Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J6EDI8

Protein Details
Accession J6EDI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-54AVPHKRPLEKIRPSIRRQDYHydrophilic
226-278KEWQRREEGKSQRREKKYEKKIKEMRLKTRAQEYTNRLREKKHGKAHIHHFSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-270RREEGKSQRREKKYEKKIKEMRLKTRAQEYTNRLREKKHGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
IPR022652  Znf_XPA_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00752  XPA_1  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MHAVNQSEKSSMLANAGAVPSYGDGSSDNSNRDAAVPHKRPLEKIRPSIRRQDYIEYDFATMQNLNGGYINPKDKVPNPGFAEDEDVESEFGSKKQKTLQDWKREQLERKMLYENAPPPEHISKAPKCVECHFNIEMDPVLHDIFKLQVCKQCAKELPEKYSLLTKTECKEDYFLTDPELNDEDLFRRLEKPNPHSGTFARMQLFVRCEVEAFAFKKWGGEDGLDKEWQRREEGKSQRREKKYEKKIKEMRLKTRAQEYTNRLREKKHGKAHIHHFSAPIDGGIDEDGYQIQRRRCTDCGLETEEIDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.15
4 0.13
5 0.11
6 0.11
7 0.09
8 0.1
9 0.09
10 0.07
11 0.08
12 0.11
13 0.17
14 0.2
15 0.21
16 0.21
17 0.21
18 0.21
19 0.22
20 0.21
21 0.22
22 0.3
23 0.33
24 0.37
25 0.45
26 0.46
27 0.51
28 0.57
29 0.62
30 0.6
31 0.65
32 0.71
33 0.72
34 0.75
35 0.8
36 0.78
37 0.74
38 0.68
39 0.67
40 0.63
41 0.58
42 0.56
43 0.46
44 0.4
45 0.34
46 0.3
47 0.24
48 0.18
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.15
57 0.18
58 0.16
59 0.17
60 0.21
61 0.24
62 0.33
63 0.33
64 0.38
65 0.38
66 0.4
67 0.4
68 0.36
69 0.38
70 0.29
71 0.27
72 0.2
73 0.16
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.09
78 0.1
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.22
83 0.28
84 0.34
85 0.45
86 0.52
87 0.57
88 0.62
89 0.66
90 0.68
91 0.68
92 0.67
93 0.64
94 0.64
95 0.56
96 0.53
97 0.5
98 0.43
99 0.4
100 0.41
101 0.36
102 0.31
103 0.3
104 0.27
105 0.28
106 0.29
107 0.28
108 0.25
109 0.28
110 0.26
111 0.33
112 0.37
113 0.37
114 0.37
115 0.39
116 0.42
117 0.36
118 0.39
119 0.32
120 0.28
121 0.25
122 0.23
123 0.2
124 0.15
125 0.13
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.07
132 0.08
133 0.1
134 0.11
135 0.15
136 0.18
137 0.22
138 0.23
139 0.26
140 0.28
141 0.31
142 0.37
143 0.36
144 0.38
145 0.39
146 0.38
147 0.33
148 0.35
149 0.31
150 0.25
151 0.24
152 0.23
153 0.2
154 0.24
155 0.25
156 0.2
157 0.21
158 0.19
159 0.22
160 0.22
161 0.2
162 0.18
163 0.19
164 0.18
165 0.19
166 0.2
167 0.16
168 0.12
169 0.13
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.1
174 0.13
175 0.15
176 0.21
177 0.29
178 0.33
179 0.41
180 0.45
181 0.45
182 0.44
183 0.43
184 0.42
185 0.37
186 0.35
187 0.26
188 0.23
189 0.23
190 0.24
191 0.25
192 0.21
193 0.2
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.12
207 0.12
208 0.15
209 0.18
210 0.21
211 0.22
212 0.22
213 0.25
214 0.28
215 0.28
216 0.29
217 0.3
218 0.34
219 0.41
220 0.51
221 0.56
222 0.62
223 0.71
224 0.76
225 0.78
226 0.81
227 0.82
228 0.82
229 0.84
230 0.85
231 0.82
232 0.83
233 0.85
234 0.87
235 0.87
236 0.86
237 0.85
238 0.83
239 0.81
240 0.75
241 0.76
242 0.71
243 0.65
244 0.64
245 0.62
246 0.63
247 0.67
248 0.7
249 0.62
250 0.6
251 0.65
252 0.66
253 0.69
254 0.67
255 0.68
256 0.69
257 0.76
258 0.83
259 0.83
260 0.78
261 0.7
262 0.63
263 0.53
264 0.47
265 0.38
266 0.28
267 0.19
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.1
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.15
277 0.19
278 0.24
279 0.31
280 0.35
281 0.41
282 0.42
283 0.48
284 0.5
285 0.51
286 0.52
287 0.52
288 0.5