Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5P676

Protein Details
Accession J5P676    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-63KEEKRDKKAKADGKHVDKRPKSBasic
507-529VEAPESNKKVKQRKRMEEEEAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-84KEEKRDKKAKADGKHVDKRPKSGPRLDENGNPLPKEPRLPKRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041708  PUS1/PUS2-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02568  PseudoU_synth_PUS1_PUS2  
Amino Acid Sequences MSEENLRPSYDDDQVNEDVYKRGAQSKLTKARKADFDEDNAKEEKRDKKAKADGKHVDKRPKSGPRLDENGNPLPKEPRLPKRKVAVMVGYCGTGYHGMQYNPPNPTIESTLFKAFVEAGAISRDNSNDLKKNGFMRAARTDKGVHAGGNLISLKMIIEDPDIKEKINDKLPQGIRVWDIERVNKAFDCRKMCSSRWYEYLLPTYSLIGPKPGSILYRDIEESKVELPGVLDEDLESKEFWEEFKRDANEKFTPEDIEAVLAYVPPARDEFNINEELYQKVKKYKQLENAHRRKYRISDAKLAKFRASTKQYLGAHNFHNFTLGKDFKEPSAIRFMKEINVSDPFVIGEAQTEWVSVKIHGQSFMLHQIRKMISMATLITRCGCPVQRITQAYGQQKINVPKAPALGLLLEAPVFEGYNKRLEQFGYKAIDFSKYQDEVDTFKMKHIYDKIYKEEVDENVFNAFFSYIDSFNKVTGAQGEETPDKSGLAVQKSIFEFLTARGIPGLVEAPESNKKVKQRKRMEEEEAASREAEESSAAENKELEVKQETAVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.31
4 0.28
5 0.23
6 0.22
7 0.22
8 0.19
9 0.24
10 0.25
11 0.31
12 0.39
13 0.48
14 0.57
15 0.63
16 0.67
17 0.66
18 0.71
19 0.72
20 0.71
21 0.67
22 0.61
23 0.6
24 0.63
25 0.59
26 0.55
27 0.49
28 0.42
29 0.39
30 0.41
31 0.42
32 0.44
33 0.51
34 0.52
35 0.59
36 0.69
37 0.75
38 0.75
39 0.77
40 0.77
41 0.78
42 0.83
43 0.82
44 0.82
45 0.78
46 0.77
47 0.76
48 0.76
49 0.74
50 0.73
51 0.72
52 0.7
53 0.72
54 0.69
55 0.65
56 0.62
57 0.62
58 0.58
59 0.5
60 0.44
61 0.42
62 0.4
63 0.43
64 0.45
65 0.47
66 0.53
67 0.59
68 0.65
69 0.69
70 0.74
71 0.7
72 0.66
73 0.64
74 0.57
75 0.54
76 0.47
77 0.38
78 0.31
79 0.26
80 0.21
81 0.14
82 0.11
83 0.12
84 0.15
85 0.15
86 0.2
87 0.27
88 0.31
89 0.32
90 0.33
91 0.31
92 0.28
93 0.3
94 0.3
95 0.27
96 0.25
97 0.26
98 0.28
99 0.27
100 0.25
101 0.23
102 0.18
103 0.15
104 0.13
105 0.1
106 0.08
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.16
114 0.21
115 0.24
116 0.26
117 0.28
118 0.3
119 0.34
120 0.34
121 0.37
122 0.33
123 0.33
124 0.41
125 0.43
126 0.4
127 0.39
128 0.37
129 0.32
130 0.35
131 0.3
132 0.21
133 0.17
134 0.18
135 0.15
136 0.16
137 0.15
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.05
145 0.07
146 0.1
147 0.12
148 0.18
149 0.19
150 0.18
151 0.21
152 0.23
153 0.26
154 0.31
155 0.33
156 0.28
157 0.37
158 0.38
159 0.4
160 0.38
161 0.36
162 0.29
163 0.29
164 0.28
165 0.24
166 0.25
167 0.24
168 0.27
169 0.26
170 0.26
171 0.24
172 0.27
173 0.27
174 0.31
175 0.33
176 0.33
177 0.39
178 0.42
179 0.43
180 0.48
181 0.48
182 0.46
183 0.44
184 0.45
185 0.4
186 0.37
187 0.4
188 0.33
189 0.28
190 0.24
191 0.22
192 0.19
193 0.19
194 0.16
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.14
203 0.12
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.14
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.11
229 0.11
230 0.13
231 0.18
232 0.21
233 0.23
234 0.25
235 0.3
236 0.28
237 0.29
238 0.29
239 0.25
240 0.23
241 0.2
242 0.19
243 0.14
244 0.11
245 0.09
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.1
257 0.11
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.18
268 0.21
269 0.26
270 0.32
271 0.38
272 0.46
273 0.55
274 0.64
275 0.69
276 0.75
277 0.79
278 0.76
279 0.71
280 0.64
281 0.58
282 0.57
283 0.56
284 0.5
285 0.51
286 0.54
287 0.6
288 0.61
289 0.58
290 0.49
291 0.42
292 0.4
293 0.39
294 0.37
295 0.32
296 0.29
297 0.36
298 0.37
299 0.39
300 0.41
301 0.35
302 0.33
303 0.33
304 0.32
305 0.25
306 0.26
307 0.21
308 0.18
309 0.22
310 0.21
311 0.19
312 0.21
313 0.22
314 0.18
315 0.26
316 0.25
317 0.2
318 0.29
319 0.29
320 0.27
321 0.28
322 0.28
323 0.24
324 0.27
325 0.25
326 0.17
327 0.19
328 0.19
329 0.18
330 0.17
331 0.13
332 0.11
333 0.1
334 0.07
335 0.05
336 0.05
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.1
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.15
350 0.16
351 0.24
352 0.25
353 0.22
354 0.22
355 0.27
356 0.27
357 0.27
358 0.25
359 0.17
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.18
373 0.24
374 0.3
375 0.32
376 0.35
377 0.37
378 0.43
379 0.44
380 0.46
381 0.41
382 0.37
383 0.4
384 0.43
385 0.42
386 0.39
387 0.36
388 0.32
389 0.33
390 0.3
391 0.25
392 0.2
393 0.15
394 0.12
395 0.1
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.08
404 0.09
405 0.16
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.19
410 0.24
411 0.24
412 0.29
413 0.27
414 0.27
415 0.27
416 0.27
417 0.29
418 0.25
419 0.25
420 0.26
421 0.22
422 0.22
423 0.23
424 0.24
425 0.23
426 0.28
427 0.3
428 0.24
429 0.26
430 0.3
431 0.28
432 0.33
433 0.36
434 0.39
435 0.41
436 0.46
437 0.49
438 0.5
439 0.5
440 0.46
441 0.45
442 0.39
443 0.37
444 0.32
445 0.27
446 0.24
447 0.23
448 0.2
449 0.16
450 0.14
451 0.08
452 0.1
453 0.12
454 0.11
455 0.13
456 0.17
457 0.16
458 0.16
459 0.17
460 0.15
461 0.14
462 0.15
463 0.17
464 0.15
465 0.16
466 0.2
467 0.22
468 0.23
469 0.24
470 0.22
471 0.18
472 0.17
473 0.2
474 0.21
475 0.22
476 0.24
477 0.22
478 0.28
479 0.29
480 0.3
481 0.26
482 0.22
483 0.19
484 0.17
485 0.25
486 0.19
487 0.19
488 0.17
489 0.17
490 0.16
491 0.16
492 0.16
493 0.09
494 0.11
495 0.1
496 0.16
497 0.23
498 0.25
499 0.28
500 0.31
501 0.4
502 0.49
503 0.58
504 0.64
505 0.68
506 0.77
507 0.82
508 0.86
509 0.85
510 0.84
511 0.79
512 0.77
513 0.68
514 0.58
515 0.49
516 0.4
517 0.33
518 0.24
519 0.19
520 0.11
521 0.1
522 0.12
523 0.17
524 0.17
525 0.17
526 0.17
527 0.18
528 0.25
529 0.24
530 0.24
531 0.23
532 0.24