Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165U2D6

Protein Details
Accession A0A165U2D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-264SSSSSRRRIKHAKIEKREWAHVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
501-551RKQDKEREAAGLPPVHRVGARGAASAQRGQRGGQRGGPPARGAPQRGGGRG
Subcellular Location(s) cyto 12.5cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MSSEHEQFLDYIINPKRENAERLLKELGLAGIPDRQKIHEQIEERFLLPKDTLPAHWLPKYQVHWERKLEIPSLLKVAPSPPPTTVSFVRAGLDGRVTGYTEAPTTRLSTGLTSTSLERAPAPSKSFVRGKSGYVPFWPGGLDEALKESSDVIELDKSVKGLRTIPPGFTRGLRLPGDEPEDEILGDLGEREDDIEGLIENGIKPESFIEEQDDLNETNGFAEHVMEIDDLLPMTRTTLNPLSSSSSRRRIKHAKIEKREWAHVVDVNKPMTNFHELVPEMAHKYPFELDTFQKEAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSSQSVGILTGDVQINPEGSCLVMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPEHVNIILLSATVPNAKEFADWVGRTKKKDIYVIFTAQRPVPLEHFLYAGRELYKIVDAKRNFIGPGYKDAGEALRRKQDKEREAAGLPPVHRVGARGAASAQRGQRGGQRGGPPARGAPQRGGGRGAGPQRTVHQGADKSLYVHLLGHLKKKTLLPVVIFTFSKKRCEENAATLVNLDLCTALDKSEVHVTIEKALSRLEGSDKKLPQIMRMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKEVVEILFARGLVKVLFATETFAMGVNMPAKCVVFSGIRKHDGRSFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVVILANDNIPEQTTLMNMILGDPLRLQSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENASQKLLPDHQKKVLESEKKLASFPKLECPHCAPDIEAYYDASHDVVALTRQLVAIGQKYLDPGRVVILRDGHFKSNAAVTLKATKGPADGSKWYYVLALVDPETRSRKNDVDYDALPPRWPIIPELLRVVEPNYEVLRVPMKSIAMITNQNIKIDVTAILGRRWVSTLQETMQALATLVEEWCKAGQIQEAGWGKQKQRSIELQDVLQARDDIAKRLANKSCTSCPDLEQHYSIVHAEKVLRARIANLKMAISDQNLELIPDYEQRVAVLQALKFIDENSTVLLKGRVACEINSANELVLTELILENMLAAYDPEEVVALLSCFVFQEKTDVEPNIPPKLEEGRDAIIAINDRVSQVQESHQVPGEEFRTLKFGLVEVVYEWAKGMPFDQITRLTDVAEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDADLMKKMEEAQLKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.41
4 0.43
5 0.47
6 0.46
7 0.51
8 0.48
9 0.52
10 0.52
11 0.45
12 0.39
13 0.36
14 0.29
15 0.19
16 0.17
17 0.14
18 0.16
19 0.18
20 0.2
21 0.21
22 0.23
23 0.28
24 0.32
25 0.37
26 0.38
27 0.41
28 0.43
29 0.48
30 0.47
31 0.42
32 0.42
33 0.37
34 0.32
35 0.29
36 0.27
37 0.25
38 0.26
39 0.26
40 0.26
41 0.31
42 0.35
43 0.38
44 0.38
45 0.37
46 0.42
47 0.45
48 0.5
49 0.54
50 0.56
51 0.6
52 0.63
53 0.64
54 0.62
55 0.62
56 0.55
57 0.51
58 0.47
59 0.41
60 0.4
61 0.36
62 0.3
63 0.26
64 0.27
65 0.29
66 0.29
67 0.29
68 0.27
69 0.3
70 0.32
71 0.37
72 0.36
73 0.32
74 0.31
75 0.29
76 0.29
77 0.26
78 0.25
79 0.21
80 0.2
81 0.16
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.16
101 0.17
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.19
107 0.22
108 0.25
109 0.28
110 0.32
111 0.34
112 0.4
113 0.45
114 0.43
115 0.48
116 0.45
117 0.44
118 0.47
119 0.5
120 0.45
121 0.41
122 0.43
123 0.35
124 0.34
125 0.3
126 0.21
127 0.18
128 0.17
129 0.15
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.16
147 0.16
148 0.19
149 0.24
150 0.31
151 0.33
152 0.36
153 0.38
154 0.38
155 0.38
156 0.36
157 0.37
158 0.31
159 0.35
160 0.31
161 0.31
162 0.31
163 0.33
164 0.36
165 0.3
166 0.29
167 0.24
168 0.23
169 0.2
170 0.18
171 0.13
172 0.08
173 0.08
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.18
197 0.19
198 0.19
199 0.2
200 0.21
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.16
225 0.2
226 0.22
227 0.22
228 0.24
229 0.28
230 0.29
231 0.35
232 0.36
233 0.42
234 0.48
235 0.49
236 0.57
237 0.61
238 0.68
239 0.73
240 0.76
241 0.77
242 0.8
243 0.85
244 0.85
245 0.8
246 0.75
247 0.67
248 0.58
249 0.5
250 0.44
251 0.39
252 0.35
253 0.34
254 0.32
255 0.3
256 0.28
257 0.25
258 0.25
259 0.28
260 0.23
261 0.19
262 0.23
263 0.22
264 0.23
265 0.24
266 0.22
267 0.2
268 0.2
269 0.21
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.17
276 0.18
277 0.23
278 0.26
279 0.24
280 0.23
281 0.22
282 0.22
283 0.21
284 0.21
285 0.15
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.07
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.18
323 0.2
324 0.2
325 0.2
326 0.22
327 0.22
328 0.26
329 0.34
330 0.35
331 0.44
332 0.45
333 0.51
334 0.54
335 0.55
336 0.61
337 0.53
338 0.47
339 0.45
340 0.48
341 0.43
342 0.42
343 0.42
344 0.31
345 0.3
346 0.28
347 0.21
348 0.15
349 0.12
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.12
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.13
378 0.14
379 0.13
380 0.15
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.11
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.07
389 0.06
390 0.09
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.07
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.1
431 0.14
432 0.14
433 0.18
434 0.27
435 0.3
436 0.32
437 0.36
438 0.38
439 0.36
440 0.43
441 0.4
442 0.37
443 0.39
444 0.41
445 0.39
446 0.36
447 0.35
448 0.29
449 0.28
450 0.24
451 0.21
452 0.18
453 0.18
454 0.18
455 0.16
456 0.17
457 0.15
458 0.15
459 0.14
460 0.13
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.12
466 0.13
467 0.15
468 0.21
469 0.21
470 0.24
471 0.25
472 0.25
473 0.22
474 0.21
475 0.24
476 0.17
477 0.23
478 0.23
479 0.21
480 0.2
481 0.2
482 0.21
483 0.22
484 0.23
485 0.21
486 0.26
487 0.28
488 0.3
489 0.37
490 0.43
491 0.43
492 0.46
493 0.45
494 0.41
495 0.4
496 0.4
497 0.36
498 0.3
499 0.26
500 0.23
501 0.2
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.13
506 0.15
507 0.15
508 0.13
509 0.14
510 0.16
511 0.17
512 0.19
513 0.19
514 0.16
515 0.16
516 0.17
517 0.2
518 0.23
519 0.24
520 0.26
521 0.28
522 0.32
523 0.34
524 0.34
525 0.3
526 0.26
527 0.3
528 0.27
529 0.25
530 0.21
531 0.25
532 0.26
533 0.26
534 0.27
535 0.21
536 0.2
537 0.22
538 0.25
539 0.19
540 0.18
541 0.18
542 0.18
543 0.22
544 0.23
545 0.19
546 0.2
547 0.19
548 0.19
549 0.21
550 0.2
551 0.17
552 0.16
553 0.15
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.14
558 0.15
559 0.2
560 0.21
561 0.21
562 0.23
563 0.24
564 0.27
565 0.24
566 0.25
567 0.2
568 0.22
569 0.23
570 0.23
571 0.22
572 0.19
573 0.22
574 0.22
575 0.26
576 0.24
577 0.25
578 0.25
579 0.32
580 0.33
581 0.32
582 0.36
583 0.32
584 0.3
585 0.27
586 0.25
587 0.18
588 0.16
589 0.1
590 0.04
591 0.03
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.07
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.12
602 0.12
603 0.14
604 0.15
605 0.14
606 0.11
607 0.11
608 0.1
609 0.08
610 0.09
611 0.11
612 0.13
613 0.17
614 0.23
615 0.23
616 0.24
617 0.27
618 0.27
619 0.29
620 0.34
621 0.33
622 0.3
623 0.32
624 0.32
625 0.3
626 0.31
627 0.25
628 0.17
629 0.15
630 0.11
631 0.1
632 0.09
633 0.08
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.07
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.09
677 0.1
678 0.12
679 0.19
680 0.23
681 0.28
682 0.29
683 0.31
684 0.35
685 0.38
686 0.39
687 0.39
688 0.39
689 0.35
690 0.4
691 0.39
692 0.34
693 0.31
694 0.27
695 0.21
696 0.18
697 0.17
698 0.11
699 0.12
700 0.11
701 0.08
702 0.09
703 0.1
704 0.11
705 0.11
706 0.12
707 0.13
708 0.14
709 0.14
710 0.13
711 0.12
712 0.13
713 0.11
714 0.11
715 0.09
716 0.08
717 0.07
718 0.07
719 0.06
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.05
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.06
736 0.05
737 0.06
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.09
742 0.15
743 0.18
744 0.18
745 0.22
746 0.22
747 0.26
748 0.27
749 0.26
750 0.22
751 0.19
752 0.18
753 0.13
754 0.13
755 0.09
756 0.07
757 0.06
758 0.05
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.08
763 0.1
764 0.13
765 0.14
766 0.14
767 0.14
768 0.15
769 0.17
770 0.17
771 0.23
772 0.26
773 0.28
774 0.31
775 0.3
776 0.3
777 0.3
778 0.34
779 0.35
780 0.36
781 0.36
782 0.39
783 0.42
784 0.42
785 0.45
786 0.48
787 0.46
788 0.43
789 0.45
790 0.44
791 0.41
792 0.42
793 0.38
794 0.33
795 0.31
796 0.3
797 0.33
798 0.35
799 0.35
800 0.38
801 0.41
802 0.41
803 0.37
804 0.36
805 0.26
806 0.24
807 0.24
808 0.23
809 0.18
810 0.15
811 0.14
812 0.14
813 0.13
814 0.1
815 0.07
816 0.05
817 0.05
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.05
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.06
826 0.07
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.09
831 0.11
832 0.12
833 0.13
834 0.12
835 0.1
836 0.12
837 0.15
838 0.15
839 0.16
840 0.2
841 0.19
842 0.25
843 0.26
844 0.26
845 0.24
846 0.23
847 0.22
848 0.2
849 0.22
850 0.18
851 0.17
852 0.16
853 0.21
854 0.21
855 0.22
856 0.2
857 0.17
858 0.16
859 0.18
860 0.2
861 0.18
862 0.21
863 0.23
864 0.24
865 0.24
866 0.23
867 0.21
868 0.18
869 0.15
870 0.12
871 0.09
872 0.09
873 0.11
874 0.11
875 0.15
876 0.19
877 0.2
878 0.22
879 0.25
880 0.27
881 0.29
882 0.34
883 0.34
884 0.35
885 0.34
886 0.37
887 0.37
888 0.34
889 0.31
890 0.26
891 0.23
892 0.2
893 0.2
894 0.16
895 0.2
896 0.22
897 0.23
898 0.26
899 0.26
900 0.24
901 0.24
902 0.23
903 0.16
904 0.14
905 0.15
906 0.13
907 0.12
908 0.12
909 0.13
910 0.17
911 0.15
912 0.16
913 0.15
914 0.15
915 0.14
916 0.16
917 0.16
918 0.15
919 0.18
920 0.18
921 0.25
922 0.26
923 0.26
924 0.25
925 0.23
926 0.2
927 0.18
928 0.17
929 0.1
930 0.13
931 0.14
932 0.13
933 0.15
934 0.15
935 0.15
936 0.16
937 0.14
938 0.14
939 0.16
940 0.19
941 0.18
942 0.23
943 0.22
944 0.22
945 0.21
946 0.18
947 0.15
948 0.12
949 0.11
950 0.07
951 0.07
952 0.07
953 0.06
954 0.07
955 0.07
956 0.08
957 0.08
958 0.08
959 0.11
960 0.12
961 0.12
962 0.19
963 0.22
964 0.22
965 0.29
966 0.32
967 0.32
968 0.36
969 0.39
970 0.34
971 0.38
972 0.44
973 0.44
974 0.48
975 0.47
976 0.42
977 0.44
978 0.43
979 0.38
980 0.31
981 0.24
982 0.16
983 0.21
984 0.21
985 0.19
986 0.2
987 0.23
988 0.24
989 0.32
990 0.37
991 0.35
992 0.39
993 0.42
994 0.45
995 0.46
996 0.48
997 0.43
998 0.4
999 0.42
1000 0.43
1001 0.41
1002 0.36
1003 0.32
1004 0.27
1005 0.27
1006 0.25
1007 0.2
1008 0.15
1009 0.14
1010 0.13
1011 0.16
1012 0.2
1013 0.22
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.24
1017 0.31
1018 0.33
1019 0.34
1020 0.31
1021 0.29
1022 0.27
1023 0.29
1024 0.27
1025 0.21
1026 0.19
1027 0.14
1028 0.15
1029 0.15
1030 0.15
1031 0.13
1032 0.12
1033 0.12
1034 0.13
1035 0.15
1036 0.14
1037 0.14
1038 0.14
1039 0.15
1040 0.14
1041 0.17
1042 0.18
1043 0.15
1044 0.19
1045 0.19
1046 0.19
1047 0.18
1048 0.18
1049 0.17
1050 0.14
1051 0.14
1052 0.12
1053 0.13
1054 0.12
1055 0.14
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.15
1059 0.16
1060 0.18
1061 0.19
1062 0.19
1063 0.23
1064 0.25
1065 0.25
1066 0.24
1067 0.23
1068 0.18
1069 0.17
1070 0.17
1071 0.12
1072 0.09
1073 0.07
1074 0.07
1075 0.06
1076 0.06
1077 0.06
1078 0.06
1079 0.05
1080 0.05
1081 0.05
1082 0.04
1083 0.04
1084 0.05
1085 0.06
1086 0.06
1087 0.06
1088 0.06
1089 0.06
1090 0.06
1091 0.07
1092 0.06
1093 0.06
1094 0.06
1095 0.06
1096 0.06
1097 0.07
1098 0.07
1099 0.07
1100 0.12
1101 0.13
1102 0.17
1103 0.21
1104 0.22
1105 0.24
1106 0.29
1107 0.33
1108 0.35
1109 0.34
1110 0.31
1111 0.3
1112 0.36
1113 0.35
1114 0.32
1115 0.32
1116 0.28
1117 0.28
1118 0.28
1119 0.25
1120 0.2
1121 0.2
1122 0.18
1123 0.16
1124 0.14
1125 0.14
1126 0.14
1127 0.15
1128 0.14
1129 0.14
1130 0.18
1131 0.24
1132 0.25
1133 0.27
1134 0.3
1135 0.29
1136 0.27
1137 0.31
1138 0.29
1139 0.25
1140 0.24
1141 0.22
1142 0.22
1143 0.22
1144 0.23
1145 0.18
1146 0.16
1147 0.16
1148 0.16
1149 0.16
1150 0.12
1151 0.16
1152 0.14
1153 0.13
1154 0.14
1155 0.12
1156 0.12
1157 0.11
1158 0.11
1159 0.13
1160 0.15
1161 0.17
1162 0.21
1163 0.24
1164 0.26
1165 0.3
1166 0.3
1167 0.24
1168 0.23
1169 0.22
1170 0.19
1171 0.16
1172 0.13
1173 0.1
1174 0.12
1175 0.12
1176 0.1
1177 0.11
1178 0.1
1179 0.11
1180 0.16
1181 0.17
1182 0.19
1183 0.24
1184 0.3
1185 0.34
1186 0.36
1187 0.37
1188 0.35
1189 0.34
1190 0.38
1191 0.37
1192 0.33
1193 0.3
1194 0.28
1195 0.26
1196 0.24
1197 0.23
1198 0.17
1199 0.15
1200 0.16
1201 0.14
1202 0.14
1203 0.13
1204 0.14
1205 0.2
1206 0.24
1207 0.26
1208 0.34
1209 0.42
1210 0.47
1211 0.49
1212 0.53
1213 0.49
1214 0.45
1215 0.43
1216 0.37
1217 0.32