Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165V918

Protein Details
Accession A0A165V918    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-163AVWNPPKKPKQGKGKGNKGKGMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-162PPKKPKQGKGKGNKGKG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023251  Brr1  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0030532  C:small nuclear ribonucleoprotein complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MSSTHKRKRDELEDSDEEPSFGRQILPVANLPENYNGPITDGLQYLFTVRRDARRLPHVVRVANPYEVPDVPPPLKDVAPHPSLPSESWRTVFQRRFRNFRKNFAQPTIHIRLPEKKLKQKLMPDKNERDLWWEFIAGRPEAVWNPPKKPKQGKGKGNKGKGMRAFSDDSMDYGDARDSGVLKAQADDGDVVLMYDEADISVGPVHPPVSAATSVTLPTPMGTPPRHEEGEISDTPAEAFTPREPTPALLNRIDHRLAIHLLMYFTNWMNHHLRHTEQFSNRLTEVHARWMFALLSRVDDHVDADDMSLLRNLARACIGLLKDRKWKKVFLAQAGVGGQDEVGPDSIVQEAMSERSCWIVIAAIVYVWAQRDLWQDAEAMLQDFIAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.62
3 0.53
4 0.43
5 0.35
6 0.28
7 0.2
8 0.15
9 0.13
10 0.11
11 0.13
12 0.16
13 0.18
14 0.2
15 0.23
16 0.25
17 0.26
18 0.27
19 0.27
20 0.26
21 0.25
22 0.23
23 0.19
24 0.18
25 0.18
26 0.18
27 0.16
28 0.15
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.17
34 0.16
35 0.2
36 0.22
37 0.29
38 0.34
39 0.39
40 0.44
41 0.49
42 0.56
43 0.54
44 0.6
45 0.59
46 0.56
47 0.55
48 0.54
49 0.49
50 0.43
51 0.39
52 0.33
53 0.3
54 0.27
55 0.26
56 0.22
57 0.25
58 0.23
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.23
63 0.21
64 0.23
65 0.24
66 0.27
67 0.27
68 0.27
69 0.26
70 0.27
71 0.27
72 0.3
73 0.29
74 0.27
75 0.27
76 0.3
77 0.33
78 0.4
79 0.46
80 0.47
81 0.52
82 0.56
83 0.65
84 0.69
85 0.76
86 0.71
87 0.74
88 0.75
89 0.73
90 0.73
91 0.7
92 0.66
93 0.58
94 0.62
95 0.58
96 0.5
97 0.43
98 0.4
99 0.41
100 0.43
101 0.5
102 0.5
103 0.52
104 0.59
105 0.64
106 0.68
107 0.69
108 0.74
109 0.75
110 0.77
111 0.78
112 0.76
113 0.74
114 0.71
115 0.61
116 0.56
117 0.46
118 0.4
119 0.31
120 0.25
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.16
125 0.15
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.17
130 0.2
131 0.21
132 0.27
133 0.36
134 0.41
135 0.49
136 0.57
137 0.61
138 0.66
139 0.73
140 0.77
141 0.79
142 0.85
143 0.85
144 0.81
145 0.79
146 0.7
147 0.67
148 0.61
149 0.54
150 0.45
151 0.4
152 0.36
153 0.31
154 0.31
155 0.24
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.11
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.11
209 0.12
210 0.15
211 0.18
212 0.23
213 0.23
214 0.22
215 0.22
216 0.21
217 0.26
218 0.23
219 0.22
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.12
225 0.06
226 0.08
227 0.07
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.22
234 0.26
235 0.29
236 0.26
237 0.28
238 0.29
239 0.33
240 0.32
241 0.26
242 0.21
243 0.19
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.15
256 0.18
257 0.19
258 0.22
259 0.24
260 0.26
261 0.28
262 0.33
263 0.36
264 0.36
265 0.41
266 0.39
267 0.41
268 0.39
269 0.34
270 0.31
271 0.3
272 0.28
273 0.32
274 0.3
275 0.27
276 0.27
277 0.28
278 0.26
279 0.21
280 0.23
281 0.13
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.11
289 0.12
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.15
305 0.16
306 0.21
307 0.27
308 0.31
309 0.4
310 0.46
311 0.55
312 0.54
313 0.57
314 0.56
315 0.6
316 0.63
317 0.61
318 0.61
319 0.52
320 0.52
321 0.48
322 0.41
323 0.32
324 0.24
325 0.15
326 0.09
327 0.09
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.12
358 0.17
359 0.2
360 0.21
361 0.21
362 0.2
363 0.2
364 0.22
365 0.19
366 0.15
367 0.12