FuNGI

A0A165U9J0

Protein Details

Accession

A0A165U9J0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
199-224	SLRNDKDDVKKRKKQAKVKKETTQSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
53-95	RRKKEGEVKQEENVPKPTPTERGRGRGRGRGEGRGGGRGGARG
208-218	KKRKKQAKVKK

Subcellular Location(s)

cyto 15, cyto_nucl 13.5, nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MADNNASGSQPGSSSGPPSSSAPKAIGSLAKKQTDVTRLGTQKLKFVPTLPARRKKEGEVKQEENVPKPTPTERGRGRGRGRGEGRGGGRGGARGGVPPSVEMTASGPFAMGPTMAGSSARRGAPRSNFTPIVPLGSSASSLGAGLTRSAPPTLKGEKGEDAQRVKVEDDEEVYSEPDEGVEIIDMDNVRQMDWMAPESLRNDKDDVKKRKKQAKVKKETTQSADKKGKDIISGVAQTEAMGVEEEPEAATAEVDLANAVDLSESEEEEELEDIIEDFALESEPLEGGDVRRERLYFFQFPEPFPTFLPKRSPPDADPMDVDMADPNAAADVSDAKGKRVSFAQDTKPPAAAGTPIPTGSTLAPAPTPAQGQEENVKLDGQIGQLEIYASGAVKMRMGNGILLDVTAATQPSFLQHAAYLDIETKRLCVLGEVNKRFIVTPNVDALLDDLANASIQDGLQIDEEGLFKMDTDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.19
4	0.2
5	0.23
6	0.27
7	0.27
8	0.28
9	0.27
10	0.27
11	0.27
12	0.28
13	0.31
14	0.29
15	0.35
16	0.41
17	0.41
18	0.4
19	0.42
20	0.45
21	0.44
22	0.44
23	0.41
24	0.42
25	0.43
26	0.47
27	0.51
28	0.46
29	0.47
30	0.48
31	0.46
32	0.38
33	0.37
34	0.42
35	0.45
36	0.55
37	0.58
38	0.64
39	0.67
40	0.73
41	0.75
42	0.74
43	0.75
44	0.73
45	0.74
46	0.73
47	0.71
48	0.67
49	0.71
50	0.66
51	0.61
52	0.56
53	0.48
54	0.4
55	0.39
56	0.38
57	0.39
58	0.39
59	0.43
60	0.45
61	0.52
62	0.58
63	0.64
64	0.67
65	0.66
66	0.66
67	0.66
68	0.63
69	0.61
70	0.57
71	0.53
72	0.49
73	0.46
74	0.42
75	0.33
76	0.3
77	0.24
78	0.21
79	0.16
80	0.15
81	0.12
82	0.13
83	0.13
84	0.12
85	0.11
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.1
90	0.1
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.08
95	0.07
96	0.08
97	0.07
98	0.05
99	0.04
100	0.05
101	0.05
102	0.05
103	0.07
104	0.07
105	0.1
106	0.14
107	0.16
108	0.16
109	0.19
110	0.25
111	0.32
112	0.38
113	0.4
114	0.42
115	0.41
116	0.4
117	0.42
118	0.36
119	0.31
120	0.25
121	0.21
122	0.16
123	0.15
124	0.15
125	0.11
126	0.11
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.07
134	0.08
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.11
139	0.17
140	0.2
141	0.22
142	0.23
143	0.25
144	0.26
145	0.29
146	0.32
147	0.32
148	0.31
149	0.3
150	0.29
151	0.28
152	0.25
153	0.24
154	0.2
155	0.14
156	0.14
157	0.13
158	0.13
159	0.12
160	0.12
161	0.1
162	0.1
163	0.09
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.03
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.08
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.12
186	0.16
187	0.16
188	0.16
189	0.17
190	0.22
191	0.31
192	0.4
193	0.5
194	0.54
195	0.61
196	0.69
197	0.76
198	0.79
199	0.81
200	0.82
201	0.82
202	0.83
203	0.84
204	0.83
205	0.81
206	0.77
207	0.71
208	0.7
209	0.62
210	0.6
211	0.59
212	0.51
213	0.46
214	0.44
215	0.4
216	0.3
217	0.27
218	0.2
219	0.16
220	0.16
221	0.14
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.09
226	0.07
227	0.04
228	0.04
229	0.03
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.03
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.02
248	0.02
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.11
276	0.12
277	0.13
278	0.14
279	0.14
280	0.15
281	0.2
282	0.26
283	0.24
284	0.26
285	0.33
286	0.34
287	0.34
288	0.4
289	0.38
290	0.33
291	0.3
292	0.33
293	0.27
294	0.29
295	0.35
296	0.34
297	0.38
298	0.41
299	0.44
300	0.39
301	0.46
302	0.45
303	0.39
304	0.35
305	0.3
306	0.27
307	0.23
308	0.21
309	0.12
310	0.1
311	0.08
312	0.07
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.06
320	0.1
321	0.11
322	0.12
323	0.15
324	0.15
325	0.17
326	0.18
327	0.22
328	0.25
329	0.31
330	0.37
331	0.41
332	0.46
333	0.45
334	0.43
335	0.39
336	0.32
337	0.26
338	0.21
339	0.16
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.12
354	0.13
355	0.11
356	0.15
357	0.15
358	0.17
359	0.21
360	0.23
361	0.23
362	0.22
363	0.22
364	0.18
365	0.18
366	0.17
367	0.13
368	0.11
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.1
373	0.08
374	0.07
375	0.06
376	0.05
377	0.06
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.13
386	0.11
387	0.12
388	0.1
389	0.1
390	0.09
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.08
399	0.11
400	0.1
401	0.11
402	0.11
403	0.12
404	0.14
405	0.15
406	0.14
407	0.16
408	0.16
409	0.17
410	0.16
411	0.16
412	0.15
413	0.14
414	0.14
415	0.11
416	0.17
417	0.25
418	0.36
419	0.39
420	0.42
421	0.42
422	0.43
423	0.41
424	0.39
425	0.37
426	0.31
427	0.3
428	0.31
429	0.31
430	0.3
431	0.29
432	0.27
433	0.21
434	0.16
435	0.12
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.1
452	0.11
453	0.1

A0A165U9J0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer