Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165JLN2

Protein Details
Accession A0A165JLN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71EYQGRKRKEFEDYVRRNRINHydrophilic
617-644DIERVEKQMPRKVKKRRKLDDDSYEEYMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
626-634PRKVKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 9.5, cyto_mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MEASRGPPRVKNKAAAPMQISAEQLLREAVDRQEPGVQVPTQRFADLEELHEYQGRKRKEFEDYVRRNRINMHNWMRYAQWELEQKEYRRARSIFERALDVDSTSVVLWIRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRIDKLWYKYVYMEEMLGNIAGTRQVFERWMTWEPDEAAWGAYIKLEKRYGEFDRARAIFERFTAVHPEPRNWIKWARFEEENGTSDLVREVFGIAIETLGEDFMDEKLFVAYARYEAKLKEYERSRAIFKYALDRLPRSKSVALHKAYTTFEKQFGDRDGVEDVILSKRRVQYEEQIKENPKNYDVWFDYARLEETLGNVDRVRDVYERAIAQIPPTQEKRHWRRYIYLWIFYALWEEMENKDIERARQVYQECIKLIPHKKFTFSKIWLMKAQFEIRHMQLQAARKTLGQAIGMCPKDKLFKGYIELELKLFEFVRCRTLYEKHIEWNPSNCQAWIKFSELERGLDDLERARAIFELAVNQEYLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYDRTRDLYERLLEKTDHVKVWISYAHFEINVPDPSEGEEEEEEEEEKPVSDEAKARARKVFERAYKSMKEKDLKEERVALLNAWKSFENTHGSPDDIERVEKQMPRKVKKRRKLDDDSYEEYMDYVFPADDESAAKMSKLLQMAHQWKQTQGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.6
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.26
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.36
42 0.39
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.7
55 0.68
56 0.67
57 0.64
58 0.64
59 0.63
60 0.6
61 0.61
62 0.61
63 0.54
64 0.47
65 0.44
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.34
70 0.41
71 0.47
72 0.47
73 0.52
74 0.56
75 0.54
76 0.54
77 0.53
78 0.5
79 0.52
80 0.59
81 0.55
82 0.51
83 0.5
84 0.43
85 0.45
86 0.39
87 0.3
88 0.21
89 0.15
90 0.14
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.11
101 0.13
102 0.18
103 0.2
104 0.22
105 0.25
106 0.26
107 0.34
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.16
153 0.2
154 0.22
155 0.21
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.21
160 0.17
161 0.14
162 0.11
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.19
172 0.25
173 0.28
174 0.35
175 0.36
176 0.34
177 0.39
178 0.39
179 0.38
180 0.34
181 0.33
182 0.24
183 0.22
184 0.24
185 0.17
186 0.19
187 0.23
188 0.22
189 0.27
190 0.28
191 0.29
192 0.31
193 0.34
194 0.36
195 0.32
196 0.38
197 0.35
198 0.41
199 0.44
200 0.43
201 0.4
202 0.39
203 0.41
204 0.38
205 0.35
206 0.28
207 0.24
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.16
242 0.2
243 0.21
244 0.26
245 0.28
246 0.32
247 0.35
248 0.37
249 0.36
250 0.31
251 0.33
252 0.28
253 0.25
254 0.27
255 0.27
256 0.29
257 0.29
258 0.3
259 0.32
260 0.34
261 0.35
262 0.32
263 0.31
264 0.31
265 0.36
266 0.42
267 0.39
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.28
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.18
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.43
301 0.44
302 0.45
303 0.47
304 0.39
305 0.3
306 0.28
307 0.25
308 0.26
309 0.24
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.57
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.08
362 0.07
363 0.09
364 0.09
365 0.07
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.15
370 0.17
371 0.17
372 0.22
373 0.23
374 0.26
375 0.28
376 0.3
377 0.26
378 0.25
379 0.25
380 0.28
381 0.34
382 0.34
383 0.39
384 0.37
385 0.42
386 0.45
387 0.48
388 0.48
389 0.45
390 0.48
391 0.44
392 0.46
393 0.45
394 0.43
395 0.4
396 0.36
397 0.37
398 0.29
399 0.27
400 0.27
401 0.24
402 0.27
403 0.25
404 0.23
405 0.22
406 0.28
407 0.29
408 0.28
409 0.27
410 0.23
411 0.24
412 0.24
413 0.22
414 0.16
415 0.14
416 0.15
417 0.21
418 0.22
419 0.21
420 0.19
421 0.19
422 0.22
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.25
429 0.29
430 0.28
431 0.28
432 0.24
433 0.22
434 0.2
435 0.17
436 0.15
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.17
441 0.16
442 0.18
443 0.21
444 0.24
445 0.29
446 0.32
447 0.33
448 0.33
449 0.38
450 0.4
451 0.39
452 0.4
453 0.39
454 0.37
455 0.36
456 0.32
457 0.3
458 0.27
459 0.29
460 0.26
461 0.25
462 0.24
463 0.24
464 0.3
465 0.28
466 0.29
467 0.25
468 0.23
469 0.21
470 0.18
471 0.18
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.08
491 0.07
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.12
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.16
516 0.21
517 0.24
518 0.26
519 0.28
520 0.28
521 0.29
522 0.34
523 0.32
524 0.28
525 0.26
526 0.26
527 0.24
528 0.26
529 0.27
530 0.22
531 0.2
532 0.21
533 0.21
534 0.18
535 0.18
536 0.18
537 0.19
538 0.19
539 0.19
540 0.17
541 0.16
542 0.18
543 0.2
544 0.17
545 0.15
546 0.13
547 0.13
548 0.14
549 0.14
550 0.13
551 0.12
552 0.12
553 0.1
554 0.1
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.11
559 0.15
560 0.19
561 0.29
562 0.33
563 0.35
564 0.39
565 0.43
566 0.45
567 0.49
568 0.54
569 0.53
570 0.57
571 0.61
572 0.63
573 0.66
574 0.67
575 0.67
576 0.66
577 0.65
578 0.59
579 0.64
580 0.67
581 0.65
582 0.63
583 0.61
584 0.54
585 0.53
586 0.5
587 0.41
588 0.37
589 0.37
590 0.34
591 0.29
592 0.28
593 0.24
594 0.24
595 0.27
596 0.28
597 0.24
598 0.28
599 0.27
600 0.28
601 0.28
602 0.29
603 0.3
604 0.24
605 0.26
606 0.23
607 0.25
608 0.3
609 0.33
610 0.37
611 0.4
612 0.49
613 0.56
614 0.64
615 0.71
616 0.77
617 0.83
618 0.87
619 0.9
620 0.9
621 0.9
622 0.91
623 0.9
624 0.87
625 0.83
626 0.76
627 0.66
628 0.55
629 0.45
630 0.35
631 0.24
632 0.17
633 0.11
634 0.07
635 0.06
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.1
640 0.12
641 0.14
642 0.14
643 0.14
644 0.13
645 0.15
646 0.19
647 0.21
648 0.2
649 0.23
650 0.33
651 0.41
652 0.47
653 0.52
654 0.49