Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J8TRA7

Protein Details
Accession J8TRA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-503FEQYTSQKKKLYKKIRCFSKNGKHVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MSRSDGFIEDRDSKNDASIQILGGSSNVEVIALSESVDQDECKRPTHDCQANMMPSSPQRKPCGLSDIEIIEPNKSLELCAPFYHDISTSKLDDYLVTANCIVDSSLSNENNAKGNAKTLLEDLINDEWSADVESSGKKQNEQKFNLRNIAEKWGVQSPKKSEANAINHGYEKEMIMETKYGTADSQKSQVGAADILFDFPLSPVKNEDSVKEKHGSITNHDFSPGRSVEAPANQKHDEVLEVVKKRSHEQIEDDSRHLPKGKKRTIALSRTLIKSTKSPDTVELNLSKFLDDSDSITMDILSTPSKKANIVRTGSQPILGTSNPPQAIRRLNTLANEDVQRTRSTAREISQLESYITYGQYYSREESRSKIRHLLKEKKGAFRQVNQIYRDNEKARSQIILEFSPSILQLFQKVEGNLQQQVAPAVIQQSYDDSIPLLRFLRKCDSIYDFNNDFYYPCDPKIVEENISILYYDAQEFFEQYTSQKKKLYKKIRCFSKNGKHVILVLSDLNKLKRAIFQFENEKYKARVEQRLSGNEEAPRPRSKKSSQVGELGIKKFDLEQRLRFIDREWNVKIHTVNSHMEFINSLPNLVSLIGKQRMDPAIRYMKYAHLNVKSANDRTEILKKTFHQIGRMPELKANNAVSLYPSFQLLYEDIQKGRLQSDNEGKYLMTEAIERRLYKLFTSTDPNDAIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.29
4 0.26
5 0.25
6 0.22
7 0.2
8 0.2
9 0.17
10 0.13
11 0.13
12 0.09
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.06
18 0.08
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.15
27 0.24
28 0.25
29 0.28
30 0.3
31 0.33
32 0.4
33 0.5
34 0.53
35 0.47
36 0.52
37 0.57
38 0.58
39 0.56
40 0.49
41 0.42
42 0.42
43 0.46
44 0.45
45 0.44
46 0.45
47 0.48
48 0.5
49 0.51
50 0.52
51 0.46
52 0.43
53 0.4
54 0.38
55 0.35
56 0.36
57 0.31
58 0.24
59 0.23
60 0.21
61 0.18
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.19
66 0.2
67 0.2
68 0.25
69 0.25
70 0.26
71 0.26
72 0.24
73 0.21
74 0.24
75 0.27
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.19
81 0.2
82 0.21
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.13
90 0.08
91 0.08
92 0.11
93 0.18
94 0.18
95 0.2
96 0.22
97 0.24
98 0.27
99 0.27
100 0.25
101 0.18
102 0.21
103 0.23
104 0.21
105 0.21
106 0.18
107 0.19
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.16
112 0.16
113 0.14
114 0.13
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.08
119 0.06
120 0.08
121 0.09
122 0.13
123 0.2
124 0.2
125 0.24
126 0.33
127 0.42
128 0.5
129 0.55
130 0.62
131 0.63
132 0.68
133 0.71
134 0.64
135 0.59
136 0.51
137 0.52
138 0.43
139 0.35
140 0.32
141 0.32
142 0.36
143 0.34
144 0.38
145 0.36
146 0.43
147 0.46
148 0.43
149 0.42
150 0.47
151 0.51
152 0.51
153 0.5
154 0.42
155 0.41
156 0.4
157 0.35
158 0.27
159 0.2
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.14
171 0.16
172 0.17
173 0.2
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.16
179 0.14
180 0.12
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.13
192 0.15
193 0.2
194 0.2
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.29
199 0.29
200 0.27
201 0.26
202 0.31
203 0.3
204 0.31
205 0.38
206 0.37
207 0.34
208 0.35
209 0.32
210 0.27
211 0.31
212 0.25
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.25
218 0.3
219 0.26
220 0.31
221 0.3
222 0.29
223 0.28
224 0.25
225 0.2
226 0.15
227 0.17
228 0.18
229 0.19
230 0.2
231 0.22
232 0.23
233 0.24
234 0.3
235 0.29
236 0.26
237 0.29
238 0.37
239 0.44
240 0.45
241 0.44
242 0.41
243 0.38
244 0.37
245 0.37
246 0.33
247 0.31
248 0.39
249 0.45
250 0.47
251 0.48
252 0.56
253 0.6
254 0.61
255 0.6
256 0.56
257 0.54
258 0.49
259 0.5
260 0.42
261 0.34
262 0.32
263 0.3
264 0.3
265 0.27
266 0.26
267 0.27
268 0.3
269 0.31
270 0.3
271 0.29
272 0.24
273 0.23
274 0.22
275 0.19
276 0.14
277 0.13
278 0.11
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.12
295 0.16
296 0.23
297 0.28
298 0.3
299 0.32
300 0.35
301 0.37
302 0.35
303 0.32
304 0.25
305 0.19
306 0.18
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.17
311 0.16
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.23
316 0.23
317 0.25
318 0.23
319 0.23
320 0.24
321 0.26
322 0.24
323 0.21
324 0.2
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.13
330 0.14
331 0.13
332 0.16
333 0.17
334 0.17
335 0.22
336 0.23
337 0.24
338 0.23
339 0.22
340 0.19
341 0.17
342 0.16
343 0.1
344 0.09
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.11
351 0.13
352 0.15
353 0.16
354 0.19
355 0.28
356 0.3
357 0.31
358 0.38
359 0.41
360 0.46
361 0.55
362 0.63
363 0.6
364 0.65
365 0.67
366 0.67
367 0.64
368 0.64
369 0.58
370 0.53
371 0.55
372 0.53
373 0.55
374 0.5
375 0.52
376 0.46
377 0.46
378 0.47
379 0.39
380 0.35
381 0.32
382 0.3
383 0.26
384 0.24
385 0.22
386 0.19
387 0.2
388 0.17
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.13
393 0.12
394 0.09
395 0.07
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.16
404 0.19
405 0.18
406 0.17
407 0.17
408 0.14
409 0.15
410 0.13
411 0.1
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.13
427 0.14
428 0.18
429 0.24
430 0.26
431 0.27
432 0.29
433 0.33
434 0.34
435 0.35
436 0.39
437 0.34
438 0.32
439 0.32
440 0.28
441 0.22
442 0.19
443 0.22
444 0.16
445 0.16
446 0.17
447 0.16
448 0.18
449 0.24
450 0.24
451 0.21
452 0.2
453 0.2
454 0.19
455 0.19
456 0.17
457 0.11
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.19
470 0.22
471 0.25
472 0.3
473 0.37
474 0.46
475 0.56
476 0.66
477 0.66
478 0.73
479 0.8
480 0.86
481 0.85
482 0.83
483 0.83
484 0.82
485 0.8
486 0.75
487 0.68
488 0.58
489 0.53
490 0.47
491 0.37
492 0.28
493 0.21
494 0.17
495 0.18
496 0.19
497 0.18
498 0.19
499 0.19
500 0.18
501 0.23
502 0.24
503 0.28
504 0.29
505 0.34
506 0.4
507 0.46
508 0.51
509 0.47
510 0.46
511 0.41
512 0.42
513 0.43
514 0.4
515 0.42
516 0.4
517 0.47
518 0.51
519 0.56
520 0.58
521 0.53
522 0.49
523 0.44
524 0.45
525 0.41
526 0.38
527 0.4
528 0.38
529 0.4
530 0.45
531 0.46
532 0.51
533 0.55
534 0.6
535 0.56
536 0.59
537 0.59
538 0.59
539 0.61
540 0.52
541 0.45
542 0.35
543 0.31
544 0.28
545 0.29
546 0.3
547 0.29
548 0.32
549 0.37
550 0.42
551 0.44
552 0.41
553 0.39
554 0.4
555 0.38
556 0.41
557 0.37
558 0.36
559 0.35
560 0.39
561 0.38
562 0.32
563 0.31
564 0.29
565 0.3
566 0.3
567 0.32
568 0.28
569 0.27
570 0.24
571 0.21
572 0.24
573 0.19
574 0.17
575 0.14
576 0.14
577 0.14
578 0.14
579 0.14
580 0.08
581 0.16
582 0.21
583 0.21
584 0.21
585 0.26
586 0.31
587 0.33
588 0.33
589 0.34
590 0.38
591 0.39
592 0.41
593 0.37
594 0.39
595 0.42
596 0.45
597 0.45
598 0.4
599 0.42
600 0.42
601 0.48
602 0.48
603 0.45
604 0.43
605 0.37
606 0.33
607 0.36
608 0.42
609 0.39
610 0.36
611 0.39
612 0.39
613 0.44
614 0.5
615 0.47
616 0.45
617 0.45
618 0.5
619 0.54
620 0.56
621 0.51
622 0.47
623 0.48
624 0.45
625 0.45
626 0.38
627 0.3
628 0.27
629 0.25
630 0.24
631 0.23
632 0.22
633 0.17
634 0.16
635 0.15
636 0.14
637 0.16
638 0.15
639 0.17
640 0.21
641 0.24
642 0.24
643 0.27
644 0.28
645 0.27
646 0.29
647 0.3
648 0.26
649 0.31
650 0.41
651 0.41
652 0.41
653 0.4
654 0.37
655 0.33
656 0.32
657 0.25
658 0.16
659 0.16
660 0.17
661 0.24
662 0.29
663 0.29
664 0.3
665 0.34
666 0.34
667 0.32
668 0.36
669 0.32
670 0.31
671 0.39
672 0.39
673 0.39