Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5PRT4

Protein Details
Accession J5PRT4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-236TSTSSKKSKSNKHSKDSRIKLVKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039197  Mrs1/Cce1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR015242  Ydc2_cat  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09159  Ydc2-catalyt  
CDD cd16963  CCE1  
Amino Acid Sequences MSATSKARVLELIDSCCQNAKSGQLKSFSFVIGAANGTTKEIKRTSIQKQCEFLEKLRQQKIRSGKISILSMDAGVTNFAFSKIQLSNNNPLPKMLDWQKLNLEEKFLQNLKKLSLNPAETSQLVFDLTEYLFESDPIPDMFTIERQRARTMSSRHILEPILKVNILEQILFSNLENKMRYANNTQNASELRYMVRSSDPHRMTSYWCIPKEETSTSSKKSKSNKHSKDSRIKLVKEIISSSILNDASKRFTKSVEFSDIWGNRIRSALTKKKSFKLCDILEIQDGSGVKKDDDLADSFLHSLSWIEWIKNYESIAELLNSTSLSKVQCQEVFEFCESKIHDLENLQNAYKSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.32
4 0.3
5 0.25
6 0.23
7 0.26
8 0.32
9 0.37
10 0.41
11 0.43
12 0.43
13 0.44
14 0.44
15 0.36
16 0.28
17 0.22
18 0.19
19 0.14
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.16
26 0.15
27 0.2
28 0.21
29 0.24
30 0.29
31 0.37
32 0.45
33 0.51
34 0.59
35 0.59
36 0.63
37 0.62
38 0.64
39 0.6
40 0.53
41 0.54
42 0.52
43 0.54
44 0.59
45 0.62
46 0.55
47 0.59
48 0.66
49 0.64
50 0.62
51 0.57
52 0.52
53 0.51
54 0.51
55 0.43
56 0.35
57 0.26
58 0.21
59 0.18
60 0.14
61 0.1
62 0.08
63 0.08
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.11
70 0.12
71 0.18
72 0.23
73 0.27
74 0.34
75 0.42
76 0.46
77 0.42
78 0.4
79 0.38
80 0.33
81 0.36
82 0.35
83 0.35
84 0.31
85 0.35
86 0.38
87 0.41
88 0.43
89 0.37
90 0.34
91 0.29
92 0.3
93 0.32
94 0.31
95 0.28
96 0.28
97 0.3
98 0.27
99 0.3
100 0.29
101 0.3
102 0.33
103 0.33
104 0.31
105 0.31
106 0.31
107 0.26
108 0.26
109 0.19
110 0.13
111 0.11
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.11
130 0.14
131 0.17
132 0.2
133 0.2
134 0.22
135 0.22
136 0.25
137 0.28
138 0.3
139 0.33
140 0.34
141 0.35
142 0.34
143 0.35
144 0.32
145 0.27
146 0.25
147 0.2
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.15
166 0.15
167 0.18
168 0.2
169 0.25
170 0.29
171 0.31
172 0.31
173 0.3
174 0.3
175 0.3
176 0.25
177 0.19
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.16
185 0.25
186 0.26
187 0.26
188 0.28
189 0.27
190 0.28
191 0.32
192 0.38
193 0.35
194 0.35
195 0.36
196 0.35
197 0.37
198 0.38
199 0.34
200 0.28
201 0.27
202 0.3
203 0.31
204 0.37
205 0.38
206 0.4
207 0.46
208 0.53
209 0.58
210 0.66
211 0.71
212 0.74
213 0.8
214 0.83
215 0.85
216 0.82
217 0.81
218 0.78
219 0.7
220 0.65
221 0.62
222 0.55
223 0.46
224 0.41
225 0.32
226 0.27
227 0.26
228 0.21
229 0.19
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.17
235 0.2
236 0.22
237 0.19
238 0.2
239 0.25
240 0.27
241 0.31
242 0.33
243 0.31
244 0.3
245 0.38
246 0.37
247 0.34
248 0.36
249 0.31
250 0.25
251 0.25
252 0.25
253 0.22
254 0.31
255 0.38
256 0.4
257 0.49
258 0.54
259 0.61
260 0.69
261 0.67
262 0.65
263 0.65
264 0.59
265 0.56
266 0.54
267 0.48
268 0.42
269 0.38
270 0.3
271 0.23
272 0.21
273 0.16
274 0.16
275 0.15
276 0.12
277 0.13
278 0.15
279 0.14
280 0.17
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.15
287 0.13
288 0.11
289 0.09
290 0.07
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.17
295 0.2
296 0.22
297 0.24
298 0.24
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.17
303 0.15
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.16
313 0.19
314 0.25
315 0.27
316 0.3
317 0.32
318 0.34
319 0.37
320 0.36
321 0.34
322 0.28
323 0.31
324 0.3
325 0.3
326 0.28
327 0.24
328 0.24
329 0.26
330 0.32
331 0.34
332 0.36
333 0.33