FuNGI

A0A165JRB5

Protein Details

Accession

A0A165JRB5

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-97	AGSKAQLKFKPKNTLRRSED	Hydrophilic
368-391	SPEQKKKRVKMLLKPTKRRKPGLF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
134-152	GSRGRGRGGFSRGGRGGRG
372-388	KKKRVKMLLKPTKRRKP

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKKITPRQPPRARTATENSSGGDVAADAQANSGEQAGAASNASETSAPRPASRPPVQRLASLKGRTSASPAAAGAAGSKAQLKFKPKNTLRRSEDERLQAERTEVARLQARQAAVDAANANNSKEKNHQGSGSRGRGRGGFSRGGRGGRGGFADGGDKRGEGMASGPFSSMADSMGRRKPGQFGSGGGANRIKREGGPRIKSEFYTPDDYSSDDDDATEGPRIAVEHINLISDSEGEDDPSGKGKGRARNGGRTMGSGLKPIRVDRVEHVDRQSGVSTEASSSTSAELRKQAQEKDDKGGLFVPEDEPEAAAKKDKGKEKAPTASRDEQQVQVKQEPTDEATPMDVDAIPPAAAAEDGTAIKQSLSPEQKKKRVKMLLKPTKRRKPGLFDFNPVLQTNEDREEWERHQEDVQFLARELGMMKAYQAPDQQQQQDKEQEKDKDAEGDVAMAEGEANTDENAQKPEQGQQQQSQPQSPQEDRKEGLIYLFQFPPIVPSLVNPVLKKEEDGDTADGNTAGAPAPSAAAGAAAAENSRQKPIVISDTSSSSASRTGRRAPDAQQQPASHETEEHVPPPPLTAPSADIPSGFAGKLRVHQSGRVTLAWGNTALELSRGADCEFLQDAMLANPVTNNADASRSGATAGGAPGIKQEPGTAEGEDTAQMGNQVIPRSGWALGQVRGKFVVTPDWSEMFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.75
3	0.72
4	0.69
5	0.64
6	0.58
7	0.5
8	0.43
9	0.39
10	0.31
11	0.22
12	0.15
13	0.1
14	0.1
15	0.1
16	0.08
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.09
21	0.08
22	0.06
23	0.05
24	0.06
25	0.06
26	0.07
27	0.07
28	0.07
29	0.06
30	0.07
31	0.08
32	0.08
33	0.09
34	0.12
35	0.19
36	0.2
37	0.22
38	0.25
39	0.3
40	0.39
41	0.47
42	0.52
43	0.52
44	0.6
45	0.6
46	0.63
47	0.62
48	0.6
49	0.6
50	0.55
51	0.51
52	0.46
53	0.47
54	0.41
55	0.42
56	0.38
57	0.31
58	0.28
59	0.26
60	0.22
61	0.2
62	0.19
63	0.14
64	0.11
65	0.1
66	0.08
67	0.13
68	0.13
69	0.18
70	0.23
71	0.31
72	0.39
73	0.47
74	0.58
75	0.62
76	0.71
77	0.75
78	0.8
79	0.78
80	0.79
81	0.79
82	0.76
83	0.75
84	0.72
85	0.68
86	0.61
87	0.57
88	0.49
89	0.41
90	0.38
91	0.31
92	0.28
93	0.25
94	0.24
95	0.28
96	0.28
97	0.3
98	0.29
99	0.28
100	0.24
101	0.24
102	0.23
103	0.17
104	0.19
105	0.16
106	0.13
107	0.18
108	0.18
109	0.18
110	0.2
111	0.2
112	0.21
113	0.25
114	0.33
115	0.34
116	0.37
117	0.41
118	0.41
119	0.5
120	0.57
121	0.6
122	0.57
123	0.52
124	0.5
125	0.48
126	0.47
127	0.44
128	0.4
129	0.38
130	0.34
131	0.4
132	0.41
133	0.4
134	0.37
135	0.33
136	0.29
137	0.23
138	0.23
139	0.17
140	0.14
141	0.13
142	0.18
143	0.15
144	0.16
145	0.15
146	0.13
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.11
154	0.12
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.1
160	0.08
161	0.09
162	0.11
163	0.17
164	0.21
165	0.24
166	0.25
167	0.26
168	0.31
169	0.32
170	0.33
171	0.28
172	0.26
173	0.26
174	0.29
175	0.28
176	0.24
177	0.26
178	0.23
179	0.23
180	0.23
181	0.2
182	0.18
183	0.24
184	0.32
185	0.37
186	0.42
187	0.45
188	0.49
189	0.5
190	0.48
191	0.46
192	0.4
193	0.35
194	0.36
195	0.32
196	0.3
197	0.28
198	0.29
199	0.27
200	0.24
201	0.2
202	0.14
203	0.13
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.11
219	0.11
220	0.09
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.15
233	0.21
234	0.28
235	0.33
236	0.42
237	0.44
238	0.52
239	0.54
240	0.54
241	0.49
242	0.43
243	0.4
244	0.35
245	0.31
246	0.27
247	0.24
248	0.21
249	0.22
250	0.21
251	0.24
252	0.21
253	0.23
254	0.21
255	0.3
256	0.29
257	0.31
258	0.33
259	0.3
260	0.29
261	0.28
262	0.26
263	0.17
264	0.16
265	0.14
266	0.12
267	0.09
268	0.1
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.1
274	0.1
275	0.11
276	0.14
277	0.16
278	0.2
279	0.24
280	0.25
281	0.29
282	0.36
283	0.36
284	0.37
285	0.38
286	0.33
287	0.3
288	0.29
289	0.24
290	0.17
291	0.15
292	0.12
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.1
302	0.15
303	0.21
304	0.26
305	0.31
306	0.35
307	0.41
308	0.46
309	0.52
310	0.51
311	0.51
312	0.51
313	0.52
314	0.47
315	0.45
316	0.41
317	0.38
318	0.38
319	0.37
320	0.33
321	0.31
322	0.31
323	0.27
324	0.26
325	0.22
326	0.2
327	0.17
328	0.15
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.06
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.13
354	0.2
355	0.27
356	0.36
357	0.44
358	0.53
359	0.59
360	0.62
361	0.65
362	0.67
363	0.68
364	0.68
365	0.72
366	0.73
367	0.76
368	0.82
369	0.84
370	0.84
371	0.83
372	0.81
373	0.74
374	0.73
375	0.72
376	0.72
377	0.65
378	0.59
379	0.55
380	0.5
381	0.47
382	0.37
383	0.3
384	0.19
385	0.17
386	0.15
387	0.15
388	0.14
389	0.13
390	0.16
391	0.19
392	0.2
393	0.27
394	0.26
395	0.24
396	0.26
397	0.26
398	0.24
399	0.23
400	0.24
401	0.16
402	0.15
403	0.15
404	0.13
405	0.11
406	0.11
407	0.09
408	0.07
409	0.06
410	0.07
411	0.1
412	0.11
413	0.12
414	0.13
415	0.15
416	0.19
417	0.24
418	0.29
419	0.31
420	0.33
421	0.36
422	0.43
423	0.44
424	0.43
425	0.45
426	0.43
427	0.4
428	0.4
429	0.36
430	0.3
431	0.27
432	0.25
433	0.18
434	0.15
435	0.12
436	0.1
437	0.09
438	0.05
439	0.05
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.04
445	0.05
446	0.06
447	0.08
448	0.1
449	0.1
450	0.12
451	0.13
452	0.19
453	0.25
454	0.3
455	0.33
456	0.34
457	0.42
458	0.46
459	0.48
460	0.45
461	0.4
462	0.38
463	0.4
464	0.41
465	0.42
466	0.41
467	0.43
468	0.41
469	0.42
470	0.39
471	0.33
472	0.29
473	0.24
474	0.21
475	0.2
476	0.19
477	0.17
478	0.15
479	0.15
480	0.16
481	0.15
482	0.13
483	0.09
484	0.1
485	0.16
486	0.21
487	0.24
488	0.22
489	0.23
490	0.26
491	0.26
492	0.27
493	0.23
494	0.21
495	0.2
496	0.23
497	0.22
498	0.19
499	0.19
500	0.18
501	0.16
502	0.12
503	0.1
504	0.07
505	0.06
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.05
520	0.1
521	0.11
522	0.13
523	0.13
524	0.13
525	0.15
526	0.18
527	0.24
528	0.22
529	0.23
530	0.23
531	0.25
532	0.27
533	0.26
534	0.22
535	0.16
536	0.19
537	0.2
538	0.23
539	0.25
540	0.31
541	0.36
542	0.4
543	0.44
544	0.44
545	0.51
546	0.54
547	0.56
548	0.55
549	0.5
550	0.5
551	0.5
552	0.47
553	0.37
554	0.3
555	0.26
556	0.26
557	0.27
558	0.24
559	0.23
560	0.22
561	0.21
562	0.23
563	0.23
564	0.19
565	0.18
566	0.18
567	0.18
568	0.19
569	0.22
570	0.19
571	0.17
572	0.17
573	0.17
574	0.17
575	0.14
576	0.12
577	0.13
578	0.14
579	0.2
580	0.23
581	0.28
582	0.28
583	0.33
584	0.37
585	0.4
586	0.42
587	0.36
588	0.34
589	0.3
590	0.29
591	0.26
592	0.22
593	0.16
594	0.13
595	0.13
596	0.11
597	0.1
598	0.09
599	0.09
600	0.1
601	0.11
602	0.11
603	0.12
604	0.11
605	0.14
606	0.15
607	0.13
608	0.12
609	0.11
610	0.12
611	0.11
612	0.13
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.12
618	0.11
619	0.12
620	0.1
621	0.13
622	0.13
623	0.15
624	0.15
625	0.14
626	0.14
627	0.13
628	0.13
629	0.12
630	0.12
631	0.13
632	0.12
633	0.12
634	0.15
635	0.16
636	0.16
637	0.14
638	0.15
639	0.14
640	0.18
641	0.2
642	0.17
643	0.16
644	0.16
645	0.17
646	0.16
647	0.14
648	0.1
649	0.09
650	0.09
651	0.08
652	0.1
653	0.13
654	0.14
655	0.15
656	0.15
657	0.16
658	0.18
659	0.18
660	0.16
661	0.19
662	0.22
663	0.26
664	0.34
665	0.33
666	0.33
667	0.34
668	0.34
669	0.28
670	0.26
671	0.3
672	0.26
673	0.3
674	0.32

A0A165JRB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer