Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166J3L9

Protein Details
Accession A0A166J3L9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-291KTKSSAPKARTEKKEKVTIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-121RGRGRGRGRGRGGAARGRGR
278-288PKARTEKKEKV
293-331DARFERPSRGGRGGRGGERGSRGDRGDRRGGSGRGRGGR
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9.5, cysk 7, nucl 6.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVATKNPFALLNDDDNDGPAQTLPPAHDPPPVAVVVPSQSRDAQRGKGPAARGGRYYQRGGGKAGAKVENVDESTANAANGATEGRNRKTLISDTDDGDDRGRGRGRGRGRGGAARGRGRVYDRHSGGLPDSEKKIHQSWGGDDGQQELKAEEQGLNDAVTDVATAPADWGLPSSAAANADDGWGAAPAESAEPATEAAPATPAGESRRREREPEEEDNTITLEEYLAKQKEAAAAVIPKLEGVRQVEDQVPEGAVPLQKDVESGDYFVGKTKSSAPKARTEKKEKVTIEIDARFERPSRGGRGGRGGERGSRGDRGDRRGGSGRGRGGRNDARSSNVTVDVADETAFPSLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.26
4 0.24
5 0.2
6 0.16
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.19
13 0.23
14 0.24
15 0.27
16 0.28
17 0.28
18 0.3
19 0.27
20 0.21
21 0.18
22 0.18
23 0.18
24 0.2
25 0.19
26 0.19
27 0.22
28 0.24
29 0.3
30 0.32
31 0.33
32 0.36
33 0.4
34 0.42
35 0.42
36 0.42
37 0.43
38 0.46
39 0.43
40 0.4
41 0.4
42 0.44
43 0.44
44 0.44
45 0.43
46 0.42
47 0.42
48 0.41
49 0.42
50 0.38
51 0.36
52 0.38
53 0.35
54 0.29
55 0.28
56 0.27
57 0.24
58 0.2
59 0.19
60 0.14
61 0.12
62 0.15
63 0.14
64 0.13
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.06
71 0.11
72 0.16
73 0.18
74 0.22
75 0.23
76 0.24
77 0.26
78 0.3
79 0.3
80 0.32
81 0.32
82 0.3
83 0.31
84 0.31
85 0.28
86 0.25
87 0.21
88 0.15
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.26
94 0.31
95 0.39
96 0.41
97 0.42
98 0.43
99 0.45
100 0.47
101 0.45
102 0.45
103 0.4
104 0.38
105 0.34
106 0.33
107 0.3
108 0.32
109 0.32
110 0.35
111 0.33
112 0.33
113 0.32
114 0.31
115 0.3
116 0.29
117 0.25
118 0.19
119 0.2
120 0.19
121 0.19
122 0.22
123 0.23
124 0.21
125 0.21
126 0.2
127 0.2
128 0.25
129 0.25
130 0.23
131 0.21
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.09
193 0.16
194 0.18
195 0.23
196 0.32
197 0.33
198 0.36
199 0.39
200 0.44
201 0.45
202 0.51
203 0.49
204 0.42
205 0.4
206 0.38
207 0.34
208 0.25
209 0.18
210 0.1
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.16
220 0.16
221 0.15
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.14
234 0.16
235 0.19
236 0.19
237 0.2
238 0.18
239 0.15
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.16
257 0.16
258 0.12
259 0.13
260 0.2
261 0.28
262 0.34
263 0.42
264 0.42
265 0.51
266 0.61
267 0.69
268 0.71
269 0.72
270 0.74
271 0.74
272 0.8
273 0.71
274 0.68
275 0.61
276 0.56
277 0.54
278 0.48
279 0.44
280 0.37
281 0.38
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.26
286 0.28
287 0.31
288 0.37
289 0.39
290 0.41
291 0.49
292 0.52
293 0.51
294 0.5
295 0.46
296 0.42
297 0.43
298 0.43
299 0.38
300 0.37
301 0.36
302 0.4
303 0.44
304 0.47
305 0.51
306 0.48
307 0.51
308 0.53
309 0.55
310 0.53
311 0.53
312 0.54
313 0.53
314 0.55
315 0.51
316 0.53
317 0.56
318 0.56
319 0.56
320 0.5
321 0.48
322 0.49
323 0.5
324 0.44
325 0.39
326 0.32
327 0.25
328 0.25
329 0.21
330 0.18
331 0.15
332 0.11
333 0.1