Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5RNX2

Protein Details
Accession J5RNX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-39LKQQELLRRKQSKENNTRKREVEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16367  RRM_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MNMDAEELELKGQLKNLKQQELLRRKQSKENNTRKREVEYKNSSKSSSVYISGLPTDRITKDELTKQFSKYGKIRINRDEEPLCKLYVNDEGVPKGDALIIYSKEESVTLAVDMMDESIFLGNKIRVEKAQFEDRGSENMDKKESSLKELDECEPPTKKPKQTNFSRAEDVIDYNDDESLAKADRTVVFANVFNIYKEYTPDDITDIQDDLLGGCEEIGQVDGLSVSPSKGEATVLFKKSKDALRCCKIMTGRYFDGQKLLVFIIGDENAPETNDENEESDVEDDLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.33
3 0.39
4 0.43
5 0.47
6 0.53
7 0.6
8 0.65
9 0.69
10 0.71
11 0.72
12 0.71
13 0.76
14 0.78
15 0.78
16 0.79
17 0.82
18 0.82
19 0.82
20 0.85
21 0.78
22 0.76
23 0.74
24 0.71
25 0.7
26 0.7
27 0.7
28 0.71
29 0.71
30 0.64
31 0.57
32 0.5
33 0.45
34 0.37
35 0.3
36 0.23
37 0.22
38 0.22
39 0.23
40 0.22
41 0.19
42 0.17
43 0.18
44 0.17
45 0.18
46 0.19
47 0.2
48 0.24
49 0.31
50 0.34
51 0.38
52 0.4
53 0.41
54 0.45
55 0.44
56 0.46
57 0.42
58 0.48
59 0.48
60 0.52
61 0.57
62 0.58
63 0.63
64 0.58
65 0.6
66 0.55
67 0.49
68 0.48
69 0.42
70 0.35
71 0.28
72 0.26
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.19
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.17
82 0.12
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.07
95 0.07
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.14
115 0.17
116 0.2
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.27
121 0.26
122 0.26
123 0.25
124 0.25
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.18
129 0.18
130 0.23
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.19
135 0.2
136 0.22
137 0.23
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.27
144 0.32
145 0.36
146 0.42
147 0.49
148 0.55
149 0.63
150 0.72
151 0.7
152 0.68
153 0.65
154 0.56
155 0.49
156 0.4
157 0.32
158 0.23
159 0.17
160 0.13
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.14
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.16
221 0.24
222 0.28
223 0.31
224 0.3
225 0.33
226 0.38
227 0.43
228 0.45
229 0.46
230 0.53
231 0.56
232 0.59
233 0.57
234 0.58
235 0.55
236 0.54
237 0.5
238 0.48
239 0.45
240 0.47
241 0.48
242 0.43
243 0.41
244 0.35
245 0.29
246 0.24
247 0.21
248 0.16
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.1
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.1
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.16