FuNGI

A0A165NHC3

Protein Details

Accession

A0A165NHC3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
128-147	LRKAKDAKEKRERESSKKCA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
131-139	AKDAKEKRE

Subcellular Location(s)

plas 13, nucl 7, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MDRKQQIIGSVIERKPGASASTSTTKDLRGMGSQHRSKSTFTRGREEASRKGGKERVREVPVIQTTLNEIVAPRRSTLDGVAVRRAGGGRREVSEENQRRVEDMSQEELEQERRDILERFGTGVGDILRKAKDAKEKRERESSKKCAVVSEGKVSTKPEEMENEVVHEVNFSLSPPSPWCALSRNSTRPPSRADRKLRFAELIPEDVHVYQSAPPSPKRKTLALMAPSASDREDKSIISLVRESSPVALQSNGTDELAELEEGTPEDIRRRFFPNMPVDDPTLAWITSHPSHDPTSPSSLRFDLTGTPISASLSTSIPTHLGLHHHAEGTHAGYTIDDIFTLSRSTMPAQRATMLDVLARIAKGLGIEELRERILASGIEAMSQQGSVGIMAVDALWVCIVGWDQELVDIEGVEFVESIPPSLVADESNGSKKPATRRDPISTLPLDYLLSQISEALSTGALPETSLAQLLDILHRLGQYSNDYATAIVAETKLLSSVLSVFLLAPIPPAPTSPLPNPLVIQLLSTLALASRSNASTAANYADALLRFVVTLPPESPYSQSLAIALLASTLEFYTVLASYGLYASIATTAAEHFHSLGNYVLSKCISKRSMSAWSNLLAAWIVCATDPHQTTPSHEILWSQVDVWAAVWITVAAWLQDARVNGIKGGEEASRRLLNATVVSQSIENLQHFLQQLASIDNSLESTETEILVGLTEISKEMKALVAVLRLWLSCTSPLSDDSLALPGTTPDLRLAQACTIIQRVLLGDEDFTQQTLEHMMTRWNVPNAVWENRDMDIIMPFCVHSVRPQLDEEEQYEDVQPLTLTPRSIALAATQRVPSLSTLRLRLGRDFGVPLPRDWSYTPLDYLLQSRTSPIFKVLPSNWSASETDVTRSVLLLGKTMREVLRAHSLGSGFSMTREETVFGCMKVFMLEHGQNQENDSLQDEAFRDGAVGSFMADLLTPFFWANASSALVHLSRRFLGSSTPFYHFYTEFLGLYDSISFSHLLFTRLLLPPSSMCCPIDYRKLLWVNFHHTLRTIRTPVEDVLTGDLVQYLYPVKSDKAIVATYLGALVTSDASHSFLRFVAAHYIAAHIWKDLQPGGESIDEERADKLIKAVITQGDRNTVKEVVPYKQDPLFPSRCYKQSGVWKDERLHQVERWGLKERLQGLLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.31
3	0.29
4	0.25
5	0.19
6	0.21
7	0.23
8	0.3
9	0.32
10	0.34
11	0.34
12	0.33
13	0.32
14	0.33
15	0.29
16	0.26
17	0.3
18	0.36
19	0.45
20	0.5
21	0.52
22	0.56
23	0.55
24	0.54
25	0.56
26	0.58
27	0.56
28	0.55
29	0.59
30	0.55
31	0.59
32	0.64
33	0.63
34	0.6
35	0.61
36	0.63
37	0.56
38	0.61
39	0.62
40	0.59
41	0.62
42	0.62
43	0.62
44	0.6
45	0.61
46	0.55
47	0.58
48	0.55
49	0.48
50	0.41
51	0.32
52	0.3
53	0.29
54	0.27
55	0.18
56	0.15
57	0.18
58	0.25
59	0.26
60	0.23
61	0.24
62	0.26
63	0.26
64	0.27
65	0.3
66	0.3
67	0.32
68	0.35
69	0.33
70	0.32
71	0.32
72	0.32
73	0.27
74	0.26
75	0.29
76	0.28
77	0.3
78	0.35
79	0.35
80	0.39
81	0.46
82	0.49
83	0.49
84	0.51
85	0.49
86	0.45
87	0.45
88	0.43
89	0.38
90	0.34
91	0.34
92	0.3
93	0.3
94	0.3
95	0.29
96	0.29
97	0.25
98	0.21
99	0.17
100	0.17
101	0.2
102	0.21
103	0.21
104	0.24
105	0.23
106	0.24
107	0.23
108	0.22
109	0.19
110	0.2
111	0.19
112	0.14
113	0.15
114	0.16
115	0.16
116	0.17
117	0.2
118	0.23
119	0.32
120	0.4
121	0.5
122	0.57
123	0.65
124	0.7
125	0.78
126	0.8
127	0.79
128	0.81
129	0.79
130	0.76
131	0.73
132	0.67
133	0.59
134	0.58
135	0.56
136	0.5
137	0.49
138	0.45
139	0.42
140	0.43
141	0.42
142	0.39
143	0.35
144	0.31
145	0.26
146	0.26
147	0.29
148	0.32
149	0.3
150	0.31
151	0.27
152	0.26
153	0.22
154	0.18
155	0.14
156	0.1
157	0.1
158	0.07
159	0.1
160	0.1
161	0.12
162	0.14
163	0.16
164	0.17
165	0.18
166	0.19
167	0.21
168	0.24
169	0.31
170	0.38
171	0.44
172	0.5
173	0.58
174	0.61
175	0.59
176	0.63
177	0.65
178	0.66
179	0.67
180	0.7
181	0.7
182	0.74
183	0.77
184	0.73
185	0.66
186	0.57
187	0.56
188	0.48
189	0.42
190	0.34
191	0.29
192	0.27
193	0.24
194	0.23
195	0.15
196	0.13
197	0.13
198	0.15
199	0.19
200	0.22
201	0.28
202	0.35
203	0.39
204	0.45
205	0.47
206	0.47
207	0.46
208	0.5
209	0.53
210	0.49
211	0.48
212	0.41
213	0.38
214	0.35
215	0.32
216	0.26
217	0.19
218	0.15
219	0.16
220	0.17
221	0.15
222	0.17
223	0.22
224	0.21
225	0.22
226	0.23
227	0.2
228	0.2
229	0.21
230	0.19
231	0.15
232	0.16
233	0.15
234	0.14
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.15
239	0.14
240	0.13
241	0.11
242	0.1
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.13
254	0.16
255	0.18
256	0.2
257	0.26
258	0.3
259	0.33
260	0.41
261	0.44
262	0.48
263	0.49
264	0.49
265	0.45
266	0.41
267	0.37
268	0.3
269	0.23
270	0.16
271	0.13
272	0.11
273	0.14
274	0.16
275	0.18
276	0.17
277	0.19
278	0.21
279	0.23
280	0.26
281	0.24
282	0.29
283	0.29
284	0.29
285	0.3
286	0.28
287	0.26
288	0.24
289	0.22
290	0.16
291	0.17
292	0.18
293	0.16
294	0.15
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.12
299	0.11
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.12
309	0.14
310	0.18
311	0.19
312	0.19
313	0.18
314	0.19
315	0.18
316	0.17
317	0.15
318	0.11
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.09
323	0.08
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.08
332	0.1
333	0.15
334	0.17
335	0.2
336	0.2
337	0.22
338	0.22
339	0.23
340	0.22
341	0.17
342	0.15
343	0.12
344	0.12
345	0.1
346	0.1
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.1
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.02
384	0.02
385	0.02
386	0.03
387	0.03
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.03
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.05
412	0.06
413	0.07
414	0.08
415	0.11
416	0.12
417	0.12
418	0.13
419	0.17
420	0.25
421	0.33
422	0.38
423	0.42
424	0.48
425	0.53
426	0.56
427	0.54
428	0.52
429	0.43
430	0.37
431	0.31
432	0.25
433	0.19
434	0.15
435	0.14
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.04
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.08
466	0.09
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.09
473	0.08
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.09
498	0.1
499	0.13
500	0.14
501	0.2
502	0.21
503	0.21
504	0.21
505	0.19
506	0.19
507	0.16
508	0.14
509	0.09
510	0.08
511	0.07
512	0.07
513	0.06
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.07
533	0.06
534	0.05
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.07
539	0.07
540	0.08
541	0.09
542	0.1
543	0.11
544	0.11
545	0.12
546	0.12
547	0.11
548	0.1
549	0.09
550	0.08
551	0.07
552	0.06
553	0.04
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.09
591	0.09
592	0.14
593	0.15
594	0.14
595	0.16
596	0.19
597	0.28
598	0.28
599	0.3
600	0.26
601	0.25
602	0.25
603	0.23
604	0.19
605	0.1
606	0.08
607	0.06
608	0.05
609	0.04
610	0.03
611	0.04
612	0.04
613	0.09
614	0.1
615	0.11
616	0.14
617	0.14
618	0.18
619	0.22
620	0.23
621	0.18
622	0.18
623	0.17
624	0.15
625	0.17
626	0.14
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.08
633	0.06
634	0.06
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.03
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.07
645	0.07
646	0.08
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.11
651	0.11
652	0.09
653	0.11
654	0.11
655	0.09
656	0.1
657	0.13
658	0.13
659	0.13
660	0.13
661	0.12
662	0.11
663	0.11
664	0.11
665	0.09
666	0.09
667	0.1
668	0.09
669	0.08
670	0.1
671	0.1
672	0.09
673	0.1
674	0.1
675	0.12
676	0.13
677	0.13
678	0.11
679	0.1
680	0.1
681	0.1
682	0.1
683	0.07
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.05
689	0.04
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.05
697	0.05
698	0.04
699	0.03
700	0.03
701	0.04
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.05
707	0.05
708	0.06
709	0.07
710	0.08
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.08
715	0.09
716	0.09
717	0.09
718	0.08
719	0.09
720	0.1
721	0.1
722	0.11
723	0.13
724	0.13
725	0.12
726	0.12
727	0.13
728	0.11
729	0.1
730	0.09
731	0.06
732	0.08
733	0.08
734	0.08
735	0.07
736	0.08
737	0.09
738	0.1
739	0.11
740	0.1
741	0.11
742	0.11
743	0.11
744	0.11
745	0.11
746	0.1
747	0.09
748	0.08
749	0.07
750	0.08
751	0.07
752	0.06
753	0.08
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.08
758	0.07
759	0.08
760	0.09
761	0.08
762	0.07
763	0.07
764	0.1
765	0.11
766	0.14
767	0.17
768	0.16
769	0.17
770	0.16
771	0.22
772	0.24
773	0.27
774	0.25
775	0.23
776	0.24
777	0.24
778	0.24
779	0.18
780	0.14
781	0.12
782	0.12
783	0.11
784	0.09
785	0.08
786	0.09
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.16
791	0.17
792	0.19
793	0.2
794	0.23
795	0.25
796	0.27
797	0.25
798	0.23
799	0.21
800	0.2
801	0.19
802	0.17
803	0.14
804	0.13
805	0.11
806	0.07
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.1
811	0.11
812	0.12
813	0.12
814	0.12
815	0.12
816	0.17
817	0.18
818	0.2
819	0.19
820	0.18
821	0.18
822	0.19
823	0.17
824	0.14
825	0.18
826	0.19
827	0.21
828	0.24
829	0.29
830	0.3
831	0.3
832	0.3
833	0.27
834	0.25
835	0.25
836	0.24
837	0.27
838	0.27
839	0.25
840	0.25
841	0.24
842	0.25
843	0.23
844	0.25
845	0.21
846	0.21
847	0.22
848	0.19
849	0.2
850	0.18
851	0.2
852	0.19
853	0.16
854	0.15
855	0.16
856	0.18
857	0.18
858	0.18
859	0.19
860	0.2
861	0.19
862	0.26
863	0.25
864	0.27
865	0.28
866	0.3
867	0.27
868	0.26
869	0.26
870	0.21
871	0.22
872	0.19
873	0.18
874	0.18
875	0.18
876	0.15
877	0.15
878	0.14
879	0.15
880	0.14
881	0.15
882	0.14
883	0.14
884	0.15
885	0.18
886	0.17
887	0.16
888	0.17
889	0.17
890	0.25
891	0.25
892	0.25
893	0.24
894	0.24
895	0.21
896	0.22
897	0.2
898	0.11
899	0.11
900	0.12
901	0.1
902	0.11
903	0.11
904	0.11
905	0.1
906	0.15
907	0.15
908	0.14
909	0.14
910	0.13
911	0.13
912	0.12
913	0.12
914	0.09
915	0.14
916	0.16
917	0.18
918	0.23
919	0.25
920	0.25
921	0.26
922	0.26
923	0.21
924	0.19
925	0.18
926	0.15
927	0.12
928	0.15
929	0.14
930	0.14
931	0.13
932	0.12
933	0.11
934	0.09
935	0.09
936	0.07
937	0.06
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.05
942	0.05
943	0.05
944	0.06
945	0.06
946	0.07
947	0.07
948	0.07
949	0.07
950	0.08
951	0.09
952	0.08
953	0.1
954	0.09
955	0.09
956	0.11
957	0.12
958	0.13
959	0.14
960	0.15
961	0.15
962	0.16
963	0.16
964	0.15
965	0.2
966	0.23
967	0.29
968	0.3
969	0.33
970	0.34
971	0.35
972	0.38
973	0.32
974	0.28
975	0.26
976	0.24
977	0.2
978	0.18
979	0.18
980	0.15
981	0.15
982	0.14
983	0.1
984	0.08
985	0.09
986	0.09
987	0.08
988	0.12
989	0.13
990	0.14
991	0.14
992	0.15
993	0.2
994	0.22
995	0.23
996	0.19
997	0.2
998	0.2
999	0.24
1000	0.26
1001	0.23
1002	0.21
1003	0.21
1004	0.26
1005	0.3
1006	0.37
1007	0.36
1008	0.35
1009	0.41
1010	0.47
1011	0.46
1012	0.48
1013	0.48
1014	0.47
1015	0.51
1016	0.51
1017	0.43
1018	0.4
1019	0.43
1020	0.42
1021	0.44
1022	0.38
1023	0.33
1024	0.35
1025	0.37
1026	0.35
1027	0.34
1028	0.29
1029	0.23
1030	0.23
1031	0.22
1032	0.18
1033	0.15
1034	0.15
1035	0.11
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.09
1039	0.08
1040	0.1
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.14
1044	0.16
1045	0.17
1046	0.19
1047	0.19
1048	0.18
1049	0.18
1050	0.18
1051	0.15
1052	0.14
1053	0.12
1054	0.08
1055	0.07
1056	0.07
1057	0.06
1058	0.06
1059	0.06
1060	0.06
1061	0.09
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.11
1065	0.11
1066	0.14
1067	0.14
1068	0.15
1069	0.19
1070	0.19
1071	0.2
1072	0.19
1073	0.21
1074	0.18
1075	0.2
1076	0.19
1077	0.13
1078	0.15
1079	0.16
1080	0.18
1081	0.18
1082	0.2
1083	0.19
1084	0.19
1085	0.21
1086	0.2
1087	0.19
1088	0.18
1089	0.22
1090	0.2
1091	0.2
1092	0.2
1093	0.19
1094	0.19
1095	0.18
1096	0.18
1097	0.16
1098	0.16
1099	0.16
1100	0.19
1101	0.24
1102	0.27
1103	0.3
1104	0.31
1105	0.36
1106	0.37
1107	0.38
1108	0.37
1109	0.33
1110	0.29
1111	0.32
1112	0.34
1113	0.31
1114	0.37
1115	0.38
1116	0.39
1117	0.41
1118	0.44
1119	0.41
1120	0.46
1121	0.47
1122	0.43
1123	0.49
1124	0.51
1125	0.51
1126	0.54
1127	0.52
1128	0.52
1129	0.57
1130	0.63
1131	0.63
1132	0.64
1133	0.66
1134	0.64
1135	0.7
1136	0.7
1137	0.65
1138	0.6
1139	0.53
1140	0.53
1141	0.54
1142	0.54
1143	0.5
1144	0.49
1145	0.46
1146	0.46
1147	0.5
1148	0.45

A0A165NHC3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer