Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EEX0

Protein Details
Accession J6EEX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
185-204RISRERKPYLHESRHKHAMRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-209KRRYARAKLEEKLRISRERKPYLHESRHKHAMRRPRGE
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018362  CCAAT-binding_factor_CS  
IPR001289  NFYA  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02045  CBFB_NFYA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00686  NFYA_HAP2_1  
PS51152  NFYA_HAP2_2  
Amino Acid Sequences MSADETDAKFHPLETDLQSGTAATVSAVSAAHSRSPSLQGRPMDMSMDMDKSSSRRNEDQQDTNEDDLLLFNRLRTSQNRTMSSLEPQQQPQYTPASAPMTEPSADFTGFSSITTLPSHSPHDQQQEQQQQHLVVQAQYTQGQPSLQNDTLGISMAEQPFYVNAKQYYRILKRRYARAKLEEKLRISRERKPYLHESRHKHAMRRPRGEGGGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.19
7 0.18
8 0.14
9 0.1
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.08
17 0.09
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.15
22 0.21
23 0.25
24 0.28
25 0.33
26 0.32
27 0.35
28 0.37
29 0.36
30 0.31
31 0.26
32 0.25
33 0.2
34 0.2
35 0.16
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.2
40 0.22
41 0.26
42 0.29
43 0.36
44 0.45
45 0.5
46 0.55
47 0.53
48 0.54
49 0.52
50 0.48
51 0.41
52 0.32
53 0.26
54 0.19
55 0.16
56 0.12
57 0.09
58 0.08
59 0.09
60 0.11
61 0.14
62 0.17
63 0.25
64 0.31
65 0.38
66 0.4
67 0.41
68 0.43
69 0.41
70 0.42
71 0.39
72 0.36
73 0.32
74 0.31
75 0.32
76 0.29
77 0.29
78 0.27
79 0.24
80 0.19
81 0.16
82 0.18
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.15
106 0.15
107 0.18
108 0.21
109 0.28
110 0.28
111 0.3
112 0.37
113 0.42
114 0.41
115 0.39
116 0.37
117 0.3
118 0.29
119 0.29
120 0.21
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.07
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.18
152 0.21
153 0.25
154 0.34
155 0.4
156 0.49
157 0.5
158 0.56
159 0.61
160 0.68
161 0.74
162 0.73
163 0.73
164 0.73
165 0.77
166 0.75
167 0.76
168 0.73
169 0.68
170 0.67
171 0.65
172 0.65
173 0.61
174 0.63
175 0.65
176 0.67
177 0.65
178 0.64
179 0.69
180 0.7
181 0.76
182 0.76
183 0.74
184 0.73
185 0.81
186 0.78
187 0.75
188 0.72
189 0.72
190 0.74
191 0.75
192 0.72
193 0.7