Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165MV40

Protein Details
Accession A0A165MV40    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-33VYAIPSLSKGKKKSKGKEKSKSSKVVASHydrophilic
246-271LIEKSLTQTKKHKKRKDDGEGDASKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-29KGKKKSKGKEKSKSSK
255-277KKHKKRKDDGEGDASKKSKKAKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 4.166, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSASQVYAIPSLSKGKKKSKGKEKSKSSKVVASAVSDPKPRNESESPHWAYKPPEGSVEIEYNVEQEDFDWDAVKNDENLELWVIRAPDGLKTKYLEGVELDSFPSTSHSARIGTIDKKHTSYDIWSVGEEDDDGSPDFLIVGEEMKRLSCLLPRAKKGGKLYQAFKPVSRRIVVTTKSALPTLEHSSDSSASETRSAPRQRYPSELLTHRFTPYGSLSAVDNSDGDAMDVDALQPPPSTQVLTNLIEKSLTQTKKHKKRKDDGEGDASKKSKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.51
3 0.6
4 0.69
5 0.78
6 0.8
7 0.84
8 0.88
9 0.91
10 0.92
11 0.93
12 0.92
13 0.9
14 0.84
15 0.79
16 0.7
17 0.65
18 0.56
19 0.49
20 0.45
21 0.42
22 0.41
23 0.4
24 0.39
25 0.39
26 0.41
27 0.38
28 0.39
29 0.38
30 0.4
31 0.42
32 0.51
33 0.5
34 0.51
35 0.51
36 0.47
37 0.46
38 0.45
39 0.43
40 0.33
41 0.31
42 0.29
43 0.3
44 0.3
45 0.29
46 0.24
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.15
51 0.12
52 0.09
53 0.07
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.13
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.21
81 0.23
82 0.23
83 0.19
84 0.14
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.15
100 0.16
101 0.18
102 0.22
103 0.26
104 0.27
105 0.27
106 0.27
107 0.26
108 0.23
109 0.21
110 0.21
111 0.19
112 0.17
113 0.16
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.12
118 0.08
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.14
139 0.22
140 0.28
141 0.3
142 0.36
143 0.38
144 0.42
145 0.45
146 0.46
147 0.46
148 0.45
149 0.46
150 0.46
151 0.51
152 0.47
153 0.45
154 0.45
155 0.41
156 0.39
157 0.36
158 0.32
159 0.29
160 0.35
161 0.34
162 0.3
163 0.29
164 0.28
165 0.28
166 0.28
167 0.24
168 0.17
169 0.19
170 0.21
171 0.2
172 0.18
173 0.17
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.17
178 0.13
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.22
184 0.26
185 0.28
186 0.34
187 0.41
188 0.41
189 0.47
190 0.5
191 0.47
192 0.49
193 0.51
194 0.48
195 0.46
196 0.45
197 0.39
198 0.35
199 0.29
200 0.26
201 0.22
202 0.2
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.16
208 0.13
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.12
228 0.17
229 0.22
230 0.25
231 0.29
232 0.27
233 0.26
234 0.25
235 0.24
236 0.24
237 0.28
238 0.3
239 0.31
240 0.41
241 0.52
242 0.63
243 0.74
244 0.78
245 0.79
246 0.86
247 0.91
248 0.92
249 0.9
250 0.87
251 0.86
252 0.84
253 0.77
254 0.73
255 0.64
256 0.56
257 0.52