FuNGI

A0A166EKD4

Protein Details

Accession

A0A166EKD4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
538-578	VRETIKRPKGESKEDKKARKAAVKAERQVRRVEKKAMKSTF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
542-575	IKRPKGESKEDKKARKAAVKAERQVRRVEKKAMK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPEKTKSKSLFRQPGAKHFQLVHRSQRDPLIHDPEASQHVLKAFVRGNKGKGKTRDDLEALIDPSDLQATRPNVGEASLYGVYYDDTDYDYMQHLRPVGIQEEGVDSIWIDAPSTSSNSKSKSKKFSEDMILPPSVLPSKTELPLSSIHAAQSAIPPSLQGLQPDMDPHLRQVLEALEDEAFVDDDPEATADDFFGELVADGERDSDEEVEFEFQEWGVGSDEEHGLDEDADEDAEGQESADWEDRFRKFKAEQKQKGGVVDDGSVVDGYSEGGDTLSGLPKLAVAGGKRRRTGTTDGSGYSLSSSAVYRNAGLTTLDEQFDRLMAKEYGEVLDDDEYDDGDSVSHSSRAPDDSDDSDDSEETPDLLSRPDLQASMSDFLDNYEIIGGRKLRQVMPGMTGADKLETLRRGMASAADKERILAEAERIEREDMERKVNQNEMVGYDEDEDKKDRWDCETILSTYSNLENHPKLIRVRDGAVRPPRGPKIVVDRKTGFPSVVEEDQKEVEDSEDSDDTTKRKCANLFVQGGMLILPVKAVRETIKRPKGESKEDKKARKAAVKAERQVRRVEKKAMKSTFEDEKRSFVKVLNGRRGVEGVKKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.78
3	0.7
4	0.63
5	0.57
6	0.59
7	0.59
8	0.61
9	0.61
10	0.59
11	0.6
12	0.59
13	0.62
14	0.58
15	0.54
16	0.56
17	0.54
18	0.47
19	0.46
20	0.44
21	0.4
22	0.4
23	0.37
24	0.28
25	0.22
26	0.21
27	0.25
28	0.24
29	0.25
30	0.27
31	0.3
32	0.38
33	0.41
34	0.46
35	0.51
36	0.57
37	0.61
38	0.64
39	0.67
40	0.65
41	0.64
42	0.64
43	0.58
44	0.53
45	0.47
46	0.43
47	0.36
48	0.3
49	0.26
50	0.19
51	0.16
52	0.17
53	0.13
54	0.1
55	0.15
56	0.17
57	0.2
58	0.21
59	0.21
60	0.19
61	0.19
62	0.19
63	0.13
64	0.16
65	0.14
66	0.13
67	0.12
68	0.12
69	0.12
70	0.12
71	0.12
72	0.07
73	0.08
74	0.09
75	0.09
76	0.1
77	0.13
78	0.14
79	0.15
80	0.16
81	0.16
82	0.16
83	0.18
84	0.2
85	0.18
86	0.17
87	0.16
88	0.14
89	0.16
90	0.16
91	0.14
92	0.11
93	0.09
94	0.09
95	0.11
96	0.1
97	0.08
98	0.07
99	0.09
100	0.1
101	0.13
102	0.14
103	0.16
104	0.2
105	0.25
106	0.34
107	0.41
108	0.48
109	0.55
110	0.61
111	0.65
112	0.66
113	0.68
114	0.67
115	0.64
116	0.6
117	0.55
118	0.48
119	0.39
120	0.34
121	0.29
122	0.24
123	0.18
124	0.15
125	0.15
126	0.18
127	0.19
128	0.21
129	0.2
130	0.2
131	0.22
132	0.25
133	0.22
134	0.2
135	0.18
136	0.17
137	0.17
138	0.16
139	0.17
140	0.15
141	0.13
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.15
146	0.15
147	0.12
148	0.12
149	0.12
150	0.13
151	0.14
152	0.16
153	0.16
154	0.15
155	0.15
156	0.18
157	0.17
158	0.16
159	0.17
160	0.15
161	0.13
162	0.13
163	0.14
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.07
169	0.05
170	0.06
171	0.04
172	0.04
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.03
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.07
201	0.06
202	0.07
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.15
232	0.18
233	0.22
234	0.22
235	0.26
236	0.26
237	0.34
238	0.44
239	0.49
240	0.54
241	0.58
242	0.64
243	0.6
244	0.58
245	0.52
246	0.43
247	0.32
248	0.25
249	0.18
250	0.12
251	0.1
252	0.08
253	0.07
254	0.05
255	0.04
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.06
273	0.15
274	0.23
275	0.27
276	0.29
277	0.31
278	0.31
279	0.34
280	0.38
281	0.35
282	0.32
283	0.3
284	0.29
285	0.28
286	0.27
287	0.23
288	0.18
289	0.12
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.09
303	0.09
304	0.1
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.08
310	0.06
311	0.08
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.1
316	0.09
317	0.1
318	0.09
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.08
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.13
340	0.14
341	0.17
342	0.17
343	0.17
344	0.16
345	0.15
346	0.14
347	0.12
348	0.1
349	0.07
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.11
361	0.13
362	0.14
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.12
368	0.09
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.09
374	0.1
375	0.11
376	0.14
377	0.16
378	0.17
379	0.2
380	0.23
381	0.22
382	0.23
383	0.23
384	0.22
385	0.2
386	0.19
387	0.16
388	0.13
389	0.12
390	0.1
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.14
398	0.17
399	0.17
400	0.2
401	0.22
402	0.22
403	0.22
404	0.21
405	0.21
406	0.18
407	0.16
408	0.12
409	0.11
410	0.15
411	0.16
412	0.17
413	0.18
414	0.17
415	0.16
416	0.18
417	0.23
418	0.21
419	0.25
420	0.28
421	0.3
422	0.32
423	0.35
424	0.33
425	0.28
426	0.27
427	0.22
428	0.21
429	0.19
430	0.17
431	0.15
432	0.17
433	0.16
434	0.16
435	0.17
436	0.15
437	0.2
438	0.23
439	0.23
440	0.24
441	0.27
442	0.26
443	0.3
444	0.33
445	0.3
446	0.28
447	0.27
448	0.23
449	0.21
450	0.22
451	0.17
452	0.15
453	0.19
454	0.18
455	0.2
456	0.22
457	0.25
458	0.26
459	0.3
460	0.33
461	0.31
462	0.33
463	0.37
464	0.39
465	0.44
466	0.49
467	0.5
468	0.47
469	0.52
470	0.53
471	0.49
472	0.46
473	0.42
474	0.45
475	0.5
476	0.52
477	0.53
478	0.52
479	0.53
480	0.57
481	0.53
482	0.42
483	0.32
484	0.32
485	0.29
486	0.31
487	0.29
488	0.25
489	0.27
490	0.27
491	0.27
492	0.23
493	0.18
494	0.14
495	0.12
496	0.12
497	0.14
498	0.14
499	0.13
500	0.15
501	0.17
502	0.18
503	0.2
504	0.24
505	0.23
506	0.27
507	0.29
508	0.36
509	0.42
510	0.49
511	0.49
512	0.45
513	0.43
514	0.38
515	0.36
516	0.27
517	0.2
518	0.11
519	0.07
520	0.07
521	0.06
522	0.07
523	0.07
524	0.09
525	0.14
526	0.21
527	0.3
528	0.41
529	0.49
530	0.51
531	0.56
532	0.65
533	0.68
534	0.72
535	0.74
536	0.73
537	0.76
538	0.82
539	0.85
540	0.83
541	0.83
542	0.81
543	0.79
544	0.75
545	0.74
546	0.75
547	0.76
548	0.76
549	0.78
550	0.77
551	0.71
552	0.74
553	0.74
554	0.73
555	0.71
556	0.73
557	0.72
558	0.74
559	0.82
560	0.79
561	0.73
562	0.68
563	0.67
564	0.67
565	0.65
566	0.63
567	0.54
568	0.55
569	0.53
570	0.51
571	0.47
572	0.39
573	0.42
574	0.43
575	0.51
576	0.54
577	0.57
578	0.55
579	0.55
580	0.55
581	0.49

A0A166EKD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer