Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4U3X0

Protein Details
Accession J4U3X0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MAKTTKVKGNKKEAKASKQTKEEKAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-13KKE
328-365RGGSRGFGGRGGARGGNRGFGGRGGARGGARGGRGGFR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034276  Gar2_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
cd12448  RRM2_gar2  
Amino Acid Sequences MAKTTKVKGNKKEAKASKQTKEEKAAAVSSSSSSSSSESESSDSESSSSSSSSDSESEAEVKKEESKSTSSSSDSSDEEEGESKKEESKESSSSDASSSDSESEKEESNDKKRKSEDAEEEEEEDESSNKKQKNEESGEPATIFVGRLSWSIDDEWLKKEFEHIGGVISARVINERGTDRSRGYGYVDFENKSYAEKAIQEMQGKEIDGRPINCDLSTSKPAGNNTNDRAKKFGDTPSEPSDTLFLGNLSFNADRDTIFELFAKHGEVVSVRIPTHPETEQPKGFGYVQFSSLEDSKKALESLQGEYIDNRPVRLDYSSPRPNNDGGRGGSRGFGGRGGARGGNRGFGGRGGARGGARGGRGGFRPTGSGANNAPLGRSRNTASFAGSKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.86
3 0.86
4 0.83
5 0.84
6 0.85
7 0.82
8 0.8
9 0.74
10 0.68
11 0.62
12 0.55
13 0.46
14 0.38
15 0.31
16 0.24
17 0.22
18 0.18
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.17
27 0.17
28 0.21
29 0.19
30 0.18
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.18
48 0.19
49 0.23
50 0.24
51 0.26
52 0.25
53 0.27
54 0.29
55 0.33
56 0.34
57 0.3
58 0.29
59 0.3
60 0.29
61 0.26
62 0.25
63 0.22
64 0.2
65 0.18
66 0.2
67 0.18
68 0.17
69 0.18
70 0.16
71 0.19
72 0.21
73 0.22
74 0.24
75 0.28
76 0.31
77 0.32
78 0.34
79 0.31
80 0.3
81 0.28
82 0.24
83 0.2
84 0.17
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.21
94 0.26
95 0.35
96 0.43
97 0.43
98 0.48
99 0.49
100 0.54
101 0.55
102 0.57
103 0.56
104 0.55
105 0.58
106 0.53
107 0.52
108 0.45
109 0.39
110 0.3
111 0.21
112 0.14
113 0.1
114 0.12
115 0.17
116 0.19
117 0.22
118 0.27
119 0.32
120 0.41
121 0.46
122 0.48
123 0.49
124 0.48
125 0.47
126 0.42
127 0.36
128 0.26
129 0.2
130 0.16
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.11
140 0.12
141 0.13
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.1
163 0.13
164 0.15
165 0.17
166 0.17
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.19
171 0.19
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.17
179 0.15
180 0.13
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.14
186 0.17
187 0.18
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.16
202 0.14
203 0.17
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.2
208 0.22
209 0.27
210 0.29
211 0.29
212 0.3
213 0.39
214 0.39
215 0.38
216 0.39
217 0.34
218 0.32
219 0.3
220 0.32
221 0.3
222 0.3
223 0.35
224 0.37
225 0.38
226 0.36
227 0.33
228 0.29
229 0.21
230 0.19
231 0.13
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.12
243 0.15
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.13
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.16
262 0.2
263 0.18
264 0.22
265 0.25
266 0.32
267 0.32
268 0.32
269 0.31
270 0.3
271 0.3
272 0.27
273 0.26
274 0.21
275 0.21
276 0.2
277 0.2
278 0.19
279 0.21
280 0.2
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.19
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.22
294 0.24
295 0.26
296 0.24
297 0.21
298 0.18
299 0.17
300 0.19
301 0.2
302 0.22
303 0.21
304 0.3
305 0.39
306 0.41
307 0.43
308 0.44
309 0.46
310 0.47
311 0.47
312 0.43
313 0.36
314 0.38
315 0.37
316 0.35
317 0.31
318 0.27
319 0.24
320 0.19
321 0.17
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.18
328 0.24
329 0.23
330 0.23
331 0.22
332 0.22
333 0.2
334 0.18
335 0.22
336 0.17
337 0.18
338 0.16
339 0.19
340 0.18
341 0.18
342 0.2
343 0.17
344 0.17
345 0.19
346 0.19
347 0.2
348 0.22
349 0.25
350 0.25
351 0.24
352 0.25
353 0.25
354 0.29
355 0.27
356 0.29
357 0.27
358 0.28
359 0.31
360 0.29
361 0.28
362 0.27
363 0.3
364 0.28
365 0.3
366 0.29
367 0.3
368 0.34
369 0.34
370 0.33
371 0.37
372 0.37
373 0.42