FuNGI

A0A165PL61

Protein Details

Accession

A0A165PL61

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
174-195	SPDENVRKRTKSKKTVGPPALG	Hydrophilic
235-265	LQVKGKGSRPKPKPANRGKRSKQRPLSSPCL	Hydrophilic
274-300	TSDGANTSKQKRKTKPRSKPAAQEFPG	Hydrophilic
396-419	TPPPRVGARKKNKGKEKQQPCDFP	Hydrophilic
577-597	IAATRRKSYKQPRPSNPLGLK	Hydrophilic
834-858	DVRSGASKRGAKQKRRDAKATVTES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
238-258	KGKGSRPKPKPANRGKRSKQR
282-293	KQKRKTKPRSKP
331-334	RRKE
379-412	PPRRKARRQPEDFPMNGTPPPRVGARKKNKGKEK
841-849	KRGAKQKRR

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MENLQAEMKSSGHTLSSAPFMRLSRPPSSPVKGRAYENFGTSFGPSNSQKSTSSNGSKMKKGLTPLDRKDEDIWGGFNDSPDEMDLLSSPYRSPDKRKVKSVTGQDEEIPEYIRTSVIPKGLNFKRNKAQDPDATPKPNRSTKTTSSQESSHPGPSKPSNCAGAPTTAKGLGASPDENVRKRTKSKKTVGPPALGMIGRRTVRNSVAKDVFGPHTANVQESQPSGSDDEGVGAALQVKGKGSRPKPKPANRGKRSKQRPLSSPCLPSVSESENTSDGANTSKQKRKTKPRSKPAAQEFPGVSLSPVSDREVKKNGKGKAQAFPMEGVTPPRRKERRQPEGFPVSGTPPPGVFLSLVSDREVKKNGKGKAQAFPMEGVTPPRRKARRQPEDFPMNGTPPPRVGARKKNKGKEKQQPCDFPVSSPLREESPTSTQDAFPDFSPLLAPAHTMEEPPWLEDIGGGHDDEDGTSKRALQPFPMGTQVLASISRDDDMLHTPQSHAVKRLSEGDNVDEGSAMKRHRTNRNTDGTTSHDVIQPDISQVDIDNLFLDPSVDPMTLCPWCDGPLPAHPTPHLASLIAATRRKSYKQPRPSNPLGLKAPLSVFSSVCQRHRFETIQVPLARAKGWPTNIDFGALRRRVEGMKDMLQEIIDDGDRDLYETDLDEMDEEDVRALGPRWQVVFWMDVVKDVQKKGSRVVGSLKNQFGSFEKTQPGYYGEMGSLIIQQTLYTMFPPATFDPKLIAPLNPTEFIQRILVPQVGVALIMDDMHLDVAGAVDTLRESAQYGVAMYPGDDDTGAGEEIVKERAAARRKELEEEEKAEEELMQKMSEVESMDDVRSGASKRGAKQKRRDAKATVTESTKCQYHYVAQQEETRCGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.21
4	0.21
5	0.21
6	0.24
7	0.25
8	0.29
9	0.34
10	0.38
11	0.37
12	0.38
13	0.43
14	0.47
15	0.53
16	0.56
17	0.58
18	0.61
19	0.59
20	0.61
21	0.62
22	0.62
23	0.57
24	0.53
25	0.46
26	0.38
27	0.35
28	0.31
29	0.29
30	0.22
31	0.26
32	0.25
33	0.28
34	0.3
35	0.32
36	0.33
37	0.32
38	0.37
39	0.39
40	0.44
41	0.47
42	0.52
43	0.55
44	0.58
45	0.58
46	0.57
47	0.52
48	0.51
49	0.53
50	0.54
51	0.59
52	0.61
53	0.67
54	0.63
55	0.63
56	0.6
57	0.54
58	0.47
59	0.38
60	0.33
61	0.24
62	0.26
63	0.23
64	0.21
65	0.18
66	0.15
67	0.14
68	0.14
69	0.13
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.11
74	0.12
75	0.12
76	0.11
77	0.16
78	0.23
79	0.27
80	0.35
81	0.43
82	0.53
83	0.6
84	0.7
85	0.72
86	0.74
87	0.78
88	0.79
89	0.78
90	0.71
91	0.66
92	0.58
93	0.53
94	0.46
95	0.38
96	0.3
97	0.21
98	0.17
99	0.15
100	0.14
101	0.12
102	0.13
103	0.16
104	0.18
105	0.21
106	0.21
107	0.31
108	0.37
109	0.45
110	0.47
111	0.51
112	0.56
113	0.61
114	0.66
115	0.63
116	0.64
117	0.63
118	0.67
119	0.67
120	0.66
121	0.66
122	0.62
123	0.62
124	0.62
125	0.62
126	0.58
127	0.57
128	0.57
129	0.56
130	0.64
131	0.63
132	0.6
133	0.57
134	0.55
135	0.52
136	0.49
137	0.45
138	0.43
139	0.41
140	0.36
141	0.39
142	0.45
143	0.44
144	0.44
145	0.44
146	0.41
147	0.37
148	0.4
149	0.36
150	0.34
151	0.32
152	0.29
153	0.28
154	0.24
155	0.23
156	0.2
157	0.19
158	0.15
159	0.15
160	0.14
161	0.13
162	0.2
163	0.25
164	0.28
165	0.32
166	0.35
167	0.38
168	0.47
169	0.56
170	0.6
171	0.65
172	0.72
173	0.77
174	0.81
175	0.85
176	0.82
177	0.75
178	0.65
179	0.56
180	0.5
181	0.41
182	0.32
183	0.23
184	0.23
185	0.21
186	0.21
187	0.22
188	0.22
189	0.27
190	0.34
191	0.35
192	0.38
193	0.39
194	0.38
195	0.37
196	0.38
197	0.34
198	0.29
199	0.27
200	0.19
201	0.21
202	0.21
203	0.2
204	0.18
205	0.17
206	0.16
207	0.16
208	0.16
209	0.12
210	0.14
211	0.13
212	0.12
213	0.12
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.08
218	0.06
219	0.05
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.07
224	0.08
225	0.1
226	0.15
227	0.24
228	0.31
229	0.4
230	0.46
231	0.56
232	0.66
233	0.74
234	0.79
235	0.82
236	0.86
237	0.84
238	0.89
239	0.88
240	0.89
241	0.89
242	0.89
243	0.87
244	0.83
245	0.84
246	0.8
247	0.78
248	0.74
249	0.68
250	0.59
251	0.52
252	0.44
253	0.37
254	0.33
255	0.29
256	0.24
257	0.21
258	0.21
259	0.19
260	0.2
261	0.18
262	0.14
263	0.11
264	0.11
265	0.14
266	0.17
267	0.25
268	0.31
269	0.4
270	0.49
271	0.59
272	0.68
273	0.76
274	0.82
275	0.85
276	0.89
277	0.91
278	0.89
279	0.89
280	0.87
281	0.86
282	0.76
283	0.7
284	0.59
285	0.51
286	0.45
287	0.34
288	0.25
289	0.15
290	0.13
291	0.1
292	0.11
293	0.11
294	0.17
295	0.18
296	0.23
297	0.31
298	0.33
299	0.39
300	0.45
301	0.46
302	0.47
303	0.53
304	0.51
305	0.5
306	0.52
307	0.48
308	0.42
309	0.39
310	0.33
311	0.26
312	0.23
313	0.22
314	0.23
315	0.24
316	0.26
317	0.35
318	0.4
319	0.44
320	0.54
321	0.6
322	0.65
323	0.7
324	0.72
325	0.71
326	0.72
327	0.67
328	0.58
329	0.48
330	0.4
331	0.32
332	0.28
333	0.19
334	0.12
335	0.13
336	0.12
337	0.11
338	0.08
339	0.07
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.12
344	0.15
345	0.15
346	0.18
347	0.22
348	0.21
349	0.26
350	0.33
351	0.36
352	0.4
353	0.46
354	0.47
355	0.49
356	0.52
357	0.48
358	0.42
359	0.39
360	0.33
361	0.26
362	0.23
363	0.22
364	0.23
365	0.23
366	0.25
367	0.32
368	0.36
369	0.41
370	0.5
371	0.57
372	0.62
373	0.66
374	0.69
375	0.69
376	0.72
377	0.66
378	0.6
379	0.51
380	0.41
381	0.35
382	0.3
383	0.22
384	0.15
385	0.17
386	0.15
387	0.19
388	0.24
389	0.33
390	0.43
391	0.53
392	0.61
393	0.68
394	0.76
395	0.8
396	0.83
397	0.83
398	0.83
399	0.83
400	0.82
401	0.78
402	0.7
403	0.69
404	0.59
405	0.49
406	0.46
407	0.4
408	0.33
409	0.28
410	0.27
411	0.2
412	0.21
413	0.21
414	0.17
415	0.17
416	0.18
417	0.19
418	0.19
419	0.18
420	0.19
421	0.19
422	0.16
423	0.13
424	0.14
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.05
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.06
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.12
458	0.15
459	0.16
460	0.15
461	0.2
462	0.2
463	0.21
464	0.22
465	0.19
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.09
470	0.08
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.09
479	0.1
480	0.11
481	0.11
482	0.11
483	0.15
484	0.19
485	0.19
486	0.19
487	0.2
488	0.2
489	0.21
490	0.27
491	0.24
492	0.23
493	0.23
494	0.22
495	0.21
496	0.2
497	0.18
498	0.12
499	0.11
500	0.09
501	0.11
502	0.1
503	0.12
504	0.17
505	0.24
506	0.33
507	0.39
508	0.46
509	0.51
510	0.6
511	0.59
512	0.56
513	0.51
514	0.47
515	0.46
516	0.39
517	0.32
518	0.26
519	0.23
520	0.23
521	0.21
522	0.16
523	0.12
524	0.11
525	0.09
526	0.06
527	0.06
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.07
536	0.04
537	0.06
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.1
543	0.1
544	0.11
545	0.1
546	0.09
547	0.11
548	0.12
549	0.13
550	0.12
551	0.18
552	0.24
553	0.24
554	0.25
555	0.24
556	0.26
557	0.26
558	0.26
559	0.2
560	0.13
561	0.12
562	0.13
563	0.17
564	0.19
565	0.2
566	0.19
567	0.23
568	0.26
569	0.29
570	0.37
571	0.43
572	0.49
573	0.58
574	0.68
575	0.72
576	0.78
577	0.8
578	0.81
579	0.73
580	0.69
581	0.6
582	0.51
583	0.43
584	0.36
585	0.31
586	0.23
587	0.22
588	0.17
589	0.15
590	0.13
591	0.2
592	0.22
593	0.26
594	0.29
595	0.29
596	0.3
597	0.35
598	0.36
599	0.32
600	0.38
601	0.37
602	0.4
603	0.39
604	0.38
605	0.35
606	0.34
607	0.3
608	0.22
609	0.21
610	0.19
611	0.2
612	0.22
613	0.23
614	0.26
615	0.26
616	0.27
617	0.24
618	0.22
619	0.29
620	0.28
621	0.25
622	0.22
623	0.24
624	0.23
625	0.25
626	0.28
627	0.23
628	0.27
629	0.28
630	0.27
631	0.26
632	0.24
633	0.22
634	0.17
635	0.14
636	0.08
637	0.07
638	0.07
639	0.08
640	0.08
641	0.09
642	0.08
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.08
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.08
652	0.08
653	0.07
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.07
658	0.07
659	0.1
660	0.11
661	0.14
662	0.15
663	0.15
664	0.16
665	0.16
666	0.17
667	0.14
668	0.16
669	0.14
670	0.14
671	0.15
672	0.19
673	0.21
674	0.21
675	0.27
676	0.28
677	0.29
678	0.32
679	0.38
680	0.34
681	0.33
682	0.4
683	0.42
684	0.44
685	0.5
686	0.48
687	0.42
688	0.41
689	0.4
690	0.35
691	0.34
692	0.3
693	0.27
694	0.29
695	0.29
696	0.3
697	0.3
698	0.3
699	0.25
700	0.23
701	0.2
702	0.15
703	0.14
704	0.14
705	0.13
706	0.12
707	0.1
708	0.09
709	0.07
710	0.07
711	0.07
712	0.08
713	0.08
714	0.07
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.13
719	0.14
720	0.19
721	0.19
722	0.19
723	0.2
724	0.21
725	0.26
726	0.23
727	0.22
728	0.19
729	0.24
730	0.27
731	0.26
732	0.26
733	0.25
734	0.24
735	0.25
736	0.24
737	0.19
738	0.17
739	0.19
740	0.2
741	0.16
742	0.15
743	0.14
744	0.12
745	0.11
746	0.09
747	0.06
748	0.05
749	0.05
750	0.05
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.03
757	0.04
758	0.04
759	0.04
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.06
767	0.07
768	0.09
769	0.09
770	0.1
771	0.09
772	0.1
773	0.1
774	0.09
775	0.1
776	0.09
777	0.09
778	0.08
779	0.07
780	0.08
781	0.1
782	0.09
783	0.07
784	0.08
785	0.08
786	0.1
787	0.12
788	0.1
789	0.09
790	0.12
791	0.2
792	0.28
793	0.31
794	0.36
795	0.44
796	0.47
797	0.53
798	0.57
799	0.57
800	0.55
801	0.56
802	0.53
803	0.45
804	0.43
805	0.37
806	0.31
807	0.25
808	0.22
809	0.19
810	0.14
811	0.13
812	0.14
813	0.14
814	0.15
815	0.14
816	0.12
817	0.14
818	0.16
819	0.16
820	0.16
821	0.16
822	0.14
823	0.16
824	0.16
825	0.17
826	0.23
827	0.29
828	0.35
829	0.46
830	0.56
831	0.62
832	0.71
833	0.78
834	0.81
835	0.84
836	0.84
837	0.8
838	0.8
839	0.81
840	0.76
841	0.71
842	0.65
843	0.59
844	0.56
845	0.53
846	0.46
847	0.38
848	0.34
849	0.31
850	0.33
851	0.39
852	0.44
853	0.45
854	0.46
855	0.51
856	0.52

A0A165PL61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer