FuNGI

J4U2L8

Protein Details

Accession

J4U2L8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
179-202	VSQSYNKSTKKKLKDTKNRKQSSG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
188-198	KKKLKDTKNRK

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, mito 6, cyto 5.5, vacu 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR011012 Longin-like_dom_sf IPR027417 P-loop_NTPase IPR013822 Signal_recog_particl_SRP54_hlx IPR036225 SRP/SRP_N IPR000897 SRP54_GTPase_dom IPR042101 SRP54_N_sf IPR015284 SRX_dom
Gene Ontology	GO:0005789 C:endoplasmic reticulum membrane GO:0032991 C:protein-containing complex GO:0005525 F:GTP binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF00448 SRP54 PF02881 SRP54_N PF09201 SRX
PROSITE	View protein in PROSITE PS00300 SRP54
CDD	cd14826 SR_alpha_SRX cd17876 SRalpha_C

Amino Acid Sequences

MFEQLAVFTPQGQVLYQYNCLGKRFSEVQINSFISQLITSPVTKKESVANANTNGFDFNLLTINNEFKNSNSFYALFYLNKQPELYFVVTFAEQTLELNQETQQTLSLALKLWNSLHLSESIQKNLKGHNEKNEHNYIDVLQGLKEDLDKFDQYFAIKYEESIKQGPINSNDAATNELVSQSYNKSTKKKLKDTKNRKQSSGNVGSGRKWGRDGGMLDEMNHEDAAKLDFSSSNSYSSSQVALDSTINKDSFGDRTEGGDFLIKEIDDLLSSHKDEIISEKESKNSGYVNTAFGFLQKHVLGNKTISENDLKTVLDKLKQQLITKNVAPEAADYLIQQVSRDLVGSKTANWTSVENTARESLTKALTQILTPGVSVDLLREIQSKRSKKDSEGKSDPYVFSIVGVNGVGKSTNLSKLAFWLLQNNFKVLIVACDTFRSGAVEQLRVHVENLAQLMDDSHVRGVKNKRGKSGNDYVELFEAGYGGSDLVTKIAKQAIKYSRDQNFDIVLMDTAGRRHNDPTLMSPLKSFADQAQPDKIIMVGEALVGTDSVQQAKNFNDAFGKGRNLDFFIISKCDTVGEMLGTMVNMVYATGIPILFVGVGQTYTDLRTLSVKWAVNTLMS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.21
3	0.23
4	0.25
5	0.29
6	0.31
7	0.32
8	0.3
9	0.27
10	0.3
11	0.32
12	0.32
13	0.38
14	0.37
15	0.38
16	0.44
17	0.46
18	0.4
19	0.36
20	0.32
21	0.22
22	0.21
23	0.18
24	0.14
25	0.13
26	0.14
27	0.17
28	0.22
29	0.26
30	0.26
31	0.27
32	0.31
33	0.37
34	0.42
35	0.45
36	0.46
37	0.46
38	0.48
39	0.47
40	0.41
41	0.33
42	0.27
43	0.21
44	0.15
45	0.12
46	0.12
47	0.11
48	0.13
49	0.14
50	0.18
51	0.17
52	0.19
53	0.19
54	0.17
55	0.23
56	0.24
57	0.25
58	0.24
59	0.24
60	0.23
61	0.26
62	0.28
63	0.23
64	0.23
65	0.3
66	0.29
67	0.3
68	0.29
69	0.26
70	0.26
71	0.3
72	0.28
73	0.2
74	0.18
75	0.18
76	0.18
77	0.18
78	0.15
79	0.11
80	0.09
81	0.09
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.14
88	0.15
89	0.14
90	0.14
91	0.12
92	0.13
93	0.13
94	0.13
95	0.12
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.17
101	0.18
102	0.17
103	0.17
104	0.17
105	0.19
106	0.23
107	0.26
108	0.29
109	0.3
110	0.31
111	0.32
112	0.35
113	0.42
114	0.45
115	0.47
116	0.51
117	0.54
118	0.57
119	0.62
120	0.64
121	0.55
122	0.47
123	0.43
124	0.34
125	0.28
126	0.25
127	0.19
128	0.12
129	0.11
130	0.1
131	0.1
132	0.11
133	0.1
134	0.1
135	0.13
136	0.14
137	0.15
138	0.16
139	0.17
140	0.16
141	0.17
142	0.16
143	0.17
144	0.15
145	0.16
146	0.2
147	0.21
148	0.24
149	0.24
150	0.24
151	0.23
152	0.26
153	0.3
154	0.27
155	0.29
156	0.25
157	0.25
158	0.24
159	0.21
160	0.2
161	0.16
162	0.13
163	0.09
164	0.1
165	0.09
166	0.08
167	0.1
168	0.1
169	0.16
170	0.2
171	0.25
172	0.3
173	0.39
174	0.48
175	0.56
176	0.65
177	0.69
178	0.75
179	0.82
180	0.88
181	0.89
182	0.91
183	0.86
184	0.79
185	0.77
186	0.73
187	0.72
188	0.69
189	0.63
190	0.57
191	0.53
192	0.51
193	0.5
194	0.45
195	0.35
196	0.28
197	0.24
198	0.2
199	0.23
200	0.23
201	0.2
202	0.24
203	0.23
204	0.22
205	0.23
206	0.22
207	0.18
208	0.17
209	0.13
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.09
218	0.14
219	0.14
220	0.14
221	0.15
222	0.16
223	0.17
224	0.17
225	0.16
226	0.11
227	0.11
228	0.09
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.1
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.11
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.13
247	0.11
248	0.1
249	0.11
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.05
255	0.06
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.13
264	0.14
265	0.16
266	0.19
267	0.19
268	0.2
269	0.21
270	0.21
271	0.19
272	0.16
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.15
279	0.13
280	0.14
281	0.14
282	0.1
283	0.12
284	0.1
285	0.11
286	0.11
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.1
300	0.12
301	0.13
302	0.13
303	0.15
304	0.17
305	0.21
306	0.24
307	0.25
308	0.27
309	0.29
310	0.3
311	0.29
312	0.29
313	0.23
314	0.21
315	0.19
316	0.15
317	0.13
318	0.1
319	0.09
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.08
324	0.08
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.15
338	0.15
339	0.14
340	0.2
341	0.21
342	0.17
343	0.18
344	0.19
345	0.18
346	0.17
347	0.17
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.11
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.1
368	0.11
369	0.18
370	0.27
371	0.32
372	0.34
373	0.43
374	0.45
375	0.47
376	0.57
377	0.57
378	0.58
379	0.6
380	0.61
381	0.57
382	0.57
383	0.51
384	0.42
385	0.35
386	0.25
387	0.19
388	0.16
389	0.11
390	0.09
391	0.09
392	0.07
393	0.06
394	0.07
395	0.06
396	0.04
397	0.06
398	0.07
399	0.1
400	0.12
401	0.12
402	0.12
403	0.15
404	0.18
405	0.18
406	0.16
407	0.21
408	0.22
409	0.28
410	0.28
411	0.27
412	0.25
413	0.23
414	0.23
415	0.16
416	0.15
417	0.11
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.12
422	0.11
423	0.12
424	0.12
425	0.1
426	0.14
427	0.16
428	0.19
429	0.19
430	0.21
431	0.23
432	0.21
433	0.21
434	0.18
435	0.16
436	0.14
437	0.14
438	0.11
439	0.09
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.09
446	0.11
447	0.11
448	0.18
449	0.25
450	0.33
451	0.42
452	0.45
453	0.51
454	0.55
455	0.59
456	0.61
457	0.64
458	0.6
459	0.55
460	0.53
461	0.46
462	0.4
463	0.36
464	0.28
465	0.18
466	0.12
467	0.07
468	0.06
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.08
478	0.13
479	0.15
480	0.16
481	0.25
482	0.31
483	0.36
484	0.41
485	0.48
486	0.5
487	0.53
488	0.54
489	0.47
490	0.41
491	0.36
492	0.33
493	0.25
494	0.18
495	0.13
496	0.13
497	0.11
498	0.11
499	0.14
500	0.14
501	0.15
502	0.18
503	0.21
504	0.24
505	0.25
506	0.28
507	0.34
508	0.35
509	0.34
510	0.32
511	0.31
512	0.29
513	0.27
514	0.24
515	0.18
516	0.24
517	0.27
518	0.3
519	0.33
520	0.33
521	0.32
522	0.31
523	0.28
524	0.19
525	0.15
526	0.13
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.07
535	0.08
536	0.11
537	0.13
538	0.14
539	0.17
540	0.19
541	0.26
542	0.23
543	0.24
544	0.24
545	0.24
546	0.27
547	0.29
548	0.31
549	0.27
550	0.29
551	0.29
552	0.29
553	0.28
554	0.26
555	0.24
556	0.23
557	0.24
558	0.23
559	0.21
560	0.19
561	0.18
562	0.16
563	0.15
564	0.14
565	0.11
566	0.1
567	0.1
568	0.1
569	0.09
570	0.08
571	0.07
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.05
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.07
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.05
587	0.06
588	0.06
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.11
593	0.11
594	0.11
595	0.14
596	0.16
597	0.2
598	0.26
599	0.28
600	0.27
601	0.31

J4U2L8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer