FuNGI

A0A164VJ52

Protein Details

Accession

A0A164VJ52

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-110	VDDAMKWIRKSKKREKELARKRQEEL	Basic
265-289	EGDVGFKKPKTKKKRQNRRALTEAD	Basic
664-692	LETPTLSKGKTEKRSKKKEAKNAAARAGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
48-57	AKERDAKRIV
59-62	RIAK
92-106	IRKSKKREKELARKR
271-283	KKPKTKKKRQNRR
594-619	HRFHGKGSGKAKTEKRLKRIAEEKKK
671-686	KGKTEKRSKKKEAKNA

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDKAPSGDKDKEAADNYAKQREREAKERDAKRIVDRIAKVKNKRELNASLTGATLADPDADVDDAMKWIRKSKKREKELARKRQEELENMDKAFQEEYGEKDLVGLKVSHDFEDLDEGEARILTLKDSRILDNEEDELQNIDMAEDEKTRKNNELKTKKRVYTGYDDDEFVPGHQGLKRAVLSKYDEDIDGTKETGFRLGAGVTKSDHEDLKMDEEQTIAVNRSLLSIDYSKNQEMSDYVREGDVGFKKPKTKKKRQNRRALTEADLGIPDEDKPTDSPMDIDEKASSKPLRDLDANFVDDDELQAALARERRAKMKKVRSVNNLNPEDIARKIAEEREKETSEANGIKKEEEQVADLGDAPSEGLLFDDTSEFVRSIAYDPQVIKIQIPTANKSLKPEDSTDARMESDDSDDEMEVGEVANDDEAVLMAIENAMNVDAAPVKEEDIPVGTSSEQTFGSGMASTLNILRQQGVLHEASAEERERERVQRERDRWLAEHRANLARRELEKMRSRGTNKDQSTREYENRVREQQEIRETVETFKDYKPDVNIVYHDEFGRVLTPKEAWKALSHRFHGKGSGKAKTEKRLKRIAEEKKKEAMASGDTPLSMNRAFQIRQEKAGQAHMVLSVGNRGAVPQVAEFLETPTLSKGKTEKRSKKKEAKNAAARAGDGAGLTTLPTVGVVGLQPATGAVVSAPPTTSSPGPSMMKSSFSRVAAEPVSGSASPATGLNEHAKFSMGLKRKANDDGGAASKKRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.28
4	0.36
5	0.37
6	0.36
7	0.39
8	0.43
9	0.43
10	0.41
11	0.35
12	0.29
13	0.32
14	0.33
15	0.33
16	0.36
17	0.37
18	0.38
19	0.39
20	0.38
21	0.35
22	0.37
23	0.39
24	0.37
25	0.4
26	0.44
27	0.51
28	0.51
29	0.46
30	0.52
31	0.57
32	0.58
33	0.59
34	0.62
35	0.62
36	0.7
37	0.75
38	0.75
39	0.72
40	0.69
41	0.67
42	0.67
43	0.62
44	0.61
45	0.59
46	0.59
47	0.62
48	0.67
49	0.68
50	0.7
51	0.74
52	0.72
53	0.71
54	0.7
55	0.66
56	0.62
57	0.61
58	0.54
59	0.45
60	0.38
61	0.34
62	0.27
63	0.21
64	0.16
65	0.09
66	0.07
67	0.06
68	0.06
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.08
75	0.1
76	0.13
77	0.13
78	0.22
79	0.32
80	0.4
81	0.5
82	0.6
83	0.69
84	0.75
85	0.85
86	0.87
87	0.89
88	0.92
89	0.93
90	0.92
91	0.86
92	0.79
93	0.78
94	0.72
95	0.66
96	0.63
97	0.6
98	0.53
99	0.49
100	0.48
101	0.39
102	0.35
103	0.29
104	0.21
105	0.16
106	0.14
107	0.17
108	0.2
109	0.2
110	0.18
111	0.19
112	0.22
113	0.19
114	0.2
115	0.16
116	0.13
117	0.19
118	0.2
119	0.2
120	0.18
121	0.17
122	0.16
123	0.21
124	0.2
125	0.16
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.11
135	0.12
136	0.17
137	0.19
138	0.2
139	0.22
140	0.25
141	0.25
142	0.24
143	0.25
144	0.22
145	0.2
146	0.19
147	0.17
148	0.14
149	0.13
150	0.1
151	0.08
152	0.07
153	0.07
154	0.08
155	0.1
156	0.13
157	0.17
158	0.21
159	0.23
160	0.3
161	0.36
162	0.43
163	0.51
164	0.59
165	0.64
166	0.71
167	0.78
168	0.74
169	0.74
170	0.7
171	0.65
172	0.63
173	0.61
174	0.57
175	0.5
176	0.47
177	0.41
178	0.38
179	0.32
180	0.23
181	0.19
182	0.12
183	0.13
184	0.14
185	0.15
186	0.15
187	0.19
188	0.21
189	0.21
190	0.22
191	0.24
192	0.27
193	0.27
194	0.28
195	0.25
196	0.24
197	0.21
198	0.22
199	0.2
200	0.17
201	0.14
202	0.13
203	0.12
204	0.12
205	0.13
206	0.11
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.11
211	0.11
212	0.12
213	0.11
214	0.12
215	0.14
216	0.15
217	0.15
218	0.12
219	0.13
220	0.13
221	0.18
222	0.19
223	0.17
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.14
228	0.15
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.12
239	0.15
240	0.18
241	0.18
242	0.19
243	0.18
244	0.16
245	0.15
246	0.18
247	0.18
248	0.16
249	0.16
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.2
254	0.19
255	0.2
256	0.23
257	0.25
258	0.34
259	0.42
260	0.52
261	0.57
262	0.64
263	0.7
264	0.78
265	0.87
266	0.89
267	0.93
268	0.93
269	0.9
270	0.86
271	0.79
272	0.72
273	0.64
274	0.54
275	0.43
276	0.33
277	0.25
278	0.18
279	0.15
280	0.1
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.15
291	0.14
292	0.15
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.18
297	0.18
298	0.14
299	0.18
300	0.19
301	0.21
302	0.22
303	0.23
304	0.25
305	0.28
306	0.27
307	0.23
308	0.21
309	0.18
310	0.16
311	0.14
312	0.08
313	0.05
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.09
319	0.11
320	0.13
321	0.15
322	0.23
323	0.28
324	0.36
325	0.44
326	0.52
327	0.58
328	0.64
329	0.7
330	0.71
331	0.75
332	0.73
333	0.73
334	0.65
335	0.57
336	0.49
337	0.41
338	0.35
339	0.26
340	0.21
341	0.11
342	0.1
343	0.11
344	0.14
345	0.19
346	0.19
347	0.22
348	0.26
349	0.27
350	0.27
351	0.26
352	0.22
353	0.2
354	0.22
355	0.2
356	0.18
357	0.17
358	0.17
359	0.17
360	0.18
361	0.17
362	0.13
363	0.13
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.08
369	0.06
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.03
374	0.03
375	0.02
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.09
389	0.09
390	0.11
391	0.11
392	0.13
393	0.15
394	0.15
395	0.13
396	0.12
397	0.13
398	0.15
399	0.16
400	0.17
401	0.2
402	0.23
403	0.23
404	0.26
405	0.27
406	0.25
407	0.26
408	0.25
409	0.24
410	0.24
411	0.26
412	0.24
413	0.22
414	0.2
415	0.18
416	0.16
417	0.13
418	0.11
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.06
426	0.04
427	0.04
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.02
435	0.03
436	0.03
437	0.02
438	0.02
439	0.02
440	0.03
441	0.02
442	0.02
443	0.03
444	0.03
445	0.02
446	0.02
447	0.03
448	0.04
449	0.04
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.08
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.08
463	0.1
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.11
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.11
489	0.11
490	0.09
491	0.1
492	0.13
493	0.15
494	0.19
495	0.24
496	0.29
497	0.38
498	0.46
499	0.49
500	0.53
501	0.56
502	0.56
503	0.54
504	0.53
505	0.53
506	0.45
507	0.46
508	0.42
509	0.44
510	0.42
511	0.42
512	0.39
513	0.34
514	0.33
515	0.35
516	0.34
517	0.35
518	0.41
519	0.43
520	0.44
521	0.47
522	0.48
523	0.51
524	0.56
525	0.58
526	0.54
527	0.59
528	0.57
529	0.54
530	0.58
531	0.56
532	0.51
533	0.5
534	0.51
535	0.51
536	0.55
537	0.57
538	0.51
539	0.5
540	0.5
541	0.48
542	0.5
543	0.44
544	0.4
545	0.38
546	0.36
547	0.33
548	0.31
549	0.27
550	0.23
551	0.21
552	0.22
553	0.21
554	0.23
555	0.23
556	0.24
557	0.25
558	0.24
559	0.24
560	0.26
561	0.27
562	0.26
563	0.23
564	0.2
565	0.18
566	0.16
567	0.18
568	0.13
569	0.12
570	0.12
571	0.14
572	0.17
573	0.2
574	0.21
575	0.19
576	0.23
577	0.29
578	0.36
579	0.41
580	0.42
581	0.46
582	0.48
583	0.48
584	0.51
585	0.49
586	0.49
587	0.48
588	0.51
589	0.47
590	0.52
591	0.56
592	0.58
593	0.64
594	0.63
595	0.65
596	0.67
597	0.66
598	0.67
599	0.72
600	0.73
601	0.74
602	0.75
603	0.73
604	0.7
605	0.69
606	0.59
607	0.51
608	0.43
609	0.36
610	0.31
611	0.28
612	0.22
613	0.2
614	0.2
615	0.19
616	0.19
617	0.14
618	0.12
619	0.12
620	0.16
621	0.16
622	0.22
623	0.32
624	0.31
625	0.35
626	0.38
627	0.39
628	0.37
629	0.41
630	0.36
631	0.27
632	0.25
633	0.21
634	0.18
635	0.15
636	0.13
637	0.1
638	0.09
639	0.09
640	0.08
641	0.08
642	0.09
643	0.09
644	0.1
645	0.08
646	0.1
647	0.1
648	0.11
649	0.11
650	0.12
651	0.13
652	0.12
653	0.13
654	0.14
655	0.15
656	0.14
657	0.17
658	0.23
659	0.31
660	0.41
661	0.52
662	0.6
663	0.7
664	0.81
665	0.88
666	0.91
667	0.92
668	0.92
669	0.92
670	0.92
671	0.91
672	0.87
673	0.84
674	0.74
675	0.64
676	0.54
677	0.44
678	0.33
679	0.23
680	0.16
681	0.09
682	0.07
683	0.07
684	0.06
685	0.05
686	0.04
687	0.05
688	0.04
689	0.04
690	0.05
691	0.05
692	0.06
693	0.07
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.04
701	0.06
702	0.08
703	0.09
704	0.1
705	0.11
706	0.13
707	0.16
708	0.17
709	0.18
710	0.19
711	0.24
712	0.26
713	0.26
714	0.3
715	0.28
716	0.32
717	0.31
718	0.36
719	0.35
720	0.34
721	0.36
722	0.32
723	0.36
724	0.32
725	0.31
726	0.25
727	0.2
728	0.23
729	0.19
730	0.18
731	0.13
732	0.12
733	0.11
734	0.12
735	0.13
736	0.1
737	0.14
738	0.2
739	0.21
740	0.22
741	0.22
742	0.23
743	0.21
744	0.23
745	0.3
746	0.31
747	0.37
748	0.43
749	0.45
750	0.48
751	0.54
752	0.54
753	0.47
754	0.42
755	0.39
756	0.39
757	0.43

A0A164VJ52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer