Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EHD1

Protein Details
Accession J6EHD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
582-605GYNAESKKNNKDKKRKSTFKLGSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
590-597NNKDKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR021772  WDR48/Bun107  
Pfam View protein in Pfam  
PF11816  DUF3337  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd17041  Ubl_WDR48  
Amino Acid Sequences MDQLTVSYGLISPDYCTSPDAHILPITKILYPDVPGKDYFLTSGRDGSIILHKNTQLSNGLRSKTTASSNDAIRMQVHSDWASDLIHVNMKNTDPSGGDTFISVSHDFSIVLVSVNAQLTTWEKKIIGDHDDYIKCIVPINYDMLHGYGLDEREGSADADYDDTNNRFAIDDRNYFIFATGGLDRKIKVWCLSNGAEKMVTLLHTFDNAQSNDTGSIYSMSSVVPKYNCGDDETARSFDLVAGDCNGDLIFYSCRDRKEVMRIENAHKTNIKVVRTVNDSSRLISTSSDGVINVWDLNCMRDKTSGVIQVPNKIGSWSWDSSIWCVQGTSLDQLYFGDSRGNVMRANLSSYENAKLSRIFKPDRQHHHHHHHEHEEQKTSSNTDAKVKKYGGILDIALLSNGKLLFSFCTDSNLNELNLTDNHFSVNEGGFALTRSSLLTNRRHVITENTRGQMQRWDIVSCELLNTFDLSEGSFDDIVMKYTSKEILSHWCTVSVKVGMLFVKINPKFLKTEIYGSALNDYEVVNNIEVNSDERYNLGKIVINSLFNEFISYEVQRDKLLRKKIFSLKKKDLSNSLTLDTGYNAESKKNNKDKKRKSTFKLGSTLSIGNTNGSVTPPNSAPATPVMRETIALEEQPLLQFPIDKTMDDSLELVQPVAASKKPYFRTQSSGSLLSRKFKSFRSTSGRATTGLNTPEESKGNLLDSAHVINDESAVLQTNNTTQSSKDATPESVLWNHPFKLEQKLSAISSQELPSNRLRSAESSRANSALTLEGSENKNPEFMPDLLEQIQESYRQQYMNTSSLKYLTKRLPVTKIIKASSCPIIKVKSVTLILVHLWKEGSCGGRVLFSTLLPPSRVDSEIVNGGKENSKVPDDEELDLQAVDDDKLGQYDLIDSDLKNRLNRRQIFEQLEENLPYWFAKALFRDIKTVEEQPKLNFLIMPWSVVTRSENDDKKKEASASDSAESSGNDSSDSSLGNVNEAVSPSTQQQFHNMLKFGRPKTSEQELNPTDLPKISEANVKLVAPGMIRVKKIKLYVADRFETKTPEMKAKIEPSIWLDLLCRGQVLENDMTLNTVRTLYWKSQGDILLEYRRKVHSSPLVHEVNGNGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.17
5 0.19
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.25
10 0.26
11 0.26
12 0.3
13 0.28
14 0.24
15 0.24
16 0.24
17 0.22
18 0.23
19 0.29
20 0.28
21 0.29
22 0.28
23 0.3
24 0.29
25 0.28
26 0.27
27 0.23
28 0.23
29 0.22
30 0.24
31 0.22
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.26
36 0.28
37 0.29
38 0.31
39 0.31
40 0.35
41 0.35
42 0.36
43 0.34
44 0.31
45 0.37
46 0.39
47 0.4
48 0.37
49 0.39
50 0.39
51 0.36
52 0.4
53 0.35
54 0.35
55 0.37
56 0.39
57 0.42
58 0.4
59 0.37
60 0.32
61 0.3
62 0.26
63 0.23
64 0.24
65 0.19
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.17
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.22
79 0.21
80 0.21
81 0.17
82 0.21
83 0.23
84 0.21
85 0.2
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.2
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.09
105 0.1
106 0.13
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.2
112 0.25
113 0.28
114 0.3
115 0.28
116 0.3
117 0.36
118 0.37
119 0.36
120 0.33
121 0.3
122 0.25
123 0.25
124 0.22
125 0.17
126 0.18
127 0.21
128 0.2
129 0.2
130 0.2
131 0.17
132 0.17
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.15
156 0.21
157 0.23
158 0.25
159 0.27
160 0.29
161 0.3
162 0.29
163 0.28
164 0.21
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.2
173 0.22
174 0.22
175 0.23
176 0.26
177 0.27
178 0.32
179 0.34
180 0.39
181 0.38
182 0.36
183 0.33
184 0.27
185 0.25
186 0.2
187 0.18
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.19
195 0.19
196 0.2
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.16
202 0.1
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.11
210 0.14
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.2
215 0.2
216 0.21
217 0.23
218 0.21
219 0.28
220 0.29
221 0.29
222 0.26
223 0.25
224 0.22
225 0.2
226 0.2
227 0.14
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.09
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.15
240 0.18
241 0.19
242 0.23
243 0.25
244 0.28
245 0.37
246 0.44
247 0.44
248 0.5
249 0.53
250 0.56
251 0.62
252 0.59
253 0.53
254 0.47
255 0.43
256 0.41
257 0.42
258 0.37
259 0.32
260 0.33
261 0.34
262 0.36
263 0.38
264 0.34
265 0.35
266 0.34
267 0.32
268 0.31
269 0.27
270 0.22
271 0.2
272 0.18
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.22
292 0.27
293 0.24
294 0.3
295 0.3
296 0.34
297 0.34
298 0.33
299 0.28
300 0.23
301 0.21
302 0.18
303 0.22
304 0.18
305 0.17
306 0.19
307 0.2
308 0.22
309 0.24
310 0.22
311 0.16
312 0.15
313 0.14
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.11
327 0.13
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.15
332 0.14
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.16
337 0.18
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.16
342 0.18
343 0.2
344 0.24
345 0.29
346 0.3
347 0.35
348 0.45
349 0.53
350 0.59
351 0.63
352 0.66
353 0.69
354 0.75
355 0.79
356 0.76
357 0.73
358 0.7
359 0.69
360 0.66
361 0.61
362 0.56
363 0.47
364 0.43
365 0.38
366 0.32
367 0.29
368 0.27
369 0.25
370 0.28
371 0.32
372 0.31
373 0.36
374 0.35
375 0.34
376 0.32
377 0.32
378 0.25
379 0.22
380 0.19
381 0.14
382 0.15
383 0.12
384 0.1
385 0.08
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.08
394 0.11
395 0.09
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.17
400 0.18
401 0.16
402 0.14
403 0.14
404 0.12
405 0.13
406 0.15
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.07
424 0.1
425 0.16
426 0.21
427 0.25
428 0.28
429 0.29
430 0.29
431 0.29
432 0.34
433 0.35
434 0.39
435 0.39
436 0.37
437 0.38
438 0.38
439 0.37
440 0.35
441 0.29
442 0.24
443 0.2
444 0.19
445 0.18
446 0.19
447 0.19
448 0.14
449 0.13
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.08
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.18
475 0.21
476 0.23
477 0.22
478 0.23
479 0.23
480 0.23
481 0.24
482 0.16
483 0.13
484 0.11
485 0.12
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.17
491 0.17
492 0.21
493 0.2
494 0.22
495 0.22
496 0.22
497 0.26
498 0.18
499 0.22
500 0.19
501 0.21
502 0.2
503 0.19
504 0.2
505 0.15
506 0.14
507 0.11
508 0.09
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.14
529 0.14
530 0.13
531 0.13
532 0.14
533 0.14
534 0.12
535 0.12
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.12
545 0.16
546 0.21
547 0.3
548 0.31
549 0.32
550 0.39
551 0.47
552 0.55
553 0.59
554 0.61
555 0.61
556 0.65
557 0.67
558 0.61
559 0.59
560 0.52
561 0.48
562 0.41
563 0.33
564 0.26
565 0.23
566 0.22
567 0.16
568 0.13
569 0.09
570 0.09
571 0.08
572 0.1
573 0.13
574 0.17
575 0.27
576 0.35
577 0.43
578 0.51
579 0.62
580 0.7
581 0.78
582 0.85
583 0.85
584 0.81
585 0.84
586 0.81
587 0.76
588 0.71
589 0.61
590 0.52
591 0.45
592 0.41
593 0.3
594 0.24
595 0.18
596 0.12
597 0.11
598 0.1
599 0.08
600 0.07
601 0.08
602 0.06
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.1
607 0.09
608 0.1
609 0.13
610 0.15
611 0.13
612 0.14
613 0.14
614 0.13
615 0.14
616 0.13
617 0.12
618 0.1
619 0.1
620 0.09
621 0.08
622 0.09
623 0.09
624 0.08
625 0.06
626 0.05
627 0.07
628 0.07
629 0.13
630 0.13
631 0.13
632 0.15
633 0.16
634 0.16
635 0.15
636 0.15
637 0.1
638 0.11
639 0.11
640 0.09
641 0.07
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.08
646 0.1
647 0.12
648 0.19
649 0.22
650 0.28
651 0.33
652 0.34
653 0.39
654 0.4
655 0.45
656 0.41
657 0.42
658 0.37
659 0.38
660 0.37
661 0.37
662 0.35
663 0.31
664 0.31
665 0.3
666 0.37
667 0.32
668 0.39
669 0.42
670 0.45
671 0.46
672 0.49
673 0.46
674 0.4
675 0.39
676 0.33
677 0.29
678 0.26
679 0.22
680 0.17
681 0.18
682 0.19
683 0.18
684 0.17
685 0.13
686 0.12
687 0.12
688 0.13
689 0.11
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.08
696 0.07
697 0.07
698 0.06
699 0.05
700 0.04
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.06
705 0.07
706 0.1
707 0.1
708 0.11
709 0.1
710 0.14
711 0.18
712 0.18
713 0.19
714 0.19
715 0.19
716 0.2
717 0.21
718 0.2
719 0.19
720 0.2
721 0.21
722 0.22
723 0.21
724 0.2
725 0.21
726 0.2
727 0.27
728 0.26
729 0.25
730 0.25
731 0.27
732 0.28
733 0.28
734 0.27
735 0.18
736 0.19
737 0.18
738 0.19
739 0.18
740 0.2
741 0.23
742 0.25
743 0.24
744 0.23
745 0.23
746 0.24
747 0.3
748 0.35
749 0.35
750 0.35
751 0.36
752 0.36
753 0.34
754 0.3
755 0.24
756 0.17
757 0.13
758 0.11
759 0.1
760 0.14
761 0.16
762 0.17
763 0.17
764 0.16
765 0.17
766 0.16
767 0.16
768 0.16
769 0.14
770 0.17
771 0.16
772 0.19
773 0.18
774 0.19
775 0.17
776 0.14
777 0.15
778 0.12
779 0.12
780 0.13
781 0.14
782 0.14
783 0.15
784 0.18
785 0.22
786 0.26
787 0.27
788 0.26
789 0.25
790 0.28
791 0.31
792 0.28
793 0.3
794 0.29
795 0.34
796 0.38
797 0.43
798 0.44
799 0.5
800 0.54
801 0.53
802 0.54
803 0.48
804 0.45
805 0.42
806 0.4
807 0.39
808 0.34
809 0.31
810 0.28
811 0.29
812 0.29
813 0.3
814 0.27
815 0.25
816 0.24
817 0.22
818 0.19
819 0.18
820 0.17
821 0.19
822 0.18
823 0.13
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.15
828 0.15
829 0.12
830 0.13
831 0.12
832 0.14
833 0.14
834 0.15
835 0.13
836 0.11
837 0.13
838 0.14
839 0.16
840 0.15
841 0.15
842 0.15
843 0.17
844 0.18
845 0.17
846 0.16
847 0.16
848 0.22
849 0.22
850 0.2
851 0.18
852 0.18
853 0.2
854 0.21
855 0.2
856 0.16
857 0.17
858 0.18
859 0.19
860 0.24
861 0.24
862 0.25
863 0.23
864 0.22
865 0.2
866 0.2
867 0.18
868 0.11
869 0.09
870 0.08
871 0.07
872 0.07
873 0.06
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.06
878 0.07
879 0.08
880 0.09
881 0.1
882 0.1
883 0.15
884 0.21
885 0.24
886 0.27
887 0.32
888 0.38
889 0.47
890 0.54
891 0.56
892 0.58
893 0.64
894 0.65
895 0.63
896 0.59
897 0.52
898 0.49
899 0.43
900 0.36
901 0.27
902 0.22
903 0.18
904 0.15
905 0.12
906 0.1
907 0.13
908 0.15
909 0.23
910 0.29
911 0.3
912 0.33
913 0.32
914 0.35
915 0.35
916 0.4
917 0.38
918 0.37
919 0.38
920 0.36
921 0.4
922 0.38
923 0.34
924 0.28
925 0.22
926 0.25
927 0.23
928 0.22
929 0.17
930 0.18
931 0.17
932 0.18
933 0.2
934 0.15
935 0.2
936 0.28
937 0.34
938 0.4
939 0.45
940 0.47
941 0.48
942 0.49
943 0.46
944 0.4
945 0.38
946 0.37
947 0.37
948 0.35
949 0.32
950 0.29
951 0.27
952 0.25
953 0.22
954 0.17
955 0.12
956 0.11
957 0.11
958 0.12
959 0.12
960 0.12
961 0.11
962 0.13
963 0.13
964 0.14
965 0.14
966 0.13
967 0.13
968 0.14
969 0.14
970 0.11
971 0.12
972 0.15
973 0.2
974 0.22
975 0.21
976 0.27
977 0.32
978 0.37
979 0.41
980 0.41
981 0.38
982 0.43
983 0.51
984 0.47
985 0.49
986 0.47
987 0.46
988 0.51
989 0.58
990 0.57
991 0.51
992 0.58
993 0.52
994 0.53
995 0.5
996 0.44
997 0.37
998 0.31
999 0.3
1000 0.22
1001 0.22
1002 0.19
1003 0.25
1004 0.25
1005 0.28
1006 0.29
1007 0.27
1008 0.25
1009 0.24
1010 0.23
1011 0.17
1012 0.2
1013 0.23
1014 0.25
1015 0.28
1016 0.31
1017 0.34
1018 0.38
1019 0.4
1020 0.42
1021 0.42
1022 0.45
1023 0.52
1024 0.54
1025 0.55
1026 0.52
1027 0.53
1028 0.5
1029 0.46
1030 0.41
1031 0.4
1032 0.37
1033 0.41
1034 0.43
1035 0.42
1036 0.47
1037 0.48
1038 0.5
1039 0.45
1040 0.44
1041 0.39
1042 0.42
1043 0.38
1044 0.32
1045 0.27
1046 0.25
1047 0.27
1048 0.24
1049 0.19
1050 0.14
1051 0.16
1052 0.17
1053 0.22
1054 0.2
1055 0.18
1056 0.19
1057 0.19
1058 0.2
1059 0.18
1060 0.18
1061 0.13
1062 0.12
1063 0.11
1064 0.14
1065 0.2
1066 0.22
1067 0.3
1068 0.32
1069 0.33
1070 0.38
1071 0.4
1072 0.39
1073 0.37
1074 0.38
1075 0.4
1076 0.4
1077 0.4
1078 0.39
1079 0.4
1080 0.4
1081 0.38
1082 0.42
1083 0.42
1084 0.45
1085 0.49
1086 0.53
1087 0.52
1088 0.5
1089 0.5
1090 0.41