Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5PPA1

Protein Details
Accession J5PPA1    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-99EEVALPKLKKAKKVKRDDENENLEAHydrophilic
351-379EDEESKKPAKKARKLRVSRCKNMKKGTTAHydrophilic
421-449RAKKGEGSTHLKKRKQRSATGRVTKRSIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-89KLKKAKKVK
355-371SKKPAKKARKLRVSRCK
421-460RAKKGEGSTHLKKRKQRSATGRVTKRSIAFKKAQAEKVKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 12, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MSSAIDNLFGKVDEKKIESAVDKLFSSSCGPINKLEVKSKTRTVLPDSKKRERATEVEQEKQEAKEADIVREKTEEVALPKLKKAKKVKRDDENENLEAHYYAKLLKEGPEGDDGKSEATRKADGPSSSTTSAAKKVDFKEDELEKAERTVFIGNILSTVITSKKVYKEFKKLFGTNPVTKTEESDNDEEKEDAKKDNSNAFAIESIRFRSISFDEALPRKVAFVQQKFHKSRDTVNAYVVYKNRSAVRQICSNLNATVFQNHHLRVDAVAHPAPHDKKRSIFVGNLDFEEIEESLWKHFESCGGIEYVRIVRDSKTNMGKGFAYVQFKDLESVNKALLLNEKPMKSQKQEDEESKKPAKKARKLRVSRCKNMKKGTTAGTGSDRSSLTDSQRTKAGRAKKVLGKADRATLGQEITIEGLRAKKGEGSTHLKKRKQRSATGRVTKRSIAFKKAQAEKVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.27
4 0.3
5 0.3
6 0.32
7 0.32
8 0.3
9 0.28
10 0.27
11 0.26
12 0.23
13 0.25
14 0.22
15 0.23
16 0.24
17 0.26
18 0.26
19 0.33
20 0.39
21 0.4
22 0.46
23 0.49
24 0.51
25 0.56
26 0.59
27 0.56
28 0.54
29 0.55
30 0.55
31 0.58
32 0.6
33 0.64
34 0.68
35 0.74
36 0.77
37 0.74
38 0.72
39 0.68
40 0.65
41 0.62
42 0.64
43 0.59
44 0.59
45 0.57
46 0.54
47 0.51
48 0.45
49 0.42
50 0.33
51 0.28
52 0.28
53 0.28
54 0.31
55 0.37
56 0.37
57 0.34
58 0.34
59 0.33
60 0.27
61 0.27
62 0.23
63 0.18
64 0.25
65 0.29
66 0.3
67 0.34
68 0.41
69 0.43
70 0.5
71 0.58
72 0.61
73 0.66
74 0.75
75 0.8
76 0.82
77 0.87
78 0.86
79 0.84
80 0.81
81 0.72
82 0.62
83 0.52
84 0.42
85 0.34
86 0.26
87 0.18
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.18
95 0.18
96 0.2
97 0.25
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.23
102 0.2
103 0.21
104 0.2
105 0.16
106 0.17
107 0.19
108 0.18
109 0.21
110 0.24
111 0.23
112 0.25
113 0.27
114 0.29
115 0.28
116 0.28
117 0.27
118 0.24
119 0.28
120 0.26
121 0.24
122 0.25
123 0.27
124 0.35
125 0.34
126 0.34
127 0.36
128 0.36
129 0.37
130 0.34
131 0.33
132 0.24
133 0.24
134 0.22
135 0.16
136 0.15
137 0.14
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.12
151 0.17
152 0.24
153 0.32
154 0.38
155 0.48
156 0.51
157 0.58
158 0.62
159 0.59
160 0.55
161 0.58
162 0.58
163 0.53
164 0.51
165 0.46
166 0.41
167 0.39
168 0.38
169 0.31
170 0.28
171 0.27
172 0.27
173 0.26
174 0.25
175 0.26
176 0.24
177 0.21
178 0.2
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.17
183 0.19
184 0.23
185 0.24
186 0.22
187 0.21
188 0.19
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.13
202 0.17
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.13
209 0.18
210 0.21
211 0.23
212 0.28
213 0.33
214 0.43
215 0.45
216 0.46
217 0.45
218 0.39
219 0.4
220 0.44
221 0.44
222 0.36
223 0.35
224 0.37
225 0.34
226 0.36
227 0.32
228 0.25
229 0.19
230 0.2
231 0.2
232 0.18
233 0.21
234 0.23
235 0.25
236 0.28
237 0.29
238 0.3
239 0.29
240 0.3
241 0.26
242 0.21
243 0.19
244 0.14
245 0.16
246 0.14
247 0.16
248 0.18
249 0.17
250 0.17
251 0.17
252 0.17
253 0.13
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.2
261 0.23
262 0.25
263 0.28
264 0.26
265 0.28
266 0.32
267 0.35
268 0.32
269 0.31
270 0.31
271 0.33
272 0.32
273 0.29
274 0.26
275 0.22
276 0.19
277 0.18
278 0.13
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.13
295 0.13
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.16
301 0.19
302 0.24
303 0.29
304 0.31
305 0.31
306 0.32
307 0.31
308 0.28
309 0.29
310 0.27
311 0.26
312 0.23
313 0.24
314 0.23
315 0.23
316 0.23
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.18
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.21
326 0.19
327 0.23
328 0.27
329 0.28
330 0.28
331 0.35
332 0.39
333 0.39
334 0.45
335 0.46
336 0.49
337 0.54
338 0.6
339 0.61
340 0.61
341 0.64
342 0.64
343 0.61
344 0.58
345 0.6
346 0.62
347 0.63
348 0.7
349 0.72
350 0.75
351 0.81
352 0.87
353 0.91
354 0.9
355 0.91
356 0.91
357 0.9
358 0.88
359 0.87
360 0.83
361 0.78
362 0.74
363 0.69
364 0.65
365 0.56
366 0.51
367 0.46
368 0.41
369 0.36
370 0.33
371 0.28
372 0.22
373 0.24
374 0.24
375 0.24
376 0.31
377 0.32
378 0.31
379 0.37
380 0.37
381 0.38
382 0.42
383 0.47
384 0.47
385 0.51
386 0.58
387 0.59
388 0.66
389 0.7
390 0.69
391 0.67
392 0.61
393 0.61
394 0.54
395 0.48
396 0.42
397 0.34
398 0.29
399 0.22
400 0.19
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.11
405 0.11
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.17
411 0.19
412 0.24
413 0.3
414 0.36
415 0.45
416 0.55
417 0.64
418 0.67
419 0.73
420 0.79
421 0.81
422 0.81
423 0.82
424 0.82
425 0.83
426 0.87
427 0.9
428 0.88
429 0.85
430 0.81
431 0.76
432 0.71
433 0.71
434 0.66
435 0.64
436 0.62
437 0.63
438 0.68
439 0.71
440 0.73