Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4U1I0

Protein Details
Accession J4U1I0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-141SDNEQTQTPSRKKKKSRMHDGGATRHydrophilic
406-427QDLSRIKYKKRVSQRLLWFDKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-132RKKKKS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 10.833, cyto 5, cyto_mito 4.666, cyto_pero 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR042238  Rad28/ERCC8/Ckn1/ATCSA-1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MVMDPFLQYRLGTISFDDFHRRVIQNEFERILEDPSLNLKNYRFNKWSGYDSSKGTSLNIGVTCLDVDNTGQVLLGGGDDGSLSIWGLDESSHQNDEGEQELINKRLNYIKRQPHQSDNEQTQTPSRKKKKSRMHDGGATRLVHSFQTQRNKYRMYRQSNTPISSRTSVMLNAANSQTDSPLLETDAGGSISHHKYGITTLKWYRTDNGMFFTGSNDKTVKIWDTNRFEPVQNISLGYRINQIDNNIANDSSLLVVASEDYYPRMIDLRTMNSGITTLGMGNKTRMQSEISCCKFNPVREQIVACGDTEGGIKLWDLRMRNRLYLELKRTREGFKPINSDDNNGSDVYFGSNELKAHLRCCNDIVWNDEGSELCSIGTDGKLNIWRPFTEIFQLDGIASYRQLGPQDLSRIKYKKRVSQRLLWFDKFLLCISDNGEIEIYNTEEEKLWNKLEYPMGHNQVKKNQALQCQFSSMTLQTNMMNSVGLRLFFGTNNNAIGNGGSIFECS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.22
4 0.29
5 0.26
6 0.28
7 0.35
8 0.35
9 0.34
10 0.39
11 0.45
12 0.44
13 0.5
14 0.48
15 0.4
16 0.4
17 0.39
18 0.35
19 0.27
20 0.21
21 0.16
22 0.21
23 0.24
24 0.24
25 0.26
26 0.25
27 0.33
28 0.38
29 0.45
30 0.42
31 0.42
32 0.48
33 0.49
34 0.53
35 0.51
36 0.53
37 0.48
38 0.48
39 0.47
40 0.42
41 0.38
42 0.33
43 0.28
44 0.22
45 0.22
46 0.2
47 0.18
48 0.15
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.12
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.03
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.03
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.07
77 0.11
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.18
84 0.17
85 0.13
86 0.1
87 0.14
88 0.17
89 0.19
90 0.22
91 0.2
92 0.2
93 0.27
94 0.31
95 0.36
96 0.43
97 0.51
98 0.56
99 0.66
100 0.69
101 0.71
102 0.74
103 0.73
104 0.72
105 0.68
106 0.65
107 0.56
108 0.52
109 0.49
110 0.51
111 0.5
112 0.53
113 0.56
114 0.62
115 0.7
116 0.8
117 0.84
118 0.86
119 0.89
120 0.88
121 0.86
122 0.84
123 0.78
124 0.74
125 0.69
126 0.58
127 0.47
128 0.38
129 0.32
130 0.24
131 0.22
132 0.21
133 0.23
134 0.33
135 0.38
136 0.44
137 0.48
138 0.54
139 0.56
140 0.6
141 0.64
142 0.62
143 0.62
144 0.63
145 0.68
146 0.68
147 0.67
148 0.58
149 0.51
150 0.46
151 0.42
152 0.35
153 0.26
154 0.21
155 0.18
156 0.18
157 0.19
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.15
184 0.21
185 0.16
186 0.21
187 0.24
188 0.3
189 0.32
190 0.33
191 0.31
192 0.31
193 0.32
194 0.27
195 0.27
196 0.22
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.15
202 0.16
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.2
210 0.27
211 0.32
212 0.33
213 0.36
214 0.36
215 0.34
216 0.32
217 0.3
218 0.24
219 0.18
220 0.17
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.09
254 0.11
255 0.13
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.1
262 0.08
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.16
275 0.22
276 0.3
277 0.3
278 0.31
279 0.3
280 0.35
281 0.35
282 0.35
283 0.38
284 0.34
285 0.35
286 0.35
287 0.36
288 0.32
289 0.32
290 0.3
291 0.21
292 0.15
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.08
302 0.1
303 0.12
304 0.16
305 0.24
306 0.26
307 0.29
308 0.29
309 0.32
310 0.35
311 0.4
312 0.45
313 0.46
314 0.46
315 0.46
316 0.48
317 0.46
318 0.45
319 0.46
320 0.43
321 0.4
322 0.44
323 0.43
324 0.49
325 0.46
326 0.45
327 0.39
328 0.35
329 0.31
330 0.24
331 0.22
332 0.13
333 0.13
334 0.11
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.12
341 0.17
342 0.16
343 0.19
344 0.23
345 0.23
346 0.23
347 0.25
348 0.25
349 0.24
350 0.25
351 0.27
352 0.24
353 0.23
354 0.21
355 0.2
356 0.18
357 0.15
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.1
368 0.15
369 0.18
370 0.21
371 0.23
372 0.22
373 0.25
374 0.26
375 0.25
376 0.25
377 0.24
378 0.22
379 0.2
380 0.2
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.11
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.17
393 0.26
394 0.28
395 0.3
396 0.37
397 0.42
398 0.46
399 0.53
400 0.56
401 0.57
402 0.65
403 0.73
404 0.71
405 0.75
406 0.8
407 0.82
408 0.82
409 0.75
410 0.66
411 0.56
412 0.52
413 0.43
414 0.33
415 0.26
416 0.19
417 0.18
418 0.18
419 0.22
420 0.2
421 0.19
422 0.19
423 0.15
424 0.15
425 0.16
426 0.14
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.13
432 0.15
433 0.18
434 0.19
435 0.19
436 0.2
437 0.24
438 0.29
439 0.31
440 0.33
441 0.38
442 0.44
443 0.48
444 0.51
445 0.53
446 0.55
447 0.59
448 0.56
449 0.55
450 0.54
451 0.58
452 0.6
453 0.59
454 0.53
455 0.5
456 0.47
457 0.41
458 0.39
459 0.31
460 0.28
461 0.24
462 0.23
463 0.21
464 0.22
465 0.22
466 0.18
467 0.17
468 0.13
469 0.16
470 0.16
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.16
476 0.2
477 0.2
478 0.2
479 0.22
480 0.22
481 0.2
482 0.19
483 0.18
484 0.15
485 0.11
486 0.1