FuNGI

A0A166EQC1

Protein Details

Accession

A0A166EQC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-54	GRARPTPPSPSLKKPPKRPVKAFDFRMQPR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-47	TPPSPSLKKPPKRPVKAF

Subcellular Location(s)

cyto 12, nucl 10, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001406 PsdUridine_synth_TruA IPR020097 PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom IPR020095 PsdUridine_synth_TruA_C IPR020094 TruA/RsuA/RluB/E/F_N
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0106029 F:tRNA pseudouridine synthase activity GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01416 PseudoU_synth_1

Amino Acid Sequences

MAATPPAYHDWSREDLINRILVLEGRARPTPPSPSLKKPPKRPVKAFDFRMQPRRKIALKFCYAGEHYNGLAIQSDPTPLPTVEAVIFDALSETRLVDRGAGMDGCGWSRCGRTDRGVSAAGQVISLHVRTLPSRPELNYVDMLNRVLPSTIRILAWSPVSDSFDARFSCAFRHYKYFFVPSGLDIDAMRDATQRLLGEHDFRNLCKLDPSKQITNFRRVISRAEISSVSSDMMVFDLIGTAFLYNQVRHIMAVLFLIGGGLESPSVMSSLLNADPSHPIPALKTDEAIEIVATKPVYQMADGLPLVLWDCGYRPEDVDWQTPLSSAEPRSDTEGLLLPTILLQHLESTRQRSLIKSTLDEYFLKAALSYHPGSVTLARGSAAVHNGQVLNIPIGGGKYRRTGAYVPLLKRERNEPIEETNERWRLAKLRKTEAKAGAEDAVEEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.33
3	0.35
4	0.35
5	0.3
6	0.25
7	0.24
8	0.2
9	0.19
10	0.22
11	0.21
12	0.23
13	0.25
14	0.26
15	0.28
16	0.32
17	0.37
18	0.38
19	0.44
20	0.47
21	0.55
22	0.65
23	0.72
24	0.78
25	0.81
26	0.85
27	0.86
28	0.9
29	0.9
30	0.88
31	0.88
32	0.88
33	0.84
34	0.81
35	0.8
36	0.78
37	0.79
38	0.77
39	0.72
40	0.7
41	0.71
42	0.7
43	0.69
44	0.7
45	0.69
46	0.68
47	0.64
48	0.57
49	0.55
50	0.51
51	0.45
52	0.39
53	0.31
54	0.24
55	0.24
56	0.23
57	0.17
58	0.16
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.11
63	0.1
64	0.11
65	0.14
66	0.12
67	0.14
68	0.12
69	0.14
70	0.13
71	0.13
72	0.12
73	0.1
74	0.1
75	0.08
76	0.09
77	0.07
78	0.07
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.08
87	0.1
88	0.1
89	0.09
90	0.09
91	0.1
92	0.1
93	0.1
94	0.1
95	0.1
96	0.11
97	0.15
98	0.18
99	0.21
100	0.25
101	0.3
102	0.31
103	0.33
104	0.33
105	0.3
106	0.28
107	0.27
108	0.22
109	0.16
110	0.14
111	0.12
112	0.11
113	0.11
114	0.09
115	0.07
116	0.08
117	0.09
118	0.13
119	0.15
120	0.18
121	0.21
122	0.22
123	0.28
124	0.29
125	0.31
126	0.3
127	0.27
128	0.24
129	0.22
130	0.21
131	0.16
132	0.14
133	0.11
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.11
138	0.12
139	0.11
140	0.11
141	0.12
142	0.14
143	0.15
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.14
148	0.14
149	0.13
150	0.13
151	0.16
152	0.15
153	0.15
154	0.14
155	0.13
156	0.14
157	0.19
158	0.22
159	0.2
160	0.27
161	0.28
162	0.3
163	0.32
164	0.34
165	0.29
166	0.28
167	0.27
168	0.19
169	0.21
170	0.17
171	0.15
172	0.11
173	0.12
174	0.1
175	0.09
176	0.09
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.08
181	0.07
182	0.07
183	0.1
184	0.1
185	0.14
186	0.14
187	0.19
188	0.18
189	0.18
190	0.21
191	0.19
192	0.18
193	0.19
194	0.21
195	0.21
196	0.29
197	0.34
198	0.36
199	0.41
200	0.51
201	0.49
202	0.55
203	0.53
204	0.46
205	0.44
206	0.4
207	0.37
208	0.32
209	0.3
210	0.22
211	0.2
212	0.2
213	0.17
214	0.16
215	0.14
216	0.1
217	0.08
218	0.07
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.05
231	0.07
232	0.06
233	0.08
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.03
246	0.03
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.02
251	0.02
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.08
261	0.09
262	0.11
263	0.12
264	0.13
265	0.12
266	0.11
267	0.11
268	0.15
269	0.18
270	0.16
271	0.16
272	0.15
273	0.16
274	0.16
275	0.15
276	0.11
277	0.07
278	0.08
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.09
285	0.08
286	0.09
287	0.08
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.1
292	0.09
293	0.1
294	0.08
295	0.08
296	0.04
297	0.05
298	0.08
299	0.09
300	0.1
301	0.1
302	0.13
303	0.18
304	0.21
305	0.23
306	0.22
307	0.22
308	0.22
309	0.21
310	0.2
311	0.16
312	0.16
313	0.15
314	0.17
315	0.18
316	0.19
317	0.24
318	0.23
319	0.21
320	0.2
321	0.22
322	0.19
323	0.17
324	0.16
325	0.11
326	0.1
327	0.11
328	0.09
329	0.06
330	0.05
331	0.08
332	0.09
333	0.14
334	0.17
335	0.22
336	0.24
337	0.27
338	0.28
339	0.28
340	0.33
341	0.35
342	0.35
343	0.32
344	0.33
345	0.32
346	0.34
347	0.32
348	0.28
349	0.23
350	0.2
351	0.18
352	0.16
353	0.14
354	0.13
355	0.18
356	0.16
357	0.15
358	0.15
359	0.16
360	0.17
361	0.18
362	0.18
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.12
368	0.14
369	0.15
370	0.13
371	0.13
372	0.15
373	0.15
374	0.14
375	0.15
376	0.13
377	0.12
378	0.1
379	0.1
380	0.09
381	0.1
382	0.13
383	0.13
384	0.15
385	0.19
386	0.21
387	0.22
388	0.25
389	0.26
390	0.3
391	0.38
392	0.44
393	0.42
394	0.49
395	0.53
396	0.52
397	0.53
398	0.53
399	0.52
400	0.5
401	0.53
402	0.47
403	0.49
404	0.54
405	0.55
406	0.52
407	0.52
408	0.51
409	0.46
410	0.43
411	0.4
412	0.42
413	0.48
414	0.52
415	0.5
416	0.57
417	0.65
418	0.7
419	0.75
420	0.74
421	0.7
422	0.64
423	0.59
424	0.51
425	0.42

A0A166EQC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer