Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165Q880

Protein Details
Accession A0A165Q880    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-96DDYVQEKRGLKPKKRSKARKENDDGERRPAQRKRKRRPIAEEDLSQBasic
111-137IEAILKPKKSSRPKRKKKDEEEVLDRFBasic
347-366EIERRKRYADRMRSLSRKVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-88KRGLKPKKRSKARKENDDGERRPAQRKRKRRP
116-128KPKKSSRPKRKKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDIDDANKIERDIFGGSDSELSEEDEVPQPRRRPSPLPADEDESSEESEDDYVQEKRGLKPKKRSKARKENDDGERRPAQRKRKRRPIAEEDLSQLPPEQANKYKLDMQIEAILKPKKSSRPKRKKKDEEEVLDRFADEEVSRLREAMLTAADDDEQANKEKLPATSKLKMLSQVMEVLRKTSLAQSIIDNNLLEGVRRFLEPLPDRSLPALNIQKEIFGILSKLEYIDSAVLKESRLGRVVLFYTKSKRVTPDVARAAETLVSKWSRPIIKRSASYRDRVIPIAQEGDAVGQERLNAILARARESEKNRVRKNAVMIPQRSLGSYTVAPKADAGFRKNNAAVDAEIERRKRYADRMRSLSRKVTAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.12
12 0.14
13 0.19
14 0.22
15 0.26
16 0.33
17 0.36
18 0.42
19 0.48
20 0.52
21 0.52
22 0.56
23 0.63
24 0.63
25 0.65
26 0.62
27 0.61
28 0.56
29 0.52
30 0.47
31 0.38
32 0.31
33 0.24
34 0.2
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.17
43 0.2
44 0.25
45 0.34
46 0.43
47 0.5
48 0.6
49 0.69
50 0.76
51 0.84
52 0.89
53 0.91
54 0.93
55 0.94
56 0.94
57 0.92
58 0.9
59 0.89
60 0.88
61 0.8
62 0.75
63 0.73
64 0.65
65 0.66
66 0.64
67 0.65
68 0.66
69 0.74
70 0.78
71 0.82
72 0.88
73 0.88
74 0.9
75 0.89
76 0.89
77 0.84
78 0.75
79 0.67
80 0.61
81 0.51
82 0.41
83 0.32
84 0.22
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.21
89 0.25
90 0.27
91 0.29
92 0.34
93 0.35
94 0.36
95 0.32
96 0.28
97 0.3
98 0.29
99 0.27
100 0.27
101 0.28
102 0.24
103 0.26
104 0.29
105 0.32
106 0.42
107 0.53
108 0.59
109 0.67
110 0.78
111 0.88
112 0.94
113 0.95
114 0.94
115 0.94
116 0.92
117 0.89
118 0.85
119 0.77
120 0.68
121 0.57
122 0.47
123 0.36
124 0.26
125 0.18
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.13
151 0.16
152 0.21
153 0.25
154 0.29
155 0.31
156 0.31
157 0.3
158 0.31
159 0.28
160 0.24
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.16
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.11
171 0.12
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.12
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.08
189 0.16
190 0.18
191 0.22
192 0.26
193 0.26
194 0.27
195 0.27
196 0.28
197 0.2
198 0.24
199 0.26
200 0.21
201 0.22
202 0.22
203 0.21
204 0.19
205 0.19
206 0.13
207 0.08
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.15
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.23
234 0.28
235 0.3
236 0.3
237 0.32
238 0.34
239 0.4
240 0.42
241 0.46
242 0.47
243 0.46
244 0.45
245 0.41
246 0.37
247 0.32
248 0.27
249 0.18
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.16
254 0.21
255 0.25
256 0.27
257 0.34
258 0.38
259 0.44
260 0.5
261 0.54
262 0.59
263 0.57
264 0.58
265 0.56
266 0.53
267 0.49
268 0.45
269 0.41
270 0.33
271 0.31
272 0.29
273 0.24
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.13
278 0.11
279 0.09
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.1
288 0.11
289 0.14
290 0.16
291 0.19
292 0.25
293 0.3
294 0.4
295 0.46
296 0.56
297 0.59
298 0.65
299 0.67
300 0.65
301 0.68
302 0.66
303 0.66
304 0.65
305 0.61
306 0.56
307 0.55
308 0.5
309 0.43
310 0.37
311 0.28
312 0.23
313 0.23
314 0.24
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.24
319 0.25
320 0.29
321 0.31
322 0.33
323 0.35
324 0.37
325 0.43
326 0.45
327 0.43
328 0.38
329 0.35
330 0.3
331 0.26
332 0.28
333 0.28
334 0.32
335 0.32
336 0.33
337 0.32
338 0.35
339 0.36
340 0.43
341 0.47
342 0.52
343 0.59
344 0.67
345 0.75
346 0.8
347 0.81
348 0.78