Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165VZA6

Protein Details
Accession A0A165VZA6    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-305KTKTSAPKTKAKKDEKVYLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-53PRGGPASRG
93-113EGRGRGRGRGRGGRGGRGRPF
295-297KAK
310-345FERPSRGGRGGRGGDRGDRGDRGRGGRGRGSGRGRA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVASRNPFALLDEESSRPGTPAAASAKPKEEAPAAPAPANTQKPRGGPASRGGRYYQRGRGGKSNGRDENVAPEDDATSPAEGNGQRRFDGEGRGRGRGRGRGGRGGRGRPFDRHSATGKTDSDKKVHQGWGGDEGNTELRAEVEGNSDAVADTNDLASPAPNNDWAGTTSNNDWAGTTSNNDWAGGDNSADAWNAPADSGDAAPTATEEKTSDRPARREREPREPEEEDNTLTYDQYLAKKKEEAAELVPKLETRKANEGDDSIWKDAVPLKKDEGAESYFAGKTKTSAPKTKAKKDEKVYLEIDARFERPSRGGRGGRGGDRGDRGDRGRGGRGRGSGRGRASGPSTPVVNVDDETAFPALA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.23
5 0.21
6 0.19
7 0.16
8 0.13
9 0.18
10 0.21
11 0.26
12 0.3
13 0.33
14 0.37
15 0.37
16 0.37
17 0.34
18 0.32
19 0.27
20 0.29
21 0.32
22 0.3
23 0.3
24 0.3
25 0.31
26 0.36
27 0.42
28 0.39
29 0.37
30 0.39
31 0.4
32 0.44
33 0.47
34 0.42
35 0.39
36 0.45
37 0.5
38 0.48
39 0.48
40 0.47
41 0.47
42 0.51
43 0.54
44 0.53
45 0.52
46 0.54
47 0.57
48 0.62
49 0.63
50 0.63
51 0.63
52 0.65
53 0.6
54 0.58
55 0.55
56 0.47
57 0.47
58 0.42
59 0.35
60 0.26
61 0.22
62 0.21
63 0.19
64 0.2
65 0.12
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.13
70 0.14
71 0.18
72 0.23
73 0.23
74 0.23
75 0.24
76 0.28
77 0.26
78 0.32
79 0.34
80 0.37
81 0.38
82 0.44
83 0.44
84 0.45
85 0.47
86 0.45
87 0.46
88 0.45
89 0.46
90 0.49
91 0.51
92 0.55
93 0.57
94 0.58
95 0.56
96 0.55
97 0.54
98 0.5
99 0.51
100 0.5
101 0.47
102 0.44
103 0.43
104 0.4
105 0.41
106 0.41
107 0.38
108 0.35
109 0.38
110 0.37
111 0.36
112 0.34
113 0.34
114 0.35
115 0.36
116 0.34
117 0.29
118 0.28
119 0.32
120 0.31
121 0.27
122 0.21
123 0.19
124 0.18
125 0.16
126 0.15
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.1
166 0.11
167 0.09
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.09
199 0.13
200 0.18
201 0.24
202 0.28
203 0.35
204 0.43
205 0.48
206 0.54
207 0.61
208 0.61
209 0.66
210 0.68
211 0.65
212 0.65
213 0.62
214 0.55
215 0.5
216 0.46
217 0.36
218 0.3
219 0.26
220 0.19
221 0.15
222 0.13
223 0.1
224 0.11
225 0.15
226 0.22
227 0.23
228 0.25
229 0.27
230 0.28
231 0.32
232 0.32
233 0.28
234 0.26
235 0.31
236 0.3
237 0.29
238 0.28
239 0.24
240 0.24
241 0.26
242 0.25
243 0.22
244 0.3
245 0.32
246 0.33
247 0.34
248 0.33
249 0.3
250 0.33
251 0.32
252 0.25
253 0.22
254 0.2
255 0.2
256 0.23
257 0.27
258 0.24
259 0.23
260 0.24
261 0.29
262 0.3
263 0.3
264 0.29
265 0.25
266 0.23
267 0.21
268 0.22
269 0.18
270 0.18
271 0.18
272 0.14
273 0.14
274 0.21
275 0.3
276 0.33
277 0.41
278 0.45
279 0.54
280 0.64
281 0.72
282 0.74
283 0.74
284 0.77
285 0.76
286 0.81
287 0.76
288 0.73
289 0.64
290 0.58
291 0.54
292 0.46
293 0.42
294 0.35
295 0.31
296 0.27
297 0.26
298 0.24
299 0.24
300 0.28
301 0.31
302 0.37
303 0.4
304 0.42
305 0.49
306 0.52
307 0.51
308 0.51
309 0.47
310 0.43
311 0.43
312 0.44
313 0.38
314 0.37
315 0.36
316 0.38
317 0.4
318 0.4
319 0.45
320 0.45
321 0.47
322 0.48
323 0.51
324 0.49
325 0.52
326 0.54
327 0.53
328 0.51
329 0.51
330 0.47
331 0.45
332 0.44
333 0.41
334 0.39
335 0.35
336 0.33
337 0.29
338 0.3
339 0.27
340 0.25
341 0.2
342 0.19
343 0.16
344 0.15
345 0.17