FuNGI

A0A165PBJ1

Protein Details

Accession

A0A165PBJ1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
784-807	LKELQAKEVQRKRRQAQNNQGLGV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto 10, mito_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MAAFSSVMDEDIDWTPVLSDHPIFQPKDEVSNASNKGKMSALELSTSSFSKYTRLDPGDDGMSPSGRRQVMAARDGDLIVAVGEELRIMSLGESKLQPSARKSYKVLYTPNIAFEITQLAVNLNGKLLAVAGAYQVAVVVLPKPGFAKLVTPSVDCKSIQVGQFYHASATSIPIAKIEWHPWGEGGSTLLVMTVDGKLRGYDVSVDPEEPQQMLSFVPQRKRKSYLAQGEAERVVASFALGKGRGDWGPLTVYALMRSGDIYAISPYMPVNSSIPSDYVHSLDCFVAAKQQHLTQEDDSPESTALHAIYEYQRKYVAALVKQLPSEPADPADTRPVHMHPPNIIKIKPARQGPFLMQPAPRELVDSEDINATDIAYLTFDAFEDHGETETERLGIVAVAYEDGRVDVCMDVEKIEPKWDNKSRVDRGLPMLAVYETIDLGLLPMLSRLSSKGKEHDSNVPINHPVLLVDPIHEDVVYVYHAFGLHVLHLGPVLQSLTQALKGDEQEVETAVGKSEAIVVRPMLSTFSGEQKLRSSNPVISVVIPSNIYLTSGVFVLTSMRQVVYIPLTLDIDEPPEPSKETPLAIEGPKDLSVMRSPGGPPAYVSLLGTEFYDPPSILSNFSALPPTARPTLAHRSEMITPDILRFLGTIIEHFTHQIGEVRIAHKNAEARHELQIQEYQRQQEKLQEMNNLCGQLKGARHSATLERARRLQEAQKALFERLDRTLQAMMRKVSPELNQHERKWFEELKRMKGEVLGATRYDEESLSSRVKLLRREYDRLLPNLKELQAKEVQRKRRQAQNNQGLGVSQAFELGERSNEERSRIHSLGDQISRLATRLDITLGHAPPLKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.12
4	0.13
5	0.13
6	0.13
7	0.15
8	0.22
9	0.29
10	0.29
11	0.3
12	0.35
13	0.34
14	0.38
15	0.37
16	0.34
17	0.3
18	0.38
19	0.41
20	0.39
21	0.4
22	0.35
23	0.35
24	0.34
25	0.31
26	0.27
27	0.28
28	0.25
29	0.25
30	0.25
31	0.25
32	0.25
33	0.25
34	0.22
35	0.17
36	0.16
37	0.19
38	0.22
39	0.24
40	0.31
41	0.34
42	0.36
43	0.36
44	0.4
45	0.37
46	0.35
47	0.33
48	0.25
49	0.25
50	0.22
51	0.22
52	0.25
53	0.23
54	0.22
55	0.22
56	0.27
57	0.31
58	0.36
59	0.35
60	0.31
61	0.31
62	0.31
63	0.29
64	0.22
65	0.15
66	0.09
67	0.07
68	0.05
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.04
74	0.04
75	0.04
76	0.05
77	0.09
78	0.1
79	0.13
80	0.15
81	0.16
82	0.2
83	0.24
84	0.28
85	0.28
86	0.38
87	0.41
88	0.46
89	0.48
90	0.5
91	0.55
92	0.57
93	0.58
94	0.53
95	0.54
96	0.5
97	0.49
98	0.44
99	0.36
100	0.29
101	0.23
102	0.22
103	0.15
104	0.14
105	0.11
106	0.1
107	0.12
108	0.14
109	0.13
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.08
114	0.08
115	0.06
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.05
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.09
131	0.1
132	0.12
133	0.12
134	0.15
135	0.16
136	0.22
137	0.23
138	0.23
139	0.26
140	0.28
141	0.3
142	0.26
143	0.24
144	0.22
145	0.25
146	0.26
147	0.27
148	0.25
149	0.24
150	0.27
151	0.26
152	0.22
153	0.18
154	0.16
155	0.12
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.13
160	0.13
161	0.14
162	0.15
163	0.18
164	0.19
165	0.21
166	0.2
167	0.21
168	0.21
169	0.21
170	0.19
171	0.16
172	0.14
173	0.09
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.05
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.11
189	0.11
190	0.16
191	0.17
192	0.18
193	0.18
194	0.2
195	0.2
196	0.16
197	0.15
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.12
202	0.17
203	0.22
204	0.3
205	0.37
206	0.43
207	0.48
208	0.53
209	0.55
210	0.57
211	0.62
212	0.64
213	0.62
214	0.61
215	0.57
216	0.55
217	0.5
218	0.41
219	0.31
220	0.21
221	0.14
222	0.09
223	0.08
224	0.06
225	0.06
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.13
234	0.11
235	0.12
236	0.12
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.12
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.12
267	0.11
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.09
272	0.08
273	0.13
274	0.12
275	0.13
276	0.14
277	0.17
278	0.2
279	0.21
280	0.24
281	0.21
282	0.25
283	0.24
284	0.24
285	0.22
286	0.19
287	0.17
288	0.14
289	0.13
290	0.1
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.07
295	0.11
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.18
300	0.18
301	0.19
302	0.21
303	0.22
304	0.18
305	0.24
306	0.26
307	0.27
308	0.28
309	0.27
310	0.24
311	0.21
312	0.2
313	0.15
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.15
318	0.21
319	0.18
320	0.18
321	0.2
322	0.2
323	0.24
324	0.26
325	0.27
326	0.24
327	0.29
328	0.34
329	0.35
330	0.34
331	0.32
332	0.35
333	0.4
334	0.41
335	0.42
336	0.38
337	0.38
338	0.4
339	0.39
340	0.41
341	0.36
342	0.33
343	0.29
344	0.27
345	0.27
346	0.26
347	0.23
348	0.17
349	0.15
350	0.15
351	0.15
352	0.14
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.11
357	0.11
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.04
391	0.03
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.08
400	0.07
401	0.11
402	0.13
403	0.14
404	0.22
405	0.27
406	0.33
407	0.37
408	0.45
409	0.45
410	0.49
411	0.49
412	0.42
413	0.39
414	0.35
415	0.29
416	0.21
417	0.18
418	0.12
419	0.11
420	0.09
421	0.06
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.02
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.04
434	0.06
435	0.1
436	0.12
437	0.14
438	0.18
439	0.24
440	0.26
441	0.29
442	0.35
443	0.34
444	0.36
445	0.35
446	0.32
447	0.27
448	0.25
449	0.22
450	0.14
451	0.11
452	0.08
453	0.09
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.05
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.04
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.09
488	0.09
489	0.11
490	0.1
491	0.1
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.07
498	0.07
499	0.06
500	0.06
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.09
505	0.09
506	0.1
507	0.11
508	0.11
509	0.08
510	0.08
511	0.09
512	0.09
513	0.14
514	0.17
515	0.17
516	0.18
517	0.2
518	0.23
519	0.22
520	0.25
521	0.23
522	0.21
523	0.23
524	0.25
525	0.23
526	0.2
527	0.21
528	0.18
529	0.16
530	0.14
531	0.11
532	0.09
533	0.09
534	0.09
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.05
541	0.05
542	0.06
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.11
562	0.11
563	0.13
564	0.12
565	0.15
566	0.14
567	0.14
568	0.14
569	0.15
570	0.17
571	0.16
572	0.17
573	0.15
574	0.15
575	0.15
576	0.14
577	0.12
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.17
585	0.18
586	0.16
587	0.14
588	0.15
589	0.16
590	0.15
591	0.14
592	0.11
593	0.1
594	0.1
595	0.11
596	0.1
597	0.08
598	0.09
599	0.1
600	0.09
601	0.09
602	0.13
603	0.13
604	0.13
605	0.13
606	0.13
607	0.13
608	0.14
609	0.15
610	0.11
611	0.12
612	0.12
613	0.15
614	0.16
615	0.16
616	0.16
617	0.21
618	0.31
619	0.33
620	0.33
621	0.31
622	0.32
623	0.35
624	0.36
625	0.31
626	0.23
627	0.2
628	0.19
629	0.19
630	0.15
631	0.12
632	0.1
633	0.09
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.1
638	0.11
639	0.11
640	0.12
641	0.12
642	0.1
643	0.11
644	0.14
645	0.12
646	0.15
647	0.18
648	0.2
649	0.23
650	0.24
651	0.23
652	0.22
653	0.26
654	0.24
655	0.27
656	0.29
657	0.28
658	0.33
659	0.36
660	0.33
661	0.31
662	0.35
663	0.32
664	0.33
665	0.34
666	0.35
667	0.37
668	0.39
669	0.37
670	0.39
671	0.41
672	0.41
673	0.41
674	0.43
675	0.39
676	0.42
677	0.43
678	0.37
679	0.33
680	0.27
681	0.25
682	0.21
683	0.22
684	0.22
685	0.24
686	0.23
687	0.24
688	0.27
689	0.3
690	0.34
691	0.4
692	0.42
693	0.41
694	0.45
695	0.47
696	0.47
697	0.48
698	0.46
699	0.45
700	0.48
701	0.46
702	0.48
703	0.48
704	0.46
705	0.44
706	0.38
707	0.33
708	0.29
709	0.3
710	0.24
711	0.24
712	0.27
713	0.27
714	0.31
715	0.33
716	0.31
717	0.31
718	0.32
719	0.31
720	0.31
721	0.33
722	0.36
723	0.39
724	0.47
725	0.51
726	0.53
727	0.59
728	0.57
729	0.55
730	0.54
731	0.54
732	0.49
733	0.51
734	0.55
735	0.55
736	0.59
737	0.58
738	0.51
739	0.46
740	0.44
741	0.4
742	0.38
743	0.31
744	0.25
745	0.26
746	0.26
747	0.25
748	0.23
749	0.17
750	0.15
751	0.16
752	0.19
753	0.2
754	0.19
755	0.21
756	0.26
757	0.3
758	0.35
759	0.4
760	0.46
761	0.51
762	0.57
763	0.59
764	0.64
765	0.66
766	0.64
767	0.62
768	0.53
769	0.51
770	0.5
771	0.48
772	0.45
773	0.4
774	0.4
775	0.42
776	0.46
777	0.52
778	0.55
779	0.62
780	0.65
781	0.75
782	0.75
783	0.78
784	0.83
785	0.84
786	0.86
787	0.87
788	0.83
789	0.74
790	0.67
791	0.57
792	0.48
793	0.38
794	0.28
795	0.17
796	0.11
797	0.09
798	0.09
799	0.11
800	0.1
801	0.11
802	0.14
803	0.17
804	0.23
805	0.26
806	0.29
807	0.3
808	0.35
809	0.41
810	0.38
811	0.38
812	0.35
813	0.39
814	0.44
815	0.44
816	0.4
817	0.31
818	0.33
819	0.32
820	0.28
821	0.23
822	0.15
823	0.13
824	0.14
825	0.14
826	0.13
827	0.17
828	0.24
829	0.24
830	0.26

A0A165PBJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer