Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8TXM3

Protein Details
Accession J8TXM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-64YRRNGGKVKKVKNSDIPGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-64RRNGGKVKKVKNSDIPGKK
461-466VKRLKP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MSGFKYPVDPLLPPPCFLSLPYFPFSSKDPLFFPSGPGRRNAVAYRRNGGKVKKVKNSDIPGKKMKTISRVRSYYCFGKEVKQKEQKAREIVEENSEMNSLTSNTSLNGTPVNEAPVASSEPVNMFETMVANPIKVSRLQSNGVLTGAAANTKSIHYSLANFNVFQLLPKETARGVDDLTRMEMALLSEIPEEIKWSLKKYLTYSNKAPYMISLRTLPDLLPLFKTFILPLERIVEGLNQSSICDSDAMDSLQMGLNALLILRNLAQDTDSVQVLVKDAEIKSFILFVLKKFQCVATGDNKWQLYEGNATFFNELTHYTLDLMEAISSYIAPAMKDDHYFQTLVSILNYTKDRYMVISILRSLSRLLVRSKANEESAADNLDHKTLSLIVSFLLVECDSELIIASLDFLYQYVLPGSQRITELFKSKECSLILEATLPNLLSYNIATPDYNSLQRHKIKLVKRLKPPAPKEPPNLSDELFQQLFKLNEPLRSTTWLRCCFEPVQEAEFTQISLWRSYESKFGQLVRESGRKLLPAVEFIKNVSNAFNNAAAIVITDPVTGKKRFVIKGIRPRFKPLSIVDGERESQVPISALKSKFLNDSEEITPARQNSIPDIKFPQELSDVSKVACTFLCLLSNDTNDGVGSAFCQRIRPLVLHKLADIPPLTLALSEYMGNTSGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.32
4 0.31
5 0.32
6 0.28
7 0.32
8 0.34
9 0.33
10 0.31
11 0.33
12 0.35
13 0.36
14 0.32
15 0.29
16 0.29
17 0.3
18 0.36
19 0.34
20 0.36
21 0.38
22 0.42
23 0.41
24 0.43
25 0.44
26 0.4
27 0.45
28 0.46
29 0.46
30 0.47
31 0.5
32 0.54
33 0.56
34 0.6
35 0.61
36 0.61
37 0.61
38 0.64
39 0.68
40 0.71
41 0.72
42 0.74
43 0.77
44 0.8
45 0.8
46 0.79
47 0.77
48 0.77
49 0.73
50 0.71
51 0.68
52 0.64
53 0.63
54 0.64
55 0.66
56 0.67
57 0.68
58 0.67
59 0.66
60 0.66
61 0.64
62 0.58
63 0.52
64 0.44
65 0.47
66 0.51
67 0.53
68 0.58
69 0.6
70 0.64
71 0.7
72 0.78
73 0.77
74 0.76
75 0.72
76 0.68
77 0.63
78 0.56
79 0.52
80 0.44
81 0.37
82 0.3
83 0.27
84 0.21
85 0.16
86 0.15
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.15
99 0.17
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.14
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.16
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.18
124 0.18
125 0.22
126 0.25
127 0.27
128 0.28
129 0.28
130 0.26
131 0.22
132 0.17
133 0.14
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.14
145 0.18
146 0.24
147 0.25
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.23
152 0.21
153 0.18
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.17
158 0.14
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.18
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.12
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.08
180 0.07
181 0.13
182 0.13
183 0.16
184 0.22
185 0.24
186 0.27
187 0.29
188 0.39
189 0.42
190 0.47
191 0.49
192 0.5
193 0.5
194 0.48
195 0.44
196 0.36
197 0.34
198 0.29
199 0.25
200 0.21
201 0.19
202 0.2
203 0.2
204 0.17
205 0.16
206 0.17
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.17
213 0.13
214 0.15
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.2
276 0.19
277 0.2
278 0.2
279 0.21
280 0.19
281 0.2
282 0.23
283 0.2
284 0.23
285 0.24
286 0.28
287 0.28
288 0.25
289 0.24
290 0.21
291 0.15
292 0.17
293 0.15
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.17
355 0.19
356 0.21
357 0.24
358 0.24
359 0.23
360 0.21
361 0.21
362 0.18
363 0.17
364 0.16
365 0.13
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.13
408 0.15
409 0.2
410 0.21
411 0.22
412 0.25
413 0.25
414 0.28
415 0.24
416 0.24
417 0.21
418 0.21
419 0.19
420 0.17
421 0.17
422 0.13
423 0.13
424 0.11
425 0.09
426 0.07
427 0.07
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.13
436 0.15
437 0.19
438 0.2
439 0.22
440 0.29
441 0.34
442 0.36
443 0.38
444 0.43
445 0.45
446 0.53
447 0.6
448 0.61
449 0.66
450 0.73
451 0.75
452 0.77
453 0.77
454 0.78
455 0.78
456 0.76
457 0.74
458 0.72
459 0.67
460 0.61
461 0.57
462 0.46
463 0.39
464 0.33
465 0.31
466 0.24
467 0.2
468 0.17
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.22
473 0.19
474 0.23
475 0.26
476 0.29
477 0.27
478 0.32
479 0.34
480 0.34
481 0.42
482 0.44
483 0.43
484 0.41
485 0.44
486 0.4
487 0.4
488 0.38
489 0.32
490 0.28
491 0.26
492 0.26
493 0.23
494 0.21
495 0.18
496 0.14
497 0.14
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.15
504 0.22
505 0.21
506 0.24
507 0.26
508 0.27
509 0.31
510 0.31
511 0.34
512 0.33
513 0.37
514 0.33
515 0.34
516 0.33
517 0.29
518 0.28
519 0.29
520 0.24
521 0.24
522 0.28
523 0.27
524 0.26
525 0.26
526 0.3
527 0.26
528 0.25
529 0.22
530 0.19
531 0.18
532 0.19
533 0.19
534 0.14
535 0.13
536 0.13
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.07
544 0.1
545 0.16
546 0.16
547 0.17
548 0.21
549 0.29
550 0.31
551 0.38
552 0.44
553 0.49
554 0.6
555 0.69
556 0.73
557 0.68
558 0.74
559 0.72
560 0.64
561 0.61
562 0.52
563 0.5
564 0.45
565 0.46
566 0.4
567 0.37
568 0.36
569 0.31
570 0.29
571 0.21
572 0.18
573 0.16
574 0.14
575 0.12
576 0.15
577 0.21
578 0.21
579 0.23
580 0.24
581 0.25
582 0.29
583 0.3
584 0.31
585 0.26
586 0.3
587 0.29
588 0.31
589 0.31
590 0.27
591 0.28
592 0.24
593 0.26
594 0.23
595 0.23
596 0.26
597 0.35
598 0.34
599 0.35
600 0.4
601 0.39
602 0.4
603 0.39
604 0.35
605 0.28
606 0.29
607 0.31
608 0.3
609 0.28
610 0.25
611 0.28
612 0.24
613 0.23
614 0.21
615 0.18
616 0.15
617 0.16
618 0.2
619 0.18
620 0.22
621 0.25
622 0.26
623 0.26
624 0.24
625 0.22
626 0.18
627 0.17
628 0.14
629 0.09
630 0.09
631 0.11
632 0.14
633 0.15
634 0.18
635 0.18
636 0.23
637 0.26
638 0.29
639 0.33
640 0.4
641 0.46
642 0.44
643 0.45
644 0.47
645 0.45
646 0.46
647 0.39
648 0.3
649 0.24
650 0.23
651 0.22
652 0.15
653 0.15
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.11