Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EF09

Protein Details
Accession J6EF09    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-278SDPTKLKEGAPKSKKRKIRAAGETRLKKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-278KLKEGAPKSKKRKIRAAGETRLKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MEPQDPQLKEDIKTTASYIKQHGTSFESKLLEDERFSFIREDDPLHEYYIKILSDTTVGNEDDVGRREREIARPQDFVFSEYDSGISRRDIEIIKLTARYCAQDENNLKRIASKHGEGMLQFINDSHPLHKTFTDFIAQYKRIISSKGQEIKKSKRDIIDECFARARYWEFAKDQDREHDKLLESCKIQFAAIPWDKFTQVAKFLIPENTNTLQNALDLPQMRLRTVQPDMKIFDSIRPVNEEEKAASDPTKLKEGAPKSKKRKIRAAGETRLKKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.3
4 0.32
5 0.33
6 0.35
7 0.37
8 0.36
9 0.37
10 0.36
11 0.36
12 0.35
13 0.36
14 0.32
15 0.29
16 0.3
17 0.3
18 0.26
19 0.23
20 0.23
21 0.22
22 0.21
23 0.23
24 0.22
25 0.19
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.2
30 0.23
31 0.22
32 0.24
33 0.24
34 0.2
35 0.21
36 0.22
37 0.18
38 0.15
39 0.14
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.17
51 0.18
52 0.15
53 0.16
54 0.2
55 0.22
56 0.28
57 0.34
58 0.4
59 0.41
60 0.43
61 0.43
62 0.45
63 0.42
64 0.36
65 0.29
66 0.22
67 0.19
68 0.16
69 0.16
70 0.11
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.16
88 0.19
89 0.18
90 0.24
91 0.3
92 0.34
93 0.39
94 0.38
95 0.37
96 0.35
97 0.36
98 0.34
99 0.31
100 0.26
101 0.23
102 0.24
103 0.26
104 0.22
105 0.23
106 0.18
107 0.14
108 0.13
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.16
122 0.14
123 0.15
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.18
128 0.19
129 0.17
130 0.18
131 0.17
132 0.15
133 0.23
134 0.31
135 0.32
136 0.36
137 0.42
138 0.49
139 0.55
140 0.55
141 0.5
142 0.47
143 0.5
144 0.48
145 0.47
146 0.46
147 0.39
148 0.36
149 0.35
150 0.31
151 0.27
152 0.23
153 0.2
154 0.16
155 0.17
156 0.19
157 0.18
158 0.24
159 0.29
160 0.3
161 0.3
162 0.35
163 0.38
164 0.37
165 0.37
166 0.34
167 0.3
168 0.31
169 0.33
170 0.29
171 0.25
172 0.24
173 0.24
174 0.21
175 0.2
176 0.17
177 0.15
178 0.21
179 0.25
180 0.24
181 0.24
182 0.25
183 0.26
184 0.26
185 0.26
186 0.19
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.19
192 0.23
193 0.22
194 0.2
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.24
199 0.23
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.11
204 0.13
205 0.13
206 0.15
207 0.19
208 0.19
209 0.19
210 0.21
211 0.21
212 0.23
213 0.27
214 0.31
215 0.29
216 0.33
217 0.36
218 0.35
219 0.37
220 0.32
221 0.31
222 0.33
223 0.32
224 0.29
225 0.3
226 0.31
227 0.3
228 0.32
229 0.3
230 0.23
231 0.24
232 0.24
233 0.22
234 0.2
235 0.21
236 0.24
237 0.25
238 0.3
239 0.27
240 0.28
241 0.34
242 0.42
243 0.5
244 0.55
245 0.63
246 0.67
247 0.76
248 0.82
249 0.82
250 0.84
251 0.83
252 0.83
253 0.84
254 0.84
255 0.85
256 0.88
257 0.88
258 0.84