Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165HIV1

Protein Details
Accession A0A165HIV1    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-157DAKGVHRLGRGRRRRRERGGPGMSGBasic
191-211MGRAHWKKKFPRTPRLKGEPTBasic
437-456VLGGKRFKRKWLGAGTRRESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-152HRLGRGRRRRRERGG
198-199KK
Subcellular Location(s) plas 21, cyto_nucl 3, nucl 2.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045888  Erv  
IPR012936  Erv_C  
IPR039542  Erv_N  
Gene Ontology GO:0030134  C:COPII-coated ER to Golgi transport vesicle  
GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0033116  C:endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
Pfam View protein in Pfam  
PF07970  COPIIcoated_ERV  
PF13850  ERGIC_N  
Amino Acid Sequences MMNGFADRDLDESNFGVSQSSNPKDVLRTFDAFPKTKATYTTRSSRGGQWTIVLLVIVALLSLSETRRWYAGHETHQFSVEKGVSHGLQINLDMVVAMRCQDLHVNVQDASGDHILAGERVRRDPTNWSQWVDAKGVHRLGRGRRRRRERGGPGMSGSSNSYGDSGDAAGQNAMDPLKPEELDDEHVGDVMGRAHWKKKFPRTPRLKGEPTACRIYGSIEGNKVQGDFHITARGHGYIEYGTEHLDHKSFNFSHITNELSFGPYYPSLVNPLDSTLATTDSHFYKFQYYLSVVPTIYTRSLKKLAKLESQLAQQFHKAQAQLSSSSSSSSSFFKSSSSSQQQQPILQPRTLADLPASYKTRDVVMTNQYAVTEQSLLVGERSVPGIFFKFDIEPILLTIAEERGSMLALLVRLVNVISGVLVAGGWCYQLGGWAIDVLGGKRFKRKWLGAGTRRESEGVLHGKMEADEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.11
5 0.16
6 0.23
7 0.26
8 0.27
9 0.27
10 0.3
11 0.34
12 0.36
13 0.38
14 0.35
15 0.35
16 0.35
17 0.42
18 0.47
19 0.44
20 0.43
21 0.43
22 0.4
23 0.38
24 0.43
25 0.42
26 0.42
27 0.46
28 0.54
29 0.52
30 0.54
31 0.55
32 0.56
33 0.58
34 0.53
35 0.47
36 0.4
37 0.36
38 0.32
39 0.29
40 0.21
41 0.12
42 0.09
43 0.08
44 0.06
45 0.04
46 0.03
47 0.02
48 0.03
49 0.05
50 0.06
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.17
57 0.25
58 0.31
59 0.37
60 0.44
61 0.46
62 0.46
63 0.5
64 0.47
65 0.38
66 0.37
67 0.29
68 0.22
69 0.2
70 0.21
71 0.18
72 0.19
73 0.22
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.09
89 0.11
90 0.15
91 0.17
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.16
97 0.18
98 0.13
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.15
108 0.18
109 0.19
110 0.21
111 0.28
112 0.35
113 0.41
114 0.42
115 0.42
116 0.42
117 0.44
118 0.45
119 0.38
120 0.34
121 0.26
122 0.28
123 0.29
124 0.28
125 0.27
126 0.3
127 0.38
128 0.46
129 0.54
130 0.6
131 0.67
132 0.75
133 0.82
134 0.86
135 0.87
136 0.86
137 0.87
138 0.82
139 0.74
140 0.65
141 0.57
142 0.48
143 0.38
144 0.3
145 0.21
146 0.15
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.14
182 0.18
183 0.25
184 0.33
185 0.43
186 0.53
187 0.59
188 0.69
189 0.74
190 0.8
191 0.82
192 0.83
193 0.76
194 0.71
195 0.69
196 0.65
197 0.59
198 0.53
199 0.43
200 0.35
201 0.31
202 0.28
203 0.25
204 0.22
205 0.19
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.16
211 0.11
212 0.09
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.13
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.14
244 0.16
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.11
250 0.09
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.08
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.15
277 0.17
278 0.18
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.16
285 0.15
286 0.18
287 0.25
288 0.27
289 0.32
290 0.37
291 0.39
292 0.43
293 0.45
294 0.45
295 0.41
296 0.43
297 0.42
298 0.37
299 0.33
300 0.29
301 0.27
302 0.26
303 0.26
304 0.21
305 0.18
306 0.21
307 0.22
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.17
322 0.19
323 0.27
324 0.32
325 0.35
326 0.38
327 0.45
328 0.47
329 0.47
330 0.51
331 0.52
332 0.47
333 0.43
334 0.39
335 0.33
336 0.37
337 0.34
338 0.27
339 0.18
340 0.18
341 0.2
342 0.25
343 0.26
344 0.2
345 0.21
346 0.21
347 0.22
348 0.21
349 0.21
350 0.21
351 0.25
352 0.27
353 0.27
354 0.26
355 0.24
356 0.23
357 0.22
358 0.17
359 0.11
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.15
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.13
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.07
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.11
423 0.12
424 0.11
425 0.15
426 0.19
427 0.21
428 0.3
429 0.33
430 0.39
431 0.48
432 0.53
433 0.56
434 0.63
435 0.72
436 0.72
437 0.8
438 0.78
439 0.73
440 0.69
441 0.6
442 0.5
443 0.41
444 0.4
445 0.35
446 0.3
447 0.26
448 0.25
449 0.25