Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5RVE6

Protein Details
Accession J5RVE6    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-80DLDATRKKKNRTPTPKSSTATKHydrophilic
119-148SSTSSSSANRKKKHHQHNAKKQQQQQVKKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-131KKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSAETVTAANTATAPIPETQEQESSKSKQVNLTPAPLPTSSPWKLAQTEVPVSSISIEDLDATRKKKNRTPTPKSSTATKWVPIKASITVSGTKRSGSKNGGNSGNNNNKSKNNKNAASSTSSSSANRKKKHHQHNAKKQQQQQVKKDGSESAGEEESKDTAPQENDQSTQQQQPPHHRNHHHSQHHNSTGPQRRKFHNSNNTGMPQNQGLPPQFKPYQGRNPRPNISNRLKYQNHLHHNPQQPMVKLQQQFYPVQPVLMAINNIARQIEYYFSEENLTIDNYLRSKLSKDGFAPLSLISKFYRVVNMSFGGDANLVLAALREIVANETATVNVVEGSLVTNEAEAVSETNEVKETSPLDRYFIRSKSWSNWLPETFETEVNIEKELAGDALDQFMISVPPVPQQEEEISAESTPQQQEARDESAPVATSEPELTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.16
4 0.18
5 0.21
6 0.23
7 0.27
8 0.29
9 0.32
10 0.37
11 0.36
12 0.41
13 0.43
14 0.43
15 0.44
16 0.48
17 0.53
18 0.51
19 0.52
20 0.48
21 0.45
22 0.45
23 0.38
24 0.35
25 0.29
26 0.33
27 0.3
28 0.31
29 0.32
30 0.33
31 0.35
32 0.35
33 0.37
34 0.35
35 0.38
36 0.35
37 0.33
38 0.29
39 0.27
40 0.25
41 0.2
42 0.13
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.14
48 0.18
49 0.21
50 0.28
51 0.34
52 0.41
53 0.46
54 0.56
55 0.62
56 0.68
57 0.76
58 0.79
59 0.81
60 0.84
61 0.8
62 0.76
63 0.7
64 0.67
65 0.62
66 0.57
67 0.54
68 0.48
69 0.48
70 0.43
71 0.4
72 0.35
73 0.33
74 0.3
75 0.26
76 0.29
77 0.28
78 0.3
79 0.29
80 0.27
81 0.29
82 0.3
83 0.33
84 0.34
85 0.4
86 0.41
87 0.48
88 0.52
89 0.5
90 0.51
91 0.54
92 0.57
93 0.56
94 0.52
95 0.49
96 0.5
97 0.56
98 0.6
99 0.61
100 0.6
101 0.58
102 0.59
103 0.6
104 0.57
105 0.54
106 0.48
107 0.41
108 0.35
109 0.32
110 0.29
111 0.34
112 0.4
113 0.42
114 0.47
115 0.51
116 0.6
117 0.68
118 0.78
119 0.81
120 0.83
121 0.86
122 0.9
123 0.94
124 0.93
125 0.91
126 0.87
127 0.85
128 0.83
129 0.81
130 0.77
131 0.76
132 0.7
133 0.63
134 0.57
135 0.5
136 0.43
137 0.34
138 0.28
139 0.2
140 0.18
141 0.17
142 0.16
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.11
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.23
156 0.22
157 0.26
158 0.27
159 0.28
160 0.31
161 0.4
162 0.46
163 0.51
164 0.57
165 0.57
166 0.61
167 0.66
168 0.72
169 0.71
170 0.7
171 0.7
172 0.69
173 0.68
174 0.62
175 0.54
176 0.53
177 0.55
178 0.56
179 0.56
180 0.52
181 0.52
182 0.59
183 0.64
184 0.65
185 0.65
186 0.61
187 0.59
188 0.58
189 0.56
190 0.49
191 0.43
192 0.34
193 0.24
194 0.21
195 0.18
196 0.16
197 0.15
198 0.17
199 0.17
200 0.22
201 0.23
202 0.24
203 0.27
204 0.31
205 0.4
206 0.46
207 0.55
208 0.57
209 0.62
210 0.63
211 0.63
212 0.62
213 0.61
214 0.59
215 0.57
216 0.53
217 0.56
218 0.53
219 0.51
220 0.54
221 0.54
222 0.54
223 0.51
224 0.53
225 0.52
226 0.58
227 0.58
228 0.54
229 0.48
230 0.41
231 0.4
232 0.37
233 0.35
234 0.31
235 0.3
236 0.28
237 0.28
238 0.29
239 0.27
240 0.3
241 0.23
242 0.21
243 0.19
244 0.17
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.07
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.09
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.17
275 0.18
276 0.2
277 0.21
278 0.26
279 0.27
280 0.26
281 0.25
282 0.2
283 0.22
284 0.18
285 0.19
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.18
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.19
295 0.18
296 0.17
297 0.17
298 0.13
299 0.11
300 0.1
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.04
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.13
342 0.15
343 0.16
344 0.22
345 0.22
346 0.24
347 0.25
348 0.3
349 0.35
350 0.35
351 0.37
352 0.35
353 0.38
354 0.41
355 0.48
356 0.48
357 0.47
358 0.52
359 0.49
360 0.49
361 0.46
362 0.46
363 0.39
364 0.34
365 0.3
366 0.24
367 0.26
368 0.22
369 0.22
370 0.17
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.11
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.09
386 0.08
387 0.14
388 0.16
389 0.18
390 0.18
391 0.22
392 0.23
393 0.25
394 0.27
395 0.24
396 0.24
397 0.21
398 0.21
399 0.19
400 0.23
401 0.2
402 0.21
403 0.2
404 0.21
405 0.26
406 0.3
407 0.34
408 0.3
409 0.3
410 0.28
411 0.29
412 0.28
413 0.23
414 0.2
415 0.15
416 0.15