Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165GAS6

Protein Details
Accession A0A165GAS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-146VSTISRRKRGTKKSATSRSRSHydrophilic
228-248LCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-146RRKRGTKKSATSRSRS
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9, cyto 6.5, mito 4, plas 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
Amino Acid Sequences MQQQFGDQASRQIGALQSGIALPGQQRSQGLQLPGQPMPTHVPQQYQTPQPQQPQQQQRNGLGGAQTDGADDAMEEWNAIVMRRNALGQHEQLGTVAIDRMIRRQIEDMGQRMEGGGLMLPLSERVSTISRRKRGTKKSATSRSRSGLRARSAQFQSSDPRELLPAVSELSIDANEPKIPQLDGGDDSDDGIKGEDFDEDAINSELDDSDDNIAEEDDEDESIGQIMLCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGVLTTGNRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.13
4 0.11
5 0.1
6 0.11
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.11
11 0.12
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.21
16 0.24
17 0.26
18 0.25
19 0.29
20 0.31
21 0.31
22 0.31
23 0.27
24 0.25
25 0.27
26 0.28
27 0.29
28 0.26
29 0.29
30 0.29
31 0.37
32 0.4
33 0.41
34 0.44
35 0.47
36 0.51
37 0.53
38 0.58
39 0.59
40 0.64
41 0.68
42 0.7
43 0.69
44 0.69
45 0.66
46 0.62
47 0.54
48 0.45
49 0.35
50 0.27
51 0.2
52 0.16
53 0.13
54 0.09
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.15
74 0.18
75 0.16
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.13
82 0.09
83 0.09
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.1
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.16
93 0.19
94 0.22
95 0.22
96 0.2
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.15
101 0.1
102 0.07
103 0.05
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.06
113 0.08
114 0.12
115 0.21
116 0.28
117 0.34
118 0.38
119 0.46
120 0.54
121 0.61
122 0.68
123 0.69
124 0.71
125 0.76
126 0.83
127 0.8
128 0.76
129 0.71
130 0.66
131 0.6
132 0.54
133 0.5
134 0.46
135 0.43
136 0.46
137 0.43
138 0.46
139 0.43
140 0.42
141 0.37
142 0.32
143 0.35
144 0.31
145 0.31
146 0.24
147 0.22
148 0.21
149 0.19
150 0.17
151 0.12
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.16
219 0.22
220 0.27
221 0.35
222 0.43
223 0.52
224 0.62
225 0.7
226 0.74
227 0.79
228 0.84
229 0.82
230 0.79
231 0.79
232 0.74
233 0.72
234 0.65
235 0.6
236 0.57