Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5PFF7

Protein Details
Accession J5PFF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-213VLAKAIKAKKRKTLKNLRKDSVKRGKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-213KAIKAKKRKTLKNLRKDSVKRGKF
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
Amino Acid Sequences MRLTNIVCIEPRRLKQIVEITNLSHTYLYTHIEEAMGNGHVKFGDDERSENAAAITNRQDDVLVISKEKKEVRLESESDDDDDDDDAPQEEGLHSGKSEVESHITQREEAIRFEQSQLKSKRRKQNELYAKQKKEINEVRPAEEAIAELPDELLESIDQREESGAQNTSSRHINFDEFDDSGEEEEVLAKAIKAKKRKTLKNLRKDSVKRGKFKIQLLSTAQDSKMLPPKKESLIINSRDRWLNRKTLHKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.51
4 0.48
5 0.46
6 0.45
7 0.4
8 0.43
9 0.43
10 0.36
11 0.27
12 0.2
13 0.16
14 0.16
15 0.18
16 0.15
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.17
32 0.17
33 0.19
34 0.22
35 0.26
36 0.25
37 0.24
38 0.23
39 0.2
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.13
48 0.16
49 0.19
50 0.17
51 0.17
52 0.2
53 0.21
54 0.26
55 0.27
56 0.28
57 0.27
58 0.3
59 0.35
60 0.37
61 0.38
62 0.36
63 0.38
64 0.34
65 0.3
66 0.26
67 0.2
68 0.15
69 0.14
70 0.11
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.12
89 0.14
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.2
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.23
102 0.2
103 0.27
104 0.33
105 0.39
106 0.46
107 0.55
108 0.62
109 0.65
110 0.72
111 0.69
112 0.73
113 0.76
114 0.76
115 0.78
116 0.78
117 0.71
118 0.66
119 0.63
120 0.53
121 0.51
122 0.49
123 0.43
124 0.43
125 0.43
126 0.41
127 0.39
128 0.39
129 0.29
130 0.22
131 0.18
132 0.09
133 0.08
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.14
154 0.14
155 0.16
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.19
160 0.2
161 0.19
162 0.21
163 0.22
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.09
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.11
178 0.17
179 0.23
180 0.31
181 0.37
182 0.46
183 0.56
184 0.65
185 0.71
186 0.77
187 0.82
188 0.84
189 0.89
190 0.86
191 0.86
192 0.82
193 0.82
194 0.82
195 0.8
196 0.76
197 0.73
198 0.76
199 0.72
200 0.72
201 0.71
202 0.63
203 0.61
204 0.58
205 0.54
206 0.48
207 0.45
208 0.39
209 0.33
210 0.31
211 0.3
212 0.35
213 0.37
214 0.36
215 0.37
216 0.43
217 0.44
218 0.49
219 0.45
220 0.45
221 0.49
222 0.54
223 0.57
224 0.55
225 0.55
226 0.56
227 0.57
228 0.54
229 0.5
230 0.53
231 0.52