Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5RFW0

Protein Details
Accession J5RFW0    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MNNNNRNNRNRNINNRNKKQLQQAKNKNENIHIHydrophilic
331-350VANPTKYEYLKKKQEQESSKHydrophilic
361-383EAKKVDGTKQSEKQRKRLKDLYGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021715  Slu7_dom  
IPR039974  Splicing_factor_SLU7  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF11708  Slu7  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNNNNRNNRNRNINNRNKKQLQQAKNKNENIHIPRYIRNQPWYYKDDSKGREKEESGNDGKSVAEEGEKSDYLLHHRQKVKGGALDIDNNSEPKIGLGIKDEFKIIKLRKDSAGDYEPSKFCRNCGETGHRKKDCMEKPRKVQKVIPDSTSTDVGKNTVLIRGTDDDWDSKKDRWYGYSGKEYNELVRKWEQNKKNDVNLKDKSQTDETLWDTDEEIELMKLELYKDTVGSLKKDNPENSQLYRVSTRLREDRAAYLNDINSAESNYDPKSRLYKSSALGTVDEKSKMFRRHLTGEGLKLSDLNQFARSHAKQMGIRDEVEDKEKVEHVLVANPTKYEYLKKKQEQESSKELKTVSISELEAKKVDGTKQSEKQRKRLKDLYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.89
3 0.92
4 0.88
5 0.85
6 0.85
7 0.84
8 0.83
9 0.83
10 0.85
11 0.85
12 0.88
13 0.88
14 0.81
15 0.76
16 0.76
17 0.72
18 0.69
19 0.64
20 0.57
21 0.57
22 0.6
23 0.63
24 0.6
25 0.61
26 0.6
27 0.6
28 0.64
29 0.62
30 0.62
31 0.61
32 0.61
33 0.62
34 0.61
35 0.65
36 0.64
37 0.65
38 0.64
39 0.58
40 0.59
41 0.57
42 0.59
43 0.52
44 0.47
45 0.42
46 0.36
47 0.33
48 0.25
49 0.2
50 0.13
51 0.11
52 0.09
53 0.12
54 0.16
55 0.16
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.22
60 0.31
61 0.34
62 0.38
63 0.43
64 0.46
65 0.51
66 0.56
67 0.54
68 0.48
69 0.44
70 0.39
71 0.36
72 0.38
73 0.32
74 0.3
75 0.26
76 0.23
77 0.21
78 0.18
79 0.15
80 0.1
81 0.12
82 0.09
83 0.09
84 0.13
85 0.17
86 0.18
87 0.19
88 0.2
89 0.18
90 0.19
91 0.26
92 0.25
93 0.28
94 0.3
95 0.33
96 0.36
97 0.39
98 0.39
99 0.37
100 0.38
101 0.33
102 0.31
103 0.34
104 0.31
105 0.31
106 0.36
107 0.29
108 0.26
109 0.33
110 0.34
111 0.32
112 0.37
113 0.43
114 0.48
115 0.58
116 0.67
117 0.6
118 0.58
119 0.58
120 0.62
121 0.6
122 0.6
123 0.6
124 0.59
125 0.68
126 0.77
127 0.8
128 0.74
129 0.7
130 0.68
131 0.68
132 0.62
133 0.54
134 0.47
135 0.42
136 0.4
137 0.39
138 0.31
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.21
159 0.24
160 0.24
161 0.24
162 0.28
163 0.3
164 0.32
165 0.39
166 0.37
167 0.34
168 0.36
169 0.34
170 0.33
171 0.33
172 0.28
173 0.23
174 0.26
175 0.29
176 0.33
177 0.41
178 0.44
179 0.45
180 0.54
181 0.54
182 0.57
183 0.59
184 0.58
185 0.57
186 0.53
187 0.5
188 0.46
189 0.43
190 0.39
191 0.35
192 0.32
193 0.25
194 0.25
195 0.23
196 0.19
197 0.19
198 0.16
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.16
219 0.2
220 0.24
221 0.3
222 0.32
223 0.33
224 0.38
225 0.4
226 0.38
227 0.39
228 0.35
229 0.33
230 0.32
231 0.29
232 0.26
233 0.26
234 0.29
235 0.29
236 0.32
237 0.32
238 0.32
239 0.36
240 0.36
241 0.35
242 0.31
243 0.28
244 0.25
245 0.24
246 0.22
247 0.17
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.14
255 0.15
256 0.17
257 0.23
258 0.25
259 0.29
260 0.32
261 0.36
262 0.35
263 0.4
264 0.41
265 0.35
266 0.34
267 0.31
268 0.29
269 0.26
270 0.25
271 0.19
272 0.2
273 0.26
274 0.3
275 0.33
276 0.36
277 0.4
278 0.44
279 0.48
280 0.52
281 0.49
282 0.47
283 0.45
284 0.39
285 0.33
286 0.27
287 0.25
288 0.2
289 0.18
290 0.16
291 0.18
292 0.18
293 0.19
294 0.28
295 0.28
296 0.28
297 0.3
298 0.33
299 0.33
300 0.37
301 0.43
302 0.37
303 0.37
304 0.35
305 0.35
306 0.31
307 0.32
308 0.28
309 0.21
310 0.21
311 0.22
312 0.21
313 0.18
314 0.19
315 0.16
316 0.21
317 0.24
318 0.26
319 0.26
320 0.25
321 0.26
322 0.25
323 0.26
324 0.29
325 0.34
326 0.4
327 0.5
328 0.57
329 0.66
330 0.72
331 0.81
332 0.8
333 0.78
334 0.78
335 0.75
336 0.68
337 0.62
338 0.54
339 0.46
340 0.41
341 0.36
342 0.29
343 0.24
344 0.24
345 0.28
346 0.3
347 0.29
348 0.27
349 0.25
350 0.26
351 0.27
352 0.3
353 0.31
354 0.36
355 0.44
356 0.52
357 0.62
358 0.68
359 0.72
360 0.79
361 0.81
362 0.83
363 0.83