Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4U0Q0

Protein Details
Accession J4U0Q0    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-152EEKLDRILKKPKVRRTRRDEDDLEBasic
313-344SEKLRKKSVMDSAKNRKKKKSKSGEDPTSRGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-143KKPKVRR
317-335RKKSVMDSAKNRKKKKSKS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MTAADQEQLKVIEATPEDGLDSLQAPVVDAKDETPDQNQAAERQETPEVVSKGTEGLDDEVVGDDGSIIEDNSHVEAAERKRKHISTDLSDDDIEKELHNNQSPQPLVENRINKDRDSSATPTSRQELEEKLDRILKKPKVRRTRRDEDDLEQYLDEKILRLKDEMNIAAQLDIDTLNKRIETGDTSLIAMQKVKLLPKVVSVLSKANLADTILDNNLLQSVRIWLEPLPDGSLPSFEIQKSLFAALNDLPVKTEHLKESGLGRVVIFYTKSKRVEAQLARLAEKLIAEWTRPIIGASDNYRDKRIMQLEFDSEKLRKKSVMDSAKNRKKKKSKSGEDPTSRGSSVQTLYEQAAARRNRAAAPAQTTTDYKYAPVSNLNTVPTNARAVGVGSTLNNSEIYKRLTSRLNKKHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.1
8 0.1
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.12
18 0.15
19 0.17
20 0.19
21 0.2
22 0.23
23 0.23
24 0.26
25 0.27
26 0.26
27 0.3
28 0.31
29 0.29
30 0.28
31 0.29
32 0.26
33 0.27
34 0.31
35 0.27
36 0.24
37 0.24
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.17
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.04
57 0.05
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.14
64 0.21
65 0.31
66 0.31
67 0.34
68 0.42
69 0.44
70 0.48
71 0.5
72 0.5
73 0.48
74 0.54
75 0.53
76 0.48
77 0.47
78 0.42
79 0.34
80 0.29
81 0.22
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.2
86 0.23
87 0.24
88 0.24
89 0.31
90 0.31
91 0.3
92 0.31
93 0.28
94 0.3
95 0.34
96 0.38
97 0.34
98 0.42
99 0.43
100 0.39
101 0.4
102 0.38
103 0.35
104 0.34
105 0.35
106 0.33
107 0.35
108 0.37
109 0.36
110 0.36
111 0.34
112 0.3
113 0.29
114 0.25
115 0.26
116 0.3
117 0.29
118 0.28
119 0.32
120 0.31
121 0.33
122 0.39
123 0.42
124 0.45
125 0.53
126 0.61
127 0.67
128 0.76
129 0.82
130 0.83
131 0.85
132 0.83
133 0.83
134 0.76
135 0.69
136 0.67
137 0.59
138 0.5
139 0.39
140 0.33
141 0.24
142 0.21
143 0.16
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.17
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.11
158 0.09
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.11
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.12
233 0.11
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.15
240 0.15
241 0.17
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.18
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.16
257 0.22
258 0.24
259 0.24
260 0.27
261 0.29
262 0.37
263 0.38
264 0.4
265 0.4
266 0.4
267 0.39
268 0.37
269 0.34
270 0.25
271 0.21
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.09
282 0.1
283 0.13
284 0.16
285 0.22
286 0.27
287 0.28
288 0.3
289 0.3
290 0.29
291 0.33
292 0.36
293 0.31
294 0.29
295 0.31
296 0.34
297 0.35
298 0.36
299 0.32
300 0.29
301 0.33
302 0.32
303 0.31
304 0.28
305 0.29
306 0.34
307 0.4
308 0.48
309 0.5
310 0.58
311 0.68
312 0.75
313 0.82
314 0.82
315 0.83
316 0.83
317 0.85
318 0.86
319 0.86
320 0.86
321 0.88
322 0.92
323 0.93
324 0.9
325 0.83
326 0.76
327 0.69
328 0.58
329 0.48
330 0.38
331 0.31
332 0.25
333 0.24
334 0.2
335 0.18
336 0.19
337 0.23
338 0.23
339 0.21
340 0.28
341 0.27
342 0.29
343 0.3
344 0.31
345 0.29
346 0.32
347 0.35
348 0.33
349 0.37
350 0.37
351 0.36
352 0.37
353 0.36
354 0.35
355 0.33
356 0.27
357 0.22
358 0.23
359 0.23
360 0.23
361 0.28
362 0.28
363 0.31
364 0.33
365 0.35
366 0.32
367 0.31
368 0.32
369 0.28
370 0.28
371 0.22
372 0.2
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.14
377 0.14
378 0.11
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.18
386 0.22
387 0.25
388 0.27
389 0.31
390 0.39
391 0.49
392 0.57