Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4U1S6

Protein Details
Accession J4U1S6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-567MAANKDSNSKNRRRRANKKVGETSPDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
513-514AR
549-559SKNRRRRANKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 8, mito 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MSSQFFLKTSQDIELFQSYPTFEQSNTNSKDFPVISSVLSPCGRFLALSTKENVKVFTGPCLNTVLLTMRLTDVYDLHFSPAGNYLSTWERTSVQDPNHKNVKVWCLNKPFKRDCPSEEIVPAYEYQAKSQSGWFLQFSKLDNYALRLFKHDLKIVKLSSENADNFDFQSPFAVLSDSETSQHFTTYLISPAEHPTICTFTPEKGGKPAQLAIWALTEGKITKKIASKTFFKADSCQLNWNPLGNAILCLAITDFDSSNKSYYGENTLYLLSFQGVNGTLGGNSVRVSLTTGPVHDFTWSPTSRQFGVIAGYMPATISFFDLRGNVVHSLAQQAKNTMLFSPSGHYILIAGFGNLQGSVEILDRLDKFKCVSKFDATNTSVCKWSPGGEFIMTATTSPRLRVDNGVKIWHVSGSLVFVKEFRELLKVDWRSPCNYKTLENKDEALIEDHIINNWEPLSESSTASLDPKISNKSELQIHSSVQEYISQHPSREAISNGNGLKAKAGGAYKPPHARRTGGVRIVPGVPPGAMKKTIPGLVPGMAANKDSNSKNRRRRANKKVGETSPDSTPAASPPVATSAPTPNKETSPEEKKMRSLLKKLRAIEALKERQAVGDKLEDTQVLKIQTEENVLKDLEKLGWKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.24
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.22
8 0.19
9 0.16
10 0.22
11 0.27
12 0.36
13 0.39
14 0.41
15 0.38
16 0.37
17 0.43
18 0.36
19 0.33
20 0.27
21 0.23
22 0.22
23 0.26
24 0.26
25 0.25
26 0.26
27 0.24
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.16
32 0.17
33 0.21
34 0.25
35 0.27
36 0.31
37 0.34
38 0.39
39 0.4
40 0.39
41 0.32
42 0.32
43 0.3
44 0.34
45 0.35
46 0.31
47 0.31
48 0.33
49 0.3
50 0.25
51 0.26
52 0.21
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.12
61 0.13
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.22
69 0.2
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.2
74 0.23
75 0.22
76 0.19
77 0.2
78 0.23
79 0.27
80 0.3
81 0.32
82 0.39
83 0.42
84 0.49
85 0.55
86 0.53
87 0.51
88 0.51
89 0.54
90 0.54
91 0.54
92 0.55
93 0.56
94 0.65
95 0.69
96 0.74
97 0.71
98 0.71
99 0.75
100 0.71
101 0.66
102 0.65
103 0.63
104 0.56
105 0.51
106 0.44
107 0.37
108 0.33
109 0.27
110 0.21
111 0.22
112 0.19
113 0.19
114 0.22
115 0.22
116 0.22
117 0.23
118 0.25
119 0.22
120 0.24
121 0.24
122 0.21
123 0.23
124 0.25
125 0.25
126 0.25
127 0.24
128 0.24
129 0.22
130 0.24
131 0.28
132 0.29
133 0.27
134 0.27
135 0.29
136 0.33
137 0.37
138 0.37
139 0.34
140 0.35
141 0.4
142 0.37
143 0.36
144 0.31
145 0.29
146 0.27
147 0.3
148 0.26
149 0.24
150 0.24
151 0.22
152 0.22
153 0.23
154 0.21
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.07
162 0.1
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.15
170 0.12
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.17
179 0.2
180 0.17
181 0.17
182 0.15
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.17
187 0.15
188 0.24
189 0.25
190 0.24
191 0.27
192 0.3
193 0.28
194 0.29
195 0.3
196 0.22
197 0.23
198 0.22
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.09
207 0.13
208 0.13
209 0.17
210 0.22
211 0.27
212 0.34
213 0.38
214 0.41
215 0.42
216 0.47
217 0.45
218 0.4
219 0.39
220 0.37
221 0.39
222 0.36
223 0.37
224 0.32
225 0.34
226 0.33
227 0.31
228 0.25
229 0.2
230 0.19
231 0.12
232 0.12
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.16
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.17
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.19
290 0.19
291 0.2
292 0.18
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.11
317 0.14
318 0.16
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.15
324 0.12
325 0.1
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.09
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.17
356 0.2
357 0.22
358 0.25
359 0.27
360 0.3
361 0.32
362 0.38
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.3
367 0.27
368 0.23
369 0.23
370 0.15
371 0.17
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.14
379 0.11
380 0.09
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.14
388 0.21
389 0.25
390 0.29
391 0.31
392 0.32
393 0.3
394 0.29
395 0.28
396 0.21
397 0.17
398 0.1
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.12
407 0.13
408 0.1
409 0.12
410 0.12
411 0.14
412 0.23
413 0.24
414 0.27
415 0.33
416 0.34
417 0.36
418 0.4
419 0.39
420 0.35
421 0.35
422 0.36
423 0.4
424 0.46
425 0.46
426 0.44
427 0.43
428 0.39
429 0.38
430 0.33
431 0.26
432 0.18
433 0.14
434 0.13
435 0.12
436 0.11
437 0.12
438 0.11
439 0.09
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.11
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.13
449 0.13
450 0.14
451 0.14
452 0.12
453 0.12
454 0.15
455 0.19
456 0.19
457 0.22
458 0.22
459 0.25
460 0.3
461 0.3
462 0.32
463 0.29
464 0.29
465 0.27
466 0.27
467 0.23
468 0.18
469 0.2
470 0.16
471 0.19
472 0.26
473 0.26
474 0.25
475 0.26
476 0.27
477 0.24
478 0.25
479 0.23
480 0.19
481 0.2
482 0.25
483 0.24
484 0.27
485 0.26
486 0.24
487 0.23
488 0.19
489 0.17
490 0.15
491 0.16
492 0.14
493 0.2
494 0.24
495 0.3
496 0.39
497 0.43
498 0.45
499 0.46
500 0.47
501 0.45
502 0.5
503 0.52
504 0.49
505 0.47
506 0.43
507 0.42
508 0.42
509 0.37
510 0.29
511 0.21
512 0.15
513 0.15
514 0.16
515 0.17
516 0.17
517 0.16
518 0.19
519 0.22
520 0.25
521 0.24
522 0.23
523 0.22
524 0.21
525 0.22
526 0.2
527 0.19
528 0.16
529 0.17
530 0.15
531 0.14
532 0.19
533 0.21
534 0.3
535 0.37
536 0.47
537 0.56
538 0.64
539 0.73
540 0.79
541 0.87
542 0.89
543 0.91
544 0.9
545 0.9
546 0.9
547 0.85
548 0.81
549 0.76
550 0.67
551 0.6
552 0.54
553 0.44
554 0.35
555 0.3
556 0.24
557 0.23
558 0.2
559 0.17
560 0.14
561 0.18
562 0.17
563 0.17
564 0.18
565 0.25
566 0.32
567 0.35
568 0.38
569 0.37
570 0.39
571 0.42
572 0.46
573 0.45
574 0.46
575 0.52
576 0.55
577 0.56
578 0.58
579 0.62
580 0.65
581 0.64
582 0.66
583 0.67
584 0.7
585 0.74
586 0.73
587 0.71
588 0.68
589 0.62
590 0.61
591 0.61
592 0.59
593 0.55
594 0.54
595 0.48
596 0.44
597 0.47
598 0.39
599 0.32
600 0.3
601 0.28
602 0.27
603 0.29
604 0.27
605 0.23
606 0.24
607 0.25
608 0.21
609 0.2
610 0.2
611 0.2
612 0.21
613 0.27
614 0.26
615 0.23
616 0.25
617 0.25
618 0.24
619 0.23
620 0.23
621 0.2
622 0.24