Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EFT1

Protein Details
Accession J6EFT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MGKKNTKGGKKGRRGKNDSDGPKREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-17KKNTKGGKKGRRGKN
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 11.833, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
IPR018104  TIF_eIF-1A_CS  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01176  eIF-1a  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01262  IF1A  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MGKKNTKGGKKGRRGKNDSDGPKRELYYKEEGQEYAQITKMLGNGRVEASCFDGNKRMAHIRGKLRKKVWMGQGDIILVSLRDFQDDQCDVVHKYNLDEARTLKSQGELPENAKINETDNFGFESDEDVNFEFGNADEDDEEGEDEELDIDDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.85
4 0.84
5 0.83
6 0.83
7 0.78
8 0.72
9 0.68
10 0.61
11 0.56
12 0.49
13 0.45
14 0.43
15 0.41
16 0.4
17 0.38
18 0.37
19 0.33
20 0.34
21 0.3
22 0.23
23 0.21
24 0.17
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.15
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.16
35 0.14
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.23
44 0.22
45 0.24
46 0.28
47 0.34
48 0.38
49 0.46
50 0.53
51 0.57
52 0.56
53 0.59
54 0.58
55 0.57
56 0.55
57 0.51
58 0.46
59 0.41
60 0.4
61 0.33
62 0.29
63 0.22
64 0.14
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.16
80 0.11
81 0.12
82 0.16
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.2
88 0.21
89 0.22
90 0.18
91 0.17
92 0.2
93 0.21
94 0.24
95 0.22
96 0.23
97 0.28
98 0.29
99 0.28
100 0.26
101 0.23
102 0.21
103 0.21
104 0.23
105 0.17
106 0.16
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.14
111 0.15
112 0.13
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.09
120 0.08
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07