
492 0.26
493 0.33
494 0.34
495 0.33
496 0.35
497 0.33
498 0.29
499 0.27
500 0.26
501 0.2
502 0.18
503 0.17
504 0.13
505 0.14
506 0.15
507 0.15
508 0.17
509 0.15
510 0.17
511 0.16
512 0.17
513 0.17
514 0.16
515 0.17
516 0.15
517 0.16
518 0.17
519 0.18
520 0.2
521 0.25
522 0.3
523 0.34
524 0.42
525 0.48
526 0.54
527 0.61
528 0.68
529 0.73
530 0.78
531 0.82
532 0.85
533 0.88
534 0.9
535 0.89
536 0.87
537 0.85
538 0.83
539 0.84
540 0.83
541 0.83
542 0.82
543 0.81
544 0.82
545 0.78
546 0.74
547 0.73
548 0.7
549 0.65
550 0.6
551 0.59
552 0.49
553 0.45
554 0.43
555 0.37
556 0.31
557 0.27
558 0.22
559 0.18
560 0.2
561 0.27
562 0.29
563 0.33
564 0.37
565 0.39
566 0.45
567 0.48
568 0.51
569 0.51
570 0.51
571 0.45
572 0.42
573 0.38
574 0.31
575 0.27
576 0.21
577 0.13
578 0.09
579 0.09
580 0.08
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.13