FuNGI

J6EBI0

Protein Details

Accession

J6EBI0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
557-604	NNNGNNSDKPKAKRPRKNAKKSESGTPAPKKKRVTKKKQSATGTPSST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
565-594	KPKAKRPRKNAKKSESGTPAPKKKRVTKKK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSANSPTGNDPHVFGIPVNATPSSMGSPGSPVNVPPPMNAAAAATVNHSVMRANGNNNVGEGTRTLTREQIQQLQQRQRLLLQQRLLEQQRKQQALQNYEAQFYQMLMTLNKRPKRLYNFVEDADSILKKYEQYLHSFEFHIYENNYKICAPANSRLQQQQKQPELTSDGLILTKNNETLKEFLEYVARGRIPDAIMEVLRDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDVTPKENKPNTNTSTSSPSNNSNAQDNSKIQQPSEPNSGVTNTTANMINKKTSFKRPRVYRTLLKPNDLTTYYDMMSYADNARFSDSIYQQFESEILTLTKRNLSLSVPLNPYEHRDMLEERAFIEPHLDEGKKCFVHKHRVESTREGTKGVVGHIDEHEEFPQHSSNYEQLMLIMNERTTTITNSTFAVSLTKNAMEIATSNSNGVRGISSSTSNSASNTRNNSLANGNQVALAAAAAAAAVGSSMGNDNNQFSRLKFIEQWRINKEKRKQQALSANINPTPFNARISMTAPLTPQQQLLQRQQQALEQQQNGGANKRSNNNVTGSNSNTNNNNNGNNSDKPKAKRPRKNAKKSESGTPAPKKKRVTKKKQSATGTPSSTTIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.21
3	0.2
4	0.2
5	0.21
6	0.18
7	0.17
8	0.17
9	0.19
10	0.16
11	0.15
12	0.14
13	0.12
14	0.15
15	0.16
16	0.18
17	0.17
18	0.15
19	0.2
20	0.25
21	0.25
22	0.23
23	0.26
24	0.25
25	0.25
26	0.24
27	0.2
28	0.16
29	0.16
30	0.16
31	0.13
32	0.12
33	0.12
34	0.12
35	0.11
36	0.1
37	0.11
38	0.17
39	0.19
40	0.21
41	0.26
42	0.29
43	0.29
44	0.29
45	0.28
46	0.22
47	0.19
48	0.17
49	0.14
50	0.16
51	0.17
52	0.18
53	0.21
54	0.23
55	0.29
56	0.33
57	0.39
58	0.43
59	0.49
60	0.57
61	0.63
62	0.64
63	0.61
64	0.58
65	0.52
66	0.53
67	0.52
68	0.5
69	0.45
70	0.44
71	0.45
72	0.52
73	0.56
74	0.54
75	0.51
76	0.52
77	0.56
78	0.57
79	0.54
80	0.52
81	0.54
82	0.52
83	0.53
84	0.53
85	0.45
86	0.43
87	0.41
88	0.36
89	0.27
90	0.22
91	0.18
92	0.12
93	0.12
94	0.12
95	0.16
96	0.24
97	0.32
98	0.37
99	0.39
100	0.41
101	0.48
102	0.56
103	0.61
104	0.58
105	0.59
106	0.59
107	0.57
108	0.56
109	0.47
110	0.39
111	0.33
112	0.28
113	0.19
114	0.15
115	0.15
116	0.12
117	0.15
118	0.21
119	0.21
120	0.26
121	0.31
122	0.32
123	0.34
124	0.34
125	0.32
126	0.26
127	0.24
128	0.23
129	0.19
130	0.2
131	0.21
132	0.21
133	0.21
134	0.19
135	0.19
136	0.18
137	0.2
138	0.22
139	0.26
140	0.34
141	0.36
142	0.4
143	0.48
144	0.53
145	0.55
146	0.58
147	0.61
148	0.59
149	0.59
150	0.56
151	0.51
152	0.47
153	0.42
154	0.34
155	0.25
156	0.19
157	0.16
158	0.16
159	0.13
160	0.11
161	0.11
162	0.13
163	0.13
164	0.14
165	0.15
166	0.17
167	0.18
168	0.18
169	0.17
170	0.15
171	0.17
172	0.16
173	0.16
174	0.18
175	0.17
176	0.14
177	0.15
178	0.16
179	0.14
180	0.14
181	0.14
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.08
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.09
194	0.1
195	0.14
196	0.13
197	0.14
198	0.11
199	0.11
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.09
210	0.14
211	0.13
212	0.17
213	0.22
214	0.25
215	0.33
216	0.36
217	0.38
218	0.37
219	0.44
220	0.44
221	0.44
222	0.42
223	0.37
224	0.41
225	0.39
226	0.37
227	0.31
228	0.31
229	0.29
230	0.3
231	0.29
232	0.26
233	0.27
234	0.26
235	0.27
236	0.26
237	0.23
238	0.26
239	0.26
240	0.22
241	0.24
242	0.25
243	0.26
244	0.3
245	0.29
246	0.24
247	0.24
248	0.25
249	0.21
250	0.19
251	0.14
252	0.09
253	0.1
254	0.12
255	0.12
256	0.14
257	0.14
258	0.16
259	0.17
260	0.22
261	0.25
262	0.33
263	0.41
264	0.46
265	0.54
266	0.6
267	0.67
268	0.7
269	0.73
270	0.69
271	0.69
272	0.73
273	0.66
274	0.6
275	0.52
276	0.45
277	0.42
278	0.36
279	0.29
280	0.2
281	0.2
282	0.17
283	0.16
284	0.15
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.13
296	0.13
297	0.16
298	0.18
299	0.18
300	0.17
301	0.17
302	0.17
303	0.13
304	0.11
305	0.08
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.15
316	0.17
317	0.22
318	0.22
319	0.22
320	0.23
321	0.22
322	0.25
323	0.23
324	0.21
325	0.16
326	0.17
327	0.17
328	0.2
329	0.22
330	0.19
331	0.16
332	0.17
333	0.17
334	0.14
335	0.15
336	0.1
337	0.1
338	0.13
339	0.13
340	0.11
341	0.14
342	0.19
343	0.19
344	0.19
345	0.24
346	0.27
347	0.38
348	0.42
349	0.49
350	0.52
351	0.58
352	0.62
353	0.61
354	0.59
355	0.55
356	0.51
357	0.43
358	0.35
359	0.3
360	0.26
361	0.21
362	0.18
363	0.11
364	0.12
365	0.12
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.13
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.14
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.14
378	0.15
379	0.15
380	0.13
381	0.11
382	0.13
383	0.13
384	0.12
385	0.11
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.09
391	0.1
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.14
397	0.13
398	0.12
399	0.13
400	0.11
401	0.11
402	0.12
403	0.12
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.08
408	0.09
409	0.12
410	0.13
411	0.13
412	0.13
413	0.13
414	0.14
415	0.13
416	0.13
417	0.09
418	0.07
419	0.09
420	0.1
421	0.11
422	0.12
423	0.14
424	0.16
425	0.16
426	0.16
427	0.19
428	0.21
429	0.25
430	0.29
431	0.29
432	0.3
433	0.3
434	0.31
435	0.3
436	0.28
437	0.27
438	0.23
439	0.21
440	0.19
441	0.18
442	0.16
443	0.12
444	0.1
445	0.05
446	0.03
447	0.03
448	0.02
449	0.02
450	0.02
451	0.02
452	0.02
453	0.02
454	0.02
455	0.02
456	0.04
457	0.04
458	0.06
459	0.07
460	0.09
461	0.1
462	0.13
463	0.13
464	0.13
465	0.2
466	0.2
467	0.23
468	0.27
469	0.33
470	0.42
471	0.48
472	0.55
473	0.55
474	0.63
475	0.66
476	0.7
477	0.72
478	0.71
479	0.74
480	0.76
481	0.71
482	0.71
483	0.74
484	0.72
485	0.72
486	0.68
487	0.63
488	0.55
489	0.53
490	0.44
491	0.36
492	0.35
493	0.27
494	0.23
495	0.2
496	0.19
497	0.21
498	0.23
499	0.25
500	0.21
501	0.22
502	0.21
503	0.22
504	0.24
505	0.23
506	0.22
507	0.21
508	0.27
509	0.32
510	0.4
511	0.46
512	0.48
513	0.49
514	0.49
515	0.49
516	0.49
517	0.5
518	0.49
519	0.41
520	0.37
521	0.38
522	0.41
523	0.39
524	0.38
525	0.35
526	0.32
527	0.36
528	0.4
529	0.44
530	0.43
531	0.45
532	0.43
533	0.43
534	0.43
535	0.43
536	0.44
537	0.44
538	0.42
539	0.43
540	0.44
541	0.42
542	0.43
543	0.43
544	0.41
545	0.38
546	0.39
547	0.41
548	0.42
549	0.45
550	0.46
551	0.49
552	0.51
553	0.58
554	0.65
555	0.71
556	0.75
557	0.8
558	0.85
559	0.89
560	0.94
561	0.95
562	0.93
563	0.93
564	0.86
565	0.85
566	0.82
567	0.78
568	0.77
569	0.77
570	0.78
571	0.76
572	0.8
573	0.79
574	0.81
575	0.85
576	0.86
577	0.87
578	0.88
579	0.9
580	0.93
581	0.93
582	0.91
583	0.89
584	0.85
585	0.83
586	0.76
587	0.66

J6EBI0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer