Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J6EHD5

Protein Details
Accession J6EHD5    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPKKPSKRQTLRREIAPEVHydrophilic
36-59LTEKSVHRKPSKTKVRKEQSLARLHydrophilic
162-187IKKSASVARTIRRKNKRNILKSEATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-69HRKPSKTKVRKEQSLARLYGPKKDKKDK
87-98GVKIRRGKKGKK
129-185KARRLEEIRELKRKEIERKEALKQDKLEGKKDEIKKSASVARTIRRKNKRNILKSEA
191-199IPKEKRLKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037650  Loc1  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
Amino Acid Sequences MAPKKPSKRQTLRREIAPEVFQDSQARNQLANVPHLTEKSVHRKPSKTKVRKEQSLARLYGPKKDKKDKFSEKDLDIPTLNRAIVPGVKIRRGKKGKKFIADDDSLALNRLIKTIGDKYDDIAESKLEKARRLEEIRELKRKEIERKEALKQDKLEGKKDEIKKSASVARTIRRKNKRNILKSEATASENIPKEKRLKKVSFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.75
3 0.7
4 0.62
5 0.52
6 0.46
7 0.4
8 0.34
9 0.32
10 0.29
11 0.29
12 0.32
13 0.32
14 0.26
15 0.26
16 0.31
17 0.3
18 0.33
19 0.28
20 0.25
21 0.26
22 0.26
23 0.26
24 0.23
25 0.28
26 0.33
27 0.39
28 0.44
29 0.49
30 0.56
31 0.63
32 0.71
33 0.75
34 0.75
35 0.78
36 0.81
37 0.85
38 0.85
39 0.83
40 0.82
41 0.8
42 0.77
43 0.68
44 0.6
45 0.58
46 0.51
47 0.52
48 0.5
49 0.48
50 0.5
51 0.58
52 0.62
53 0.62
54 0.72
55 0.75
56 0.73
57 0.75
58 0.73
59 0.65
60 0.66
61 0.59
62 0.51
63 0.41
64 0.35
65 0.27
66 0.22
67 0.2
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.14
74 0.14
75 0.2
76 0.26
77 0.28
78 0.37
79 0.45
80 0.53
81 0.57
82 0.66
83 0.67
84 0.69
85 0.7
86 0.64
87 0.61
88 0.53
89 0.44
90 0.34
91 0.29
92 0.21
93 0.18
94 0.14
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.09
101 0.11
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.18
107 0.19
108 0.17
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.16
114 0.15
115 0.17
116 0.19
117 0.21
118 0.28
119 0.3
120 0.31
121 0.37
122 0.45
123 0.5
124 0.56
125 0.55
126 0.5
127 0.54
128 0.58
129 0.58
130 0.57
131 0.59
132 0.59
133 0.62
134 0.67
135 0.69
136 0.67
137 0.64
138 0.56
139 0.54
140 0.53
141 0.52
142 0.51
143 0.46
144 0.47
145 0.49
146 0.55
147 0.55
148 0.52
149 0.52
150 0.47
151 0.48
152 0.49
153 0.42
154 0.42
155 0.41
156 0.45
157 0.52
158 0.59
159 0.65
160 0.7
161 0.76
162 0.8
163 0.85
164 0.87
165 0.87
166 0.87
167 0.85
168 0.82
169 0.75
170 0.71
171 0.63
172 0.54
173 0.46
174 0.39
175 0.38
176 0.36
177 0.38
178 0.34
179 0.35
180 0.42
181 0.48
182 0.56
183 0.58