Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165SN06

Protein Details
Accession A0A165SN06    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-57GRGQRTQEERGKHRRSRHPNNASVPSKWRRTRVCFPSCTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-38REEPGGRGQRTQEERGKHRRSRHPN
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MVLQLRKVLNGRGREEPGGRGQRTQEERGKHRRSRHPNNASVPSKWRRTRVCFPSCTFTIAMSSTPQDDADRIRLKRLAKLQSAAASTSSSPEPSSGVPTPQPNPSPKPAPIPKPSPAFKRAASQPSAAPVPAPAKRPAAPLKLDLPAWEHETIRDVLRVTLDRGAADASEHELIWLKPLAEELASEEPQQKQPRSLDAEILDRLLIARLELDPQSMSDDLEFLPVLASLPAGQTVFEYLVGCWKRANAARSALTKKNYPPSETHRALTVLDKVRDLLISYAGLTLQEPEMFPQPPGRDLGPPELVQPLLSLSSLSAPLLSSSSPRSTLGPSDIELFLHDLVRRFEPDGELESVLGPVVQHLLWHECLFRPGGIGGGDSSWRGVLGGLEALVAVKPIAVMITKMEAWNPPNATAPTIETVSLMGPLLRLGVFEREWPQIASSYFSEPEKRTRPDVETSFASLRGTLKSLQSTLFQVFNTIVRASPEARENVLQYFARVVALNRRRAGMQVEPDTVSSDAFMVNLQTILLRFAEPFMDAHYSKIDKIDPQYFAHSNRIDLKEETRVNATSEEAGKWEEENRGDGTAPNFISDIFYLALAMNHYGYQKTIQSYDDLAKTIDDMRRHLDMLQGDTSWQGTPFQARAEAAINTVKTEMSKVHMQQFAYETQLSDPELVFRSIGFTTFVSTWLIRFVDPKKKHPSPTIELPLSKDVPLSFRVLPEYLLEDIVDYYLYIVRHTPQSLDLSGKNELVIFCLTFLTSTWYIKNPFLKAKINEILFFGILGYRGERTGVLGGTLNSHPLALKHVMPALMHFYIEVEQTGASSQFYDKFNLYRRNIAYILKAVWDNPVHRDALRNEANNVERFVRFVNLMINDVTYLMDESLSELTQIHNIQAEMEEPSWQTKPPQVRREREATLRQLERHAIGYTTLGRSTVDMLKIFTAETKGPFMMPEIVGRLAAMLDYNLDVLINRTAELKVKEPEKYKFEPRRLLSDILQVYLNLSDQGEFARAVAEDGRSYKKELFEKAMYIARHRNLKTPDEVELLRLFVVKVEETKATIEAEEDLGDIPDEFLDPLMFTLMRDPVTLPSSKAVVDRSTIKAHLLSDSKDPFNRQPLSVEDVVPNPELKAKIDTFLADRRRKGTALDVPPEDIVNMNNETEDAQMQET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.48
4 0.52
5 0.54
6 0.51
7 0.48
8 0.47
9 0.52
10 0.56
11 0.6
12 0.57
13 0.56
14 0.64
15 0.71
16 0.77
17 0.75
18 0.79
19 0.82
20 0.86
21 0.88
22 0.9
23 0.89
24 0.88
25 0.89
26 0.89
27 0.82
28 0.76
29 0.75
30 0.72
31 0.72
32 0.69
33 0.69
34 0.68
35 0.73
36 0.79
37 0.8
38 0.81
39 0.78
40 0.76
41 0.75
42 0.67
43 0.62
44 0.52
45 0.42
46 0.36
47 0.29
48 0.25
49 0.2
50 0.2
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.33
60 0.38
61 0.41
62 0.43
63 0.48
64 0.53
65 0.53
66 0.51
67 0.53
68 0.52
69 0.52
70 0.52
71 0.45
72 0.37
73 0.3
74 0.24
75 0.24
76 0.21
77 0.17
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.21
83 0.2
84 0.23
85 0.26
86 0.32
87 0.34
88 0.39
89 0.44
90 0.45
91 0.49
92 0.52
93 0.55
94 0.52
95 0.59
96 0.61
97 0.64
98 0.66
99 0.66
100 0.66
101 0.68
102 0.71
103 0.68
104 0.65
105 0.62
106 0.55
107 0.57
108 0.58
109 0.57
110 0.54
111 0.49
112 0.44
113 0.44
114 0.44
115 0.35
116 0.27
117 0.23
118 0.26
119 0.28
120 0.3
121 0.29
122 0.32
123 0.34
124 0.41
125 0.45
126 0.45
127 0.44
128 0.45
129 0.45
130 0.43
131 0.41
132 0.35
133 0.31
134 0.27
135 0.28
136 0.26
137 0.22
138 0.2
139 0.23
140 0.24
141 0.22
142 0.21
143 0.18
144 0.17
145 0.21
146 0.22
147 0.2
148 0.23
149 0.22
150 0.19
151 0.19
152 0.18
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.12
161 0.12
162 0.15
163 0.16
164 0.13
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.17
172 0.17
173 0.18
174 0.21
175 0.23
176 0.31
177 0.38
178 0.36
179 0.37
180 0.38
181 0.45
182 0.49
183 0.47
184 0.45
185 0.4
186 0.42
187 0.36
188 0.34
189 0.26
190 0.18
191 0.17
192 0.13
193 0.11
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.08
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.22
233 0.26
234 0.29
235 0.26
236 0.31
237 0.36
238 0.42
239 0.48
240 0.48
241 0.46
242 0.48
243 0.48
244 0.53
245 0.51
246 0.47
247 0.47
248 0.49
249 0.56
250 0.54
251 0.49
252 0.42
253 0.4
254 0.37
255 0.34
256 0.34
257 0.31
258 0.29
259 0.29
260 0.27
261 0.26
262 0.25
263 0.23
264 0.16
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.09
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.23
287 0.28
288 0.26
289 0.25
290 0.25
291 0.24
292 0.22
293 0.19
294 0.16
295 0.11
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.19
316 0.21
317 0.19
318 0.17
319 0.19
320 0.18
321 0.17
322 0.16
323 0.15
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.12
328 0.14
329 0.16
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.15
339 0.14
340 0.13
341 0.11
342 0.1
343 0.06
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.11
354 0.13
355 0.14
356 0.12
357 0.1
358 0.09
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.04
387 0.04
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.11
393 0.12
394 0.16
395 0.17
396 0.16
397 0.19
398 0.2
399 0.2
400 0.18
401 0.18
402 0.15
403 0.15
404 0.14
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.07
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.15
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.14
429 0.15
430 0.15
431 0.16
432 0.2
433 0.19
434 0.26
435 0.3
436 0.32
437 0.33
438 0.36
439 0.38
440 0.41
441 0.42
442 0.38
443 0.33
444 0.33
445 0.31
446 0.27
447 0.23
448 0.17
449 0.16
450 0.13
451 0.13
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.11
467 0.09
468 0.09
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.15
477 0.14
478 0.17
479 0.15
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.16
487 0.22
488 0.27
489 0.27
490 0.28
491 0.27
492 0.28
493 0.3
494 0.25
495 0.24
496 0.23
497 0.23
498 0.23
499 0.23
500 0.23
501 0.2
502 0.16
503 0.1
504 0.07
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.12
532 0.16
533 0.2
534 0.2
535 0.2
536 0.24
537 0.25
538 0.26
539 0.3
540 0.26
541 0.24
542 0.27
543 0.29
544 0.26
545 0.25
546 0.25
547 0.26
548 0.27
549 0.26
550 0.22
551 0.2
552 0.19
553 0.18
554 0.17
555 0.12
556 0.12
557 0.11
558 0.1
559 0.09
560 0.09
561 0.08
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.12
570 0.11
571 0.12
572 0.12
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.09
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.09
593 0.1
594 0.11
595 0.1
596 0.11
597 0.13
598 0.15
599 0.15
600 0.13
601 0.12
602 0.11
603 0.11
604 0.14
605 0.15
606 0.13
607 0.14
608 0.16
609 0.17
610 0.18
611 0.17
612 0.17
613 0.15
614 0.16
615 0.16
616 0.13
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.09
621 0.08
622 0.07
623 0.06
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.11
631 0.1
632 0.1
633 0.11
634 0.11
635 0.1
636 0.11
637 0.09
638 0.08
639 0.09
640 0.08
641 0.09
642 0.13
643 0.15
644 0.21
645 0.24
646 0.24
647 0.24
648 0.26
649 0.23
650 0.22
651 0.2
652 0.14
653 0.11
654 0.12
655 0.11
656 0.1
657 0.09
658 0.08
659 0.09
660 0.09
661 0.09
662 0.08
663 0.1
664 0.09
665 0.09
666 0.09
667 0.08
668 0.09
669 0.1
670 0.11
671 0.1
672 0.1
673 0.1
674 0.1
675 0.11
676 0.09
677 0.13
678 0.18
679 0.27
680 0.3
681 0.37
682 0.45
683 0.5
684 0.54
685 0.57
686 0.6
687 0.56
688 0.61
689 0.61
690 0.54
691 0.49
692 0.48
693 0.44
694 0.37
695 0.31
696 0.23
697 0.16
698 0.15
699 0.16
700 0.17
701 0.14
702 0.14
703 0.15
704 0.15
705 0.15
706 0.13
707 0.14
708 0.11
709 0.11
710 0.1
711 0.08
712 0.08
713 0.07
714 0.06
715 0.04
716 0.04
717 0.06
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.09
722 0.11
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.15
727 0.16
728 0.18
729 0.18
730 0.19
731 0.2
732 0.19
733 0.16
734 0.15
735 0.14
736 0.13
737 0.12
738 0.09
739 0.08
740 0.08
741 0.07
742 0.06
743 0.07
744 0.1
745 0.11
746 0.12
747 0.13
748 0.16
749 0.19
750 0.22
751 0.27
752 0.25
753 0.29
754 0.32
755 0.38
756 0.37
757 0.41
758 0.43
759 0.4
760 0.37
761 0.33
762 0.3
763 0.22
764 0.2
765 0.13
766 0.08
767 0.07
768 0.07
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.09
776 0.08
777 0.08
778 0.09
779 0.09
780 0.11
781 0.11
782 0.11
783 0.09
784 0.1
785 0.09
786 0.08
787 0.12
788 0.11
789 0.12
790 0.13
791 0.14
792 0.15
793 0.15
794 0.15
795 0.16
796 0.14
797 0.13
798 0.12
799 0.11
800 0.11
801 0.11
802 0.1
803 0.06
804 0.06
805 0.06
806 0.07
807 0.06
808 0.06
809 0.06
810 0.07
811 0.11
812 0.13
813 0.15
814 0.15
815 0.19
816 0.27
817 0.36
818 0.37
819 0.4
820 0.4
821 0.43
822 0.44
823 0.41
824 0.36
825 0.29
826 0.28
827 0.22
828 0.21
829 0.16
830 0.19
831 0.2
832 0.19
833 0.2
834 0.21
835 0.21
836 0.21
837 0.26
838 0.23
839 0.29
840 0.33
841 0.31
842 0.3
843 0.34
844 0.37
845 0.34
846 0.34
847 0.28
848 0.22
849 0.22
850 0.22
851 0.18
852 0.15
853 0.14
854 0.16
855 0.15
856 0.16
857 0.15
858 0.14
859 0.13
860 0.13
861 0.12
862 0.07
863 0.07
864 0.05
865 0.05
866 0.05
867 0.06
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.11
874 0.11
875 0.1
876 0.11
877 0.11
878 0.11
879 0.11
880 0.11
881 0.1
882 0.1
883 0.11
884 0.1
885 0.13
886 0.14
887 0.14
888 0.15
889 0.19
890 0.29
891 0.37
892 0.47
893 0.54
894 0.6
895 0.65
896 0.7
897 0.7
898 0.68
899 0.66
900 0.63
901 0.62
902 0.6
903 0.55
904 0.51
905 0.49
906 0.42
907 0.36
908 0.3
909 0.22
910 0.18
911 0.18
912 0.18
913 0.17
914 0.16
915 0.14
916 0.13
917 0.13
918 0.16
919 0.18
920 0.18
921 0.16
922 0.17
923 0.18
924 0.18
925 0.17
926 0.15
927 0.14
928 0.13
929 0.14
930 0.16
931 0.16
932 0.16
933 0.16
934 0.16
935 0.17
936 0.16
937 0.16
938 0.15
939 0.16
940 0.15
941 0.15
942 0.13
943 0.09
944 0.08
945 0.07
946 0.04
947 0.05
948 0.05
949 0.05
950 0.05
951 0.05
952 0.05
953 0.07
954 0.09
955 0.09
956 0.09
957 0.1
958 0.11
959 0.16
960 0.19
961 0.22
962 0.25
963 0.28
964 0.34
965 0.39
966 0.45
967 0.47
968 0.51
969 0.57
970 0.62
971 0.66
972 0.7
973 0.67
974 0.68
975 0.66
976 0.64
977 0.55
978 0.53
979 0.46
980 0.38
981 0.35
982 0.26
983 0.23
984 0.19
985 0.17
986 0.1
987 0.09
988 0.08
989 0.08
990 0.09
991 0.09
992 0.09
993 0.08
994 0.09
995 0.08
996 0.09
997 0.11
998 0.11
999 0.12
1000 0.15
1001 0.21
1002 0.21
1003 0.25
1004 0.27
1005 0.32
1006 0.37
1007 0.4
1008 0.43
1009 0.41
1010 0.41
1011 0.42
1012 0.44
1013 0.39
1014 0.38
1015 0.41
1016 0.39
1017 0.45
1018 0.45
1019 0.49
1020 0.49
1021 0.53
1022 0.54
1023 0.49
1024 0.48
1025 0.44
1026 0.43
1027 0.38
1028 0.33
1029 0.29
1030 0.22
1031 0.2
1032 0.16
1033 0.13
1034 0.14
1035 0.12
1036 0.13
1037 0.15
1038 0.16
1039 0.17
1040 0.18
1041 0.18
1042 0.16
1043 0.15
1044 0.14
1045 0.13
1046 0.12
1047 0.11
1048 0.1
1049 0.09
1050 0.09
1051 0.09
1052 0.08
1053 0.07
1054 0.06
1055 0.07
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.06
1059 0.06
1060 0.06
1061 0.08
1062 0.08
1063 0.08
1064 0.11
1065 0.13
1066 0.14
1067 0.14
1068 0.15
1069 0.17
1070 0.21
1071 0.22
1072 0.2
1073 0.2
1074 0.21
1075 0.21
1076 0.23
1077 0.22
1078 0.2
1079 0.23
1080 0.27
1081 0.29
1082 0.32
1083 0.31
1084 0.31
1085 0.3
1086 0.29
1087 0.32
1088 0.3
1089 0.28
1090 0.32
1091 0.37
1092 0.4
1093 0.41
1094 0.45
1095 0.45
1096 0.51
1097 0.52
1098 0.45
1099 0.43
1100 0.42
1101 0.46
1102 0.43
1103 0.38
1104 0.32
1105 0.31
1106 0.32
1107 0.3
1108 0.26
1109 0.2
1110 0.22
1111 0.22
1112 0.21
1113 0.25
1114 0.24
1115 0.25
1116 0.26
1117 0.27
1118 0.27
1119 0.34
1120 0.42
1121 0.43
1122 0.46
1123 0.47
1124 0.49
1125 0.48
1126 0.46
1127 0.47
1128 0.47
1129 0.49
1130 0.52
1131 0.5
1132 0.49
1133 0.48
1134 0.46
1135 0.37
1136 0.27
1137 0.2
1138 0.17
1139 0.16
1140 0.14
1141 0.14
1142 0.14
1143 0.14
1144 0.15
1145 0.15