Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165RSM3

Protein Details
Accession A0A165RSM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-34DEELVRRKKRANLRKLNVVPNQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-21KKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MDNTQAQAAKVDEELVRRKKRANLRKLNVVPNQESSKALDSSLKRHTALIKRIRQSVGADNRDQILKDIDSLSLEKYVDEIVGAVAEGILRCKTEKDVWSAVEVISALHRRFPTTFTPSVVELLSQAIAPPSRAALSSLTPEQREKDDSARISRQRPVLRVCSELALIGIIRDTPERSGGEWIMRALKDLLSNDPTLSSLPLLSTFLKSYSRPYLGIVAPTSNSKQISASAEPGTLSGATTDEATNAAFPALSANNEEEELVEKDIRDRFKRMCEGYFENVAKKLVMEHKRLQEQDRRNHEAYIKSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLLASCQTLSELLYLPMPELPTITQKSESILIGGGTNGLSDDIDESLLTVGGKWEDDEERRFFEDILDLKDMVPKSVLGIEEEKDAEKDEEEKKKEKEREEEEVRKLEKEIEGLSLAEDANDNGVGKNTESDDSEDDGEDDAPTPVPGSPRAGAATPPPSSTEAQGPSQLLTALLARLPDCTNRALIDQAAVDFAFLNSKAARKRLVKFLSQVPKNRTDVLPHYSRFVATLNRYMPDVGSELVAVLDEEFRYLQRKKKVVKELYETRVKNITFISSLTKFCVIPTHLILHMFKVCLDDFSGTNVENIAMLLEGCGRFLLRSDATKERFAKMLELMKRKQSTQHFDHRQQLLLENAYYQCNPPERAPRQEKERTLMELFIRHLIYDVLSKKSIDKVLKLIRKLDWEDASVYRSLHKVFTKPWKIKYSNIGLLAMLAYDLQRYHPEFSVAVVDQVLEDIRRGLEQNVYNVNQRRVATMRYLGELYIYRLYSSSIIFDTFWTLVTFGHPEGRPLPRQPCPLDMPDDFFRIRLVCTLLDTCGMCFDRGSQKRKLDNFLTFFQYYILCKEQLPMDVEFMVTDSIEAVRPETKMYKDIEEAAAVVDEMFSAVFKEAGLTIGGTEDSGDDSGEEDERHGQDEDDGEDEQVTLASPVDERAPSPETVLTASISHEKVGPTEEEDAEFAKELAKMLVDSSAESKKVDRRTAQTLWDSSILPPAVRKHRGDGIESGAPDLDDQGIMKFTLVTKKGNKPQTKSLAVPSESALAVQTRSAQLQDKVEQQQLKRLVLDYEQREEAEELKALETRNRGGAIKIRIAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.46
4 0.49
5 0.55
6 0.6
7 0.69
8 0.74
9 0.76
10 0.77
11 0.77
12 0.84
13 0.86
14 0.87
15 0.83
16 0.8
17 0.72
18 0.68
19 0.64
20 0.55
21 0.48
22 0.43
23 0.41
24 0.33
25 0.31
26 0.31
27 0.29
28 0.34
29 0.41
30 0.41
31 0.37
32 0.4
33 0.48
34 0.5
35 0.57
36 0.61
37 0.62
38 0.64
39 0.7
40 0.68
41 0.62
42 0.57
43 0.57
44 0.57
45 0.54
46 0.51
47 0.46
48 0.47
49 0.46
50 0.42
51 0.33
52 0.28
53 0.22
54 0.22
55 0.21
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.1
79 0.11
80 0.16
81 0.23
82 0.27
83 0.32
84 0.37
85 0.37
86 0.39
87 0.39
88 0.34
89 0.28
90 0.23
91 0.17
92 0.17
93 0.21
94 0.18
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.26
99 0.3
100 0.32
101 0.35
102 0.37
103 0.34
104 0.37
105 0.35
106 0.35
107 0.31
108 0.24
109 0.17
110 0.15
111 0.13
112 0.1
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.18
125 0.24
126 0.26
127 0.28
128 0.3
129 0.31
130 0.33
131 0.35
132 0.33
133 0.33
134 0.37
135 0.39
136 0.45
137 0.51
138 0.53
139 0.54
140 0.57
141 0.6
142 0.58
143 0.6
144 0.59
145 0.59
146 0.56
147 0.54
148 0.49
149 0.43
150 0.37
151 0.3
152 0.23
153 0.15
154 0.12
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.19
166 0.2
167 0.22
168 0.21
169 0.22
170 0.24
171 0.23
172 0.23
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.21
177 0.24
178 0.22
179 0.23
180 0.21
181 0.2
182 0.2
183 0.17
184 0.16
185 0.12
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.15
194 0.17
195 0.18
196 0.22
197 0.27
198 0.28
199 0.27
200 0.28
201 0.32
202 0.3
203 0.33
204 0.28
205 0.23
206 0.21
207 0.23
208 0.23
209 0.21
210 0.21
211 0.18
212 0.18
213 0.19
214 0.24
215 0.23
216 0.25
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.21
221 0.18
222 0.13
223 0.11
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.09
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.16
252 0.2
253 0.26
254 0.27
255 0.3
256 0.32
257 0.39
258 0.47
259 0.47
260 0.45
261 0.45
262 0.48
263 0.47
264 0.51
265 0.44
266 0.39
267 0.37
268 0.34
269 0.28
270 0.22
271 0.22
272 0.24
273 0.29
274 0.34
275 0.39
276 0.46
277 0.52
278 0.55
279 0.57
280 0.57
281 0.59
282 0.63
283 0.65
284 0.65
285 0.6
286 0.6
287 0.58
288 0.52
289 0.46
290 0.43
291 0.35
292 0.27
293 0.26
294 0.24
295 0.22
296 0.2
297 0.2
298 0.22
299 0.21
300 0.22
301 0.24
302 0.24
303 0.26
304 0.3
305 0.28
306 0.23
307 0.26
308 0.27
309 0.27
310 0.32
311 0.33
312 0.29
313 0.29
314 0.3
315 0.3
316 0.3
317 0.28
318 0.23
319 0.19
320 0.17
321 0.16
322 0.13
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.14
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.2
340 0.19
341 0.14
342 0.12
343 0.11
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.07
367 0.09
368 0.12
369 0.17
370 0.18
371 0.2
372 0.22
373 0.22
374 0.21
375 0.19
376 0.2
377 0.18
378 0.2
379 0.19
380 0.17
381 0.17
382 0.21
383 0.2
384 0.15
385 0.14
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.12
390 0.1
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.11
397 0.12
398 0.11
399 0.09
400 0.13
401 0.19
402 0.26
403 0.3
404 0.36
405 0.39
406 0.48
407 0.53
408 0.54
409 0.56
410 0.54
411 0.6
412 0.63
413 0.66
414 0.61
415 0.62
416 0.57
417 0.49
418 0.43
419 0.36
420 0.27
421 0.21
422 0.18
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.1
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.11
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.08
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.14
467 0.17
468 0.15
469 0.15
470 0.16
471 0.18
472 0.18
473 0.19
474 0.2
475 0.18
476 0.18
477 0.19
478 0.18
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.09
483 0.07
484 0.07
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.05
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.09
512 0.11
513 0.13
514 0.19
515 0.24
516 0.27
517 0.35
518 0.38
519 0.38
520 0.39
521 0.46
522 0.49
523 0.49
524 0.52
525 0.47
526 0.49
527 0.48
528 0.47
529 0.39
530 0.33
531 0.32
532 0.31
533 0.32
534 0.27
535 0.27
536 0.25
537 0.24
538 0.21
539 0.19
540 0.17
541 0.14
542 0.19
543 0.18
544 0.18
545 0.18
546 0.17
547 0.16
548 0.13
549 0.12
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.04
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.04
562 0.04
563 0.09
564 0.12
565 0.18
566 0.25
567 0.31
568 0.36
569 0.45
570 0.55
571 0.57
572 0.6
573 0.62
574 0.63
575 0.62
576 0.65
577 0.56
578 0.48
579 0.47
580 0.42
581 0.35
582 0.27
583 0.23
584 0.15
585 0.15
586 0.18
587 0.15
588 0.15
589 0.15
590 0.16
591 0.15
592 0.14
593 0.17
594 0.14
595 0.13
596 0.14
597 0.15
598 0.15
599 0.16
600 0.16
601 0.14
602 0.14
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.1
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.08
611 0.1
612 0.11
613 0.09
614 0.09
615 0.09
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.04
620 0.03
621 0.03
622 0.03
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.05
630 0.08
631 0.08
632 0.1
633 0.15
634 0.22
635 0.25
636 0.31
637 0.32
638 0.3
639 0.31
640 0.29
641 0.27
642 0.24
643 0.28
644 0.29
645 0.34
646 0.34
647 0.39
648 0.4
649 0.39
650 0.42
651 0.43
652 0.44
653 0.44
654 0.53
655 0.54
656 0.57
657 0.65
658 0.59
659 0.53
660 0.46
661 0.42
662 0.33
663 0.26
664 0.21
665 0.15
666 0.14
667 0.13
668 0.13
669 0.11
670 0.12
671 0.14
672 0.16
673 0.18
674 0.27
675 0.3
676 0.4
677 0.47
678 0.48
679 0.54
680 0.6
681 0.59
682 0.53
683 0.52
684 0.46
685 0.4
686 0.38
687 0.3
688 0.25
689 0.24
690 0.22
691 0.2
692 0.15
693 0.15
694 0.12
695 0.11
696 0.14
697 0.15
698 0.15
699 0.16
700 0.16
701 0.17
702 0.2
703 0.25
704 0.22
705 0.22
706 0.27
707 0.35
708 0.4
709 0.41
710 0.41
711 0.37
712 0.41
713 0.42
714 0.39
715 0.31
716 0.28
717 0.28
718 0.26
719 0.25
720 0.21
721 0.18
722 0.15
723 0.15
724 0.15
725 0.16
726 0.18
727 0.19
728 0.24
729 0.35
730 0.43
731 0.47
732 0.54
733 0.59
734 0.59
735 0.61
736 0.62
737 0.59
738 0.54
739 0.5
740 0.43
741 0.34
742 0.31
743 0.26
744 0.19
745 0.11
746 0.06
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.05
751 0.08
752 0.11
753 0.13
754 0.14
755 0.15
756 0.15
757 0.15
758 0.18
759 0.15
760 0.14
761 0.11
762 0.1
763 0.09
764 0.09
765 0.08
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.06
771 0.07
772 0.08
773 0.14
774 0.15
775 0.19
776 0.23
777 0.24
778 0.3
779 0.33
780 0.34
781 0.33
782 0.32
783 0.32
784 0.29
785 0.3
786 0.27
787 0.28
788 0.27
789 0.24
790 0.24
791 0.2
792 0.2
793 0.18
794 0.18
795 0.16
796 0.15
797 0.13
798 0.13
799 0.14
800 0.13
801 0.13
802 0.12
803 0.09
804 0.1
805 0.1
806 0.1
807 0.12
808 0.11
809 0.11
810 0.1
811 0.1
812 0.09
813 0.1
814 0.11
815 0.09
816 0.15
817 0.15
818 0.16
819 0.21
820 0.25
821 0.28
822 0.32
823 0.38
824 0.39
825 0.45
826 0.46
827 0.47
828 0.46
829 0.45
830 0.45
831 0.39
832 0.39
833 0.34
834 0.35
835 0.3
836 0.26
837 0.24
838 0.19
839 0.19
840 0.15
841 0.14
842 0.11
843 0.14
844 0.14
845 0.14
846 0.15
847 0.15
848 0.13
849 0.16
850 0.16
851 0.14
852 0.13
853 0.16
854 0.25
855 0.32
856 0.37
857 0.41
858 0.48
859 0.56
860 0.6
861 0.63
862 0.59
863 0.59
864 0.58
865 0.54
866 0.52
867 0.44
868 0.39
869 0.34
870 0.29
871 0.22
872 0.22
873 0.21
874 0.16
875 0.16
876 0.18
877 0.19
878 0.21
879 0.23
880 0.2
881 0.19
882 0.18
883 0.18
884 0.16
885 0.14
886 0.1
887 0.07
888 0.06
889 0.05
890 0.06
891 0.07
892 0.07
893 0.08
894 0.1
895 0.11
896 0.14
897 0.17
898 0.19
899 0.22
900 0.24
901 0.26
902 0.26
903 0.28
904 0.26
905 0.23
906 0.21
907 0.17
908 0.14
909 0.11
910 0.09
911 0.06
912 0.04
913 0.04
914 0.04
915 0.03
916 0.04
917 0.04
918 0.05
919 0.05
920 0.05
921 0.06
922 0.07
923 0.07
924 0.06
925 0.06
926 0.07
927 0.07
928 0.06
929 0.06
930 0.05
931 0.06
932 0.06
933 0.06
934 0.05
935 0.06
936 0.08
937 0.09
938 0.09
939 0.09
940 0.13
941 0.14
942 0.16
943 0.16
944 0.15
945 0.15
946 0.17
947 0.17
948 0.15
949 0.14
950 0.12
951 0.12
952 0.12
953 0.1
954 0.08
955 0.07
956 0.05
957 0.05
958 0.05
959 0.06
960 0.07
961 0.09
962 0.1
963 0.1
964 0.14
965 0.17
966 0.17
967 0.19
968 0.19
969 0.17
970 0.18
971 0.19
972 0.15
973 0.13
974 0.15
975 0.18
976 0.17
977 0.17
978 0.18
979 0.17
980 0.17
981 0.19
982 0.18
983 0.16
984 0.2
985 0.2
986 0.19
987 0.19
988 0.2
989 0.18
990 0.17
991 0.14
992 0.11
993 0.11
994 0.11
995 0.11
996 0.1
997 0.09
998 0.09
999 0.12
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.15
1003 0.18
1004 0.19
1005 0.19
1006 0.23
1007 0.27
1008 0.35
1009 0.41
1010 0.43
1011 0.46
1012 0.53
1013 0.56
1014 0.59
1015 0.59
1016 0.53
1017 0.49
1018 0.45
1019 0.4
1020 0.32
1021 0.34
1022 0.28
1023 0.22
1024 0.24
1025 0.28
1026 0.36
1027 0.41
1028 0.43
1029 0.42
1030 0.49
1031 0.52
1032 0.51
1033 0.47
1034 0.44
1035 0.41
1036 0.39
1037 0.35
1038 0.27
1039 0.24
1040 0.2
1041 0.18
1042 0.12
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.09
1047 0.09
1048 0.09
1049 0.09
1050 0.12
1051 0.2
1052 0.22
1053 0.28
1054 0.35
1055 0.45
1056 0.54
1057 0.63
1058 0.69
1059 0.67
1060 0.75
1061 0.77
1062 0.76
1063 0.69
1064 0.69
1065 0.67
1066 0.6
1067 0.55
1068 0.46
1069 0.4
1070 0.33
1071 0.29
1072 0.22
1073 0.15
1074 0.14
1075 0.13
1076 0.15
1077 0.14
1078 0.15
1079 0.18
1080 0.22
1081 0.25
1082 0.31
1083 0.34
1084 0.38
1085 0.42
1086 0.47
1087 0.51
1088 0.47
1089 0.52
1090 0.52
1091 0.5
1092 0.44
1093 0.41
1094 0.36
1095 0.36
1096 0.44
1097 0.4
1098 0.39
1099 0.38
1100 0.37
1101 0.38
1102 0.36
1103 0.32
1104 0.26
1105 0.23
1106 0.18
1107 0.18
1108 0.2
1109 0.19
1110 0.23
1111 0.25
1112 0.25
1113 0.28
1114 0.29
1115 0.29
1116 0.3
1117 0.37
1118 0.39